| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 884917 | 126 (0.800) | 22 (0.160) | 9/160 | NT | 15.9% | intergenic (+12/+29) | mdfA/ybjH | multidrug efflux system protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 884930 | 119 (0.840) | intergenic (+25/+16) | mdfA/ybjH | multidrug efflux system protein/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACAT > NC_000913/884820‑885016 | aaCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAATATAAACAGATGGGAAATTATTACTAAGTGTAAAAAAATGCCTGA > 1:1658655‑M1/1‑96 (MQ=255) aaCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGc > 1:3831895/1‑100 (MQ=255) aaCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGc > 2:2740775/1‑100 (MQ=255) ccTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGCCTGACTGCtt < 1:860758/100‑1 (MQ=255) cTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCttt > 2:2792158/1‑100 (MQ=255) tCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGc < 2:4249752/100‑1 (MQ=255) cttatgttcgccatcttgccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGc < 1:334707‑M1/20‑1 (MQ=255) cAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg < 2:2096465/100‑1 (MQ=255) aCGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGa < 2:848591/99‑1 (MQ=255) aaTTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcagg > 1:3997345‑M2/1‑95 (MQ=255) agtttgtTGCTGTCGCTGATAGTTATTTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggc < 1:3799724‑M1/98‑20 (MQ=255) aagttGAGGCTGTCGAAGACGGTTACACTTAGAAAAGAAAAACAGATGTCAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCa < 1:4256896/94‑1 (MQ=255) aTTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggc < 2:3372895‑M1/100‑20 (MQ=255) gccatcttgccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACGGCTTTGTGCGATCAgg > 1:1436821‑M1/72‑98 (MQ=255) tgtgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattt < 2:3877405‑M1/100‑24 (MQ=255) gtgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATtct < 1:1508199/100‑1 (MQ=255) tgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattttt < 2:1382497‑M1/100‑26 (MQ=255) cttgccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATtctc > 2:1633942‑M1/67‑100 (MQ=255) cttgccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATtctc > 1:3370091‑M1/67‑100 (MQ=255) ttgccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCg > 2:2590551‑M1/66‑100 (MQ=255) ggCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttt < 2:3151449‑M1/100‑27 (MQ=255) ggCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttt < 2:3922493‑M1/100‑27 (MQ=255) cTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGaa > 2:2479829/1‑100 (MQ=255) cTGTCGCTGATGGTTATCTTTTGAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGTGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattttt < 1:1484617‑M1/97‑26 (MQ=255) ccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAAt > 1:3578894‑M1/63‑100 (MQ=255) ccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagatggacgcccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGaa > 1:1112812‑M1/63‑99 (MQ=255) gTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacc < 2:1224768‑M1/100‑31 (MQ=255) gTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacc < 1:2257415‑M1/100‑31 (MQ=255) gTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacc < 2:3848611‑M1/100‑31 (MQ=255) tCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacc < 1:2913032‑M1/99‑31 (MQ=255) cGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTaa < 1:2165518/100‑1 (MQ=255) gCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAAt < 2:3934369/100‑1 (MQ=255) gCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAAt < 2:3243486/100‑1 (MQ=255) cTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCGTTCTCGAATTAATg < 1:139051/100‑1 (MQ=255) cTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATg > 2:2036970/1‑100 (MQ=255) cTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATg < 1:1908013/100‑1 (MQ=255) atctgtttATCTTTTAAAAAGATAACCAGATGGGAAATTCTCACGAAGTGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAAt > 1:585587/7‑98 (MQ=38) atctgtttATCTTTTAAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATgg > 2:1754170/7‑100 (MQ=255) tctgtttATCTTTTAAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGt > 1:2663128/6‑100 (MQ=255) gATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGt < 2:2977982/100‑1 (MQ=255) aTGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTg > 1:2060247/1‑100 (MQ=255) tgtttATCTTTTAAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGa > 2:2371520/4‑100 (MQ=255) tGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGa > 2:4103702/1‑100 (MQ=255) tATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgt > 2:1714268/1‑100 (MQ=255) tATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgt < 2:1826804/100‑1 (MQ=255) tATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgt < 1:2509246/100‑1 (MQ=255) tCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGCAGTGAAAAAAAATGGCTGACAGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGTTGATGgtcg > 1:1711287/1‑100 (MQ=255) tCTTTGTAAAAGATAAACAGATGGTAAATTCTCTCGAGGGGTAAAAAAAGGCCTGACTGCTTTGTGCGATTAGGCATTCTCTAATTAATGGTGATGgtcg < 1:1900451/100‑1 (MQ=255) cTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgt > 1:1800535/1‑100 (MQ=255) tttttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTTTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgtc > 2:638891/1‑100 (MQ=255) tttttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgtc < 2:3192408/100‑1 (MQ=255) tttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCaa < 2:3467054/100‑1 (MQ=255) ttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAAt > 2:1109483/1‑100 (MQ=255) ttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCAATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAAt > 2:1405955/1‑100 (MQ=255) tAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATc > 2:105543/1‑100 (MQ=255) tAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATc < 2:568022/100‑1 (MQ=255) aaaaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCt < 1:916189/100‑1 (MQ=255) aGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgt < 2:4318324/100‑1 (MQ=255) gATAAACAGATGGGACATTCTCACGCAGGGTAACAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgtg < 2:2395836/100‑1 (MQ=255) gATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgtg < 2:3525924/100‑1 (MQ=255) aTAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgtgt < 1:846581/100‑1 (MQ=255) tAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGtt > 1:2377245/1‑100 (MQ=255) aaaCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTc < 2:757058/100‑1 (MQ=255) aaaCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTc < 2:4163379/100‑1 (MQ=255) aaCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCg > 2:1498375/1‑100 (MQ=255) ccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgtgt > 1:3424422‑M1/32‑96 (MQ=255) aCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGa > 2:2145143/1‑100 (MQ=255) gggAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCa < 1:3950418/100‑1 (MQ=255) gAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATc < 2:2521734/100‑1 (MQ=255) aaTTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATccc < 2:50317/100‑1 (MQ=255) aaTTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCATCAATCTGGTGTTCGATAACCATccc < 2:2686204/100‑1 (MQ=255) ttCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGATTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCtt < 1:1007268/100‑1 (MQ=255) tctcACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTc < 1:116856/100‑1 (MQ=255) ctcACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCa < 1:4358629/100‑1 (MQ=255) cACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCAcc < 2:913128/100‑1 (MQ=255) cGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCt < 1:769620/99‑1 (MQ=255) gAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcag < 2:3724485‑M2/100‑67 (MQ=255) aGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGc < 1:3197438/100‑1 (MQ=255) gggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCt > 2:1560261/1‑100 (MQ=255) ggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgac < 2:78146‑M2/100‑71 (MQ=255) ggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTg > 1:1255731/1‑100 (MQ=255) gTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgaca < 2:4398245‑M2/100‑72 (MQ=255) gTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTgg > 1:2952198/1‑100 (MQ=255) gTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTgg > 1:2010/1‑100 (MQ=255) aaaaagtcCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTGGATAACTATCCCTTGACCTAAGCTg < 1:2214896‑M1/88‑1 (MQ=255) aaaaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagcc < 2:1171917‑M2/100‑75 (MQ=255) aaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttactcttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccac < 1:160869‑M2/100‑77 (MQ=255) aaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccaca < 2:4054471‑M2/100‑78 (MQ=255) aaTGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaa < 1:1796929‑M1/100‑92 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcattttttttcttttttttagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccac < 1:156580‑M2/98‑77 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaagaagataaccatcagcgacagccacaa < 2:2163728‑M2/100‑79 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaa < 2:1894620‑M2/100‑79 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaa < 1:4083475‑M2/100‑79 (MQ=255) aTGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaa < 2:350819‑M1/100‑93 (MQ=255) ATGCCTGACTGCCTTGTGTGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATgg > 1:2758800‑M1/1‑100 (MQ=255) ccTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaatt > 2:3099333‑M1/1‑5 (MQ=255) cTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattc < 2:3081282‑M1/100‑97 (MQ=255) TGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAAc > 2:2877995‑M1/1‑100 (MQ=255) TGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAAc > 2:3717154‑M1/1‑100 (MQ=255) atcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattccgt < 2:240146‑M1/100‑100 (MQ=255) | TCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACAT > NC_000913/884820‑885016 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |