| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 884917 | 126 (0.800) | 22 (0.160) | 9/160 | NT | 15.9% | intergenic (+12/+29) | mdfA/ybjH | multidrug efflux system protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 884930 | 119 (0.840) | intergenic (+25/+16) | mdfA/ybjH | multidrug efflux system protein/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
AACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATGCGGGCG > NC_000913/884831‑885029 | aaCGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGa < 2:1965435/100‑1 (MQ=255) aCGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGa < 2:848591/99‑1 (MQ=255) aCGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAt < 2:240146‑M2/100‑2 (MQ=255) gAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcag < 2:3081282‑M2/100‑5 (MQ=255) aaTTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcagg > 1:3997345‑M2/1‑95 (MQ=255) cgccatcttgccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGc > 2:2042130‑M1/73‑100 (MQ=255) ccatcttgccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCAt > 2:2135748‑M1/71‑100 (MQ=255) ttGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatt < 1:1796929‑M2/100‑10 (MQ=255) catcttgccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCAtt > 1:839417‑M1/70‑100 (MQ=255) gtgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATtct < 1:1508199/100‑1 (MQ=255) ctcttccgatcTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATtct < 1:1579872/90‑1 (MQ=255) cttgccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATtctc > 1:3370091‑M1/67‑100 (MQ=255) cttgccagcgtaggtgaagggatggtcatcgaacaccacattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATtct > 1:1648510‑M1/67‑99 (MQ=255) ttgccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCg > 2:2590551‑M1/66‑100 (MQ=255) gCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGa > 1:50317/1‑100 (MQ=255) gccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGaa > 2:4219841‑M1/64‑100 (MQ=255) cTGTCGCGGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGGCTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGa < 1:3342015/99‑1 (MQ=255) cTGTCGCCGATGGTTATCTTTTTAAATGTTAAACAGATGGTAAATTCTTACGGTGGGTAAAAAAATGCATGACTGCTTTTTGCGATCAGGAATTCTAGaa > 1:1441996/1‑100 (MQ=255) ccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAAt > 1:3578894‑M1/63‑100 (MQ=255) ccagcgtaggtgaagggatggttatcgaacaccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAAt > 2:334708‑M1/63‑100 (MQ=255) tCGCTGATGATTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGAGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAAt < 1:4216220/98‑1 (MQ=255) cGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTaa < 1:2165518/100‑1 (MQ=255) cGCTGATGGTTAACTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTaa > 2:2899116/1‑100 (MQ=255) gCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAAt < 1:1849845/100‑1 (MQ=255) cTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCGTTCTCGAATTAATg < 1:139051/100‑1 (MQ=255) cTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATg < 1:1908013/100‑1 (MQ=255) cTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATg < 1:3871515/100‑1 (MQ=255) atctgtttATCTTTTAAAAAGATAACCAGATGGGAAATTCTCACGAAGTGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAAt > 1:585587/7‑98 (MQ=38) atctgtttATCTTTTAAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATgg > 2:1754170/7‑100 (MQ=255) gATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATgg > 2:142003/1‑99 (MQ=255) gATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGt < 2:2977982/100‑1 (MQ=255) tgtttATCTTTTAAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGa > 2:2371520/4‑100 (MQ=255) tGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGa > 2:4103702/1‑100 (MQ=255) ttATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATgg < 2:2784769/100‑1 (MQ=255) tATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgt < 2:1826804/100‑1 (MQ=255) tATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgt > 2:1714268/1‑100 (MQ=255) cTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgt > 1:1800535/1‑100 (MQ=255) cTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgt > 1:2604934/1‑100 (MQ=255) tttttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTTTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgtc > 2:638891/1‑100 (MQ=255) tttttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgtc < 2:3192408/100‑1 (MQ=255) tttttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgtc < 1:2479817/100‑1 (MQ=255) tttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAGGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCaa > 1:2882336/1‑100 (MQ=255) tttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCaa < 2:3467054/100‑1 (MQ=255) ttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAAt > 2:1109483/1‑100 (MQ=255) tAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATc < 2:568022/100‑1 (MQ=255) tAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATc > 2:105543/1‑100 (MQ=255) aaaaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCt > 1:1023375/1‑100 (MQ=255) aaaaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCt < 2:3479656/100‑1 (MQ=255) aaaaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCt < 1:916189/100‑1 (MQ=255) aGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgt > 2:2487134/1‑100 (MQ=255) aGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgt < 2:4318324/100‑1 (MQ=255) aGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgt > 2:699727/1‑100 (MQ=255) gATAAACAGATGGGACATTCTCACGCAGGGTAACAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgtg < 2:2395836/100‑1 (MQ=255) gATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgtg < 2:3525924/100‑1 (MQ=255) aaaCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTc < 2:4163379/100‑1 (MQ=255) aaaCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTc < 2:757058/100‑1 (MQ=255) aaaCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTc < 1:1137211/100‑1 (MQ=255) ccagattgacgaccatcaccattaattcgagAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgtgt > 1:3424422‑M1/32‑96 (MQ=255) aCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGa > 2:1553317/1‑100 (MQ=255) aCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGCCGTCAATCTGGTGTTCGa > 2:3951636/1‑100 (MQ=255) gctGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATaa > 1:2736341/3‑100 (MQ=255) gggAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCa > 2:958706/1‑100 (MQ=255) ggAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCAt < 2:2859926/100‑1 (MQ=255) ggAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCAt > 2:4056109/1‑100 (MQ=255) ggAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATATGGTGTTCGATAACCAt > 2:2531059/1‑100 (MQ=255) aaaTTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATcc < 1:2430654/100‑1 (MQ=255) aaTTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATccc < 2:50317/100‑1 (MQ=255) aaTTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCATCAATCTGGTGTTCGATAACCATccc < 2:2686204/100‑1 (MQ=255) ttCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGATTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCtt < 1:1007268/100‑1 (MQ=255) tctcACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTc < 1:116856/100‑1 (MQ=255) ctcACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCa < 1:4275685/100‑1 (MQ=255) cACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCAcc > 2:1648712/1‑100 (MQ=255) cGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCt < 1:769620/99‑1 (MQ=255) gggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCt > 2:1560261/1‑100 (MQ=255) gggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCt < 2:3204782/100‑1 (MQ=255) ggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgac < 2:1224768‑M2/100‑71 (MQ=255) ggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgac < 1:2257415‑M2/100‑71 (MQ=255) ggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcga < 1:2913032‑M2/99‑70 (MQ=255) ggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTg > 1:1255731/1‑100 (MQ=255) gTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgaca < 2:4398245‑M2/100‑72 (MQ=255) gTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTgg > 1:2010/1‑100 (MQ=255) tAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGc < 1:306753/100‑1 (MQ=255) aaaaagtcCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTGGATAACTATCCCTTGACCTAAGCTg < 1:2214896‑M1/88‑1 (MQ=255) aaaaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagcc < 2:3922493‑M2/100‑75 (MQ=255) aaaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagcca < 2:1382497‑M2/100‑76 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaagaagataaccatcagcgacagccacaa < 2:2163728‑M2/100‑79 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaa < 2:1894620‑M2/100‑79 (MQ=255) AATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATg < 1:853078‑M1/100‑1 (MQ=255) ttccTGACTGCTTTGTGCGATCATGCGTTCTCGAAGTAATGGTGATGCTCGTCAATCTGGTGTTCGAGAACCATCCCTTCACCTACTCTGGCAAGATGGc < 1:2081008/98‑1 (MQ=255) TGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGc > 1:142002‑M1/1‑100 (MQ=255) TGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCAGTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGc > 2:3837331‑M1/1‑100 (MQ=255) CCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGTATTTATTGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACGATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGa > 2:3114974‑M1/1‑100 (MQ=255) CTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGaa < 1:637915‑M1/100‑1 (MQ=255) TGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAAc > 2:3717154‑M1/1‑100 (MQ=255) cTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATa > 2:2243313/1‑100 (MQ=255) gCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAg < 2:1173927/100‑1 (MQ=255) gtgCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATgc > 2:3820287/1‑100 (MQ=255) tgCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATgcg < 1:1714262/100‑1 (MQ=255) gCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATgcgg > 1:3475063/1‑100 (MQ=255) aTCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATgcgggcg > 2:3875834/1‑100 (MQ=255) | AACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACATAAGGATGCGGGCG > NC_000913/884831‑885029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |