| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2154593 = | 112 (0.710) | 20 (0.140) | 11/162 | NT | 17.3% | coding (578/1248 nt) | mdtA | multidrug efflux system, subunit A |
| ? | NC_000913 | 2154624 = | 89 (0.620) | coding (609/1248 nt) | mdtA | multidrug efflux system, subunit A | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GCTGGTCAGTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGCATCCTATCGATT > NC_000913/2154525‑2154721 | cgatcccggtggtatcaccactggagatttggttaccaacatcaacctgcttgagaccaacgcgaccaTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGAt > 1:1359158‑M1/69‑100 (MQ=255)cgatcccggtggtatcaccactggagatttggttaccaacatcaacctgcttgagaccaacgcgaccaTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGAt > 1:74689‑M1/69‑100 (MQ=255) gatcccggtggtatcaccactggagatttggttaccaacatcaacctgcttgagaccaacgcgaccaTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATg > 2:3813888‑M1/68‑100 (MQ=255) gatcccggtggtatcaccactggagatttggttaccaacatcaacctgcttgagaccaacgcgaccaTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATg > 1:4355789‑M1/68‑100 (MQ=255) cTGGTCAGTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATg > 1:3350522/1‑100 (MQ=255) gTCAGTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTc > 1:1426280/1‑100 (MQ=255) gTCAGTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTc < 1:2594239/100‑1 (MQ=255) ccggtggtatcaccactggagatttggttaccaacatcaacctgcttgagaccaacgcgaccaTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTcg > 1:3846375‑M1/64‑100 (MQ=255) cAGTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTcgc < 2:94426/100‑1 (MQ=255) cAGTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACCGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTcgc > 1:2858616/1‑100 (MQ=255) aGTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTcgcg < 2:1627815/100‑1 (MQ=255) gTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTcgcg > 2:2868842/1‑99 (MQ=255) gTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGt > 2:1850371/1‑100 (MQ=255) gTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGt > 1:4190498/1‑100 (MQ=255) aCCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGtc < 1:1137746/100‑1 (MQ=255) cGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGtctc < 2:2098070/100‑1 (MQ=255) gAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCa > 2:2383564/1‑100 (MQ=255) cactggagatttggttacccacatcaacctgcttgagaccaacgcgatcaTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAg > 1:2066100‑M1/51‑100 (MQ=255) aGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAg < 2:3264304/100‑1 (MQ=255) ggCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGc < 2:1438439/100‑1 (MQ=255) ggCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGc > 1:1626620/1‑100 (MQ=255) gtaCCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCa < 1:3967369/98‑1 (MQ=255) gCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCa < 1:3750940/100‑1 (MQ=255) aCCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAgg < 1:1569534/100‑1 (MQ=255) aCCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAgg > 2:615771/1‑100 (MQ=255) ccATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGt < 1:1609680/100‑1 (MQ=255) tttggttaccaacatcaacctgcttgagaccaacgcgaccatcgactggagccggattaccgcaccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGAt < 1:3491144‑M2/28‑1 (MQ=255) tAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGa > 2:3259209/1‑99 (MQ=255) aaGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATg < 2:3501137/100‑1 (MQ=255) aGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGt < 2:1517683/100‑1 (MQ=255) ggCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGtt > 2:168879/1‑100 (MQ=255) ggCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGtt > 1:396734/1‑100 (MQ=255) gCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGACGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTg > 1:1244087/1‑100 (MQ=255) cTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTgg > 2:604137/1‑100 (MQ=255) ccaacatcaacctgcttgagaccaacgcgacaatcgactggtgcggtaatccggctccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTaa > 2:1152290‑M2/65‑100 (MQ=255) tgaAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAAc > 2:4358717/1‑100 (MQ=255) gaAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGTTTGATGTTGGTAAcc < 2:3951702/100‑1 (MQ=255) aagcaagcGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCCCCAGCCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCa > 1:1836679/1‑100 (MQ=255) aagcaagcGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCa > 1:983891/1‑100 (MQ=255) atcaacctgcttgagaccaacgcgaccaTCGACTGGTGCGGTAATCCGGCTCCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCaaa < 1:3491144‑M1/72‑1 (MQ=255) aagcGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAAtc > 2:1338783/1‑100 (MQ=255) aagcGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAAtc < 2:903238/100‑1 (MQ=255) aagcGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAAtc < 2:3656856/100‑1 (MQ=255) cGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTcc > 2:3910538/1‑100 (MQ=255) cGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTcc < 2:2477261/100‑1 (MQ=255) cGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTcc < 1:3997841/100‑1 (MQ=255) tGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATTGTCGCGTTGGTCTCAAACAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAgt < 2:2070490/100‑1 (MQ=255) cAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGT > 2:2439097‑M1/1‑100 (MQ=255) aGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTG < 2:832850‑M1/100‑1 (MQ=255) aGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTG < 2:3875887‑M1/100‑1 (MQ=255) aGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTAAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTG < 1:1023486‑M1/100‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGA < 1:1954032‑M1/100‑1 (MQ=255) cgcAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATac > 1:2452304/1‑100 (MQ=255) aGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATaccac > 2:2320729/1‑100 (MQ=255) cTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCg > 1:47797/1‑100 (MQ=255) tGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCgg < 1:4259651/100‑1 (MQ=255) gCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCggg > 2:2170804/1‑100 (MQ=255) gCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCggg < 1:2081988/100‑1 (MQ=255) gCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCggg < 2:3903273/100‑1 (MQ=255) gCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGATGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTAGTAAGCAAATCTCCAGTGGTGATAGCACCggg > 2:2171073/1‑100 (MQ=255) ccatcgactggtgcggtaatccggctccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGAt > 2:4403757‑M2/35‑100 (MQ=255) aaCTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGAt < 2:1553348/100‑1 (MQ=255) catcgactggtgcggtaatccggctccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATc > 1:4355789‑M2/34‑100 (MQ=255) cTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCg < 2:840889/100‑1 (MQ=255) cTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCg < 1:627369/100‑1 (MQ=255) cTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCg > 1:3898367/1‑100 (MQ=255) cTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGGTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCg < 1:2027104/100‑1 (MQ=255) atcgactggtgcggtaatccggctccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCg > 1:1359158‑M2/33‑100 (MQ=255) gactggtgcggtaatccggctccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGGTGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCgtgg > 2:2627206‑M2/30‑100 (MQ=255) gactggtgcggtaatccggctccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCgtgg > 2:200558‑M2/30‑100 (MQ=255) gactggtgcggtaatccggctccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCgtgg > 2:4346644‑M2/30‑100 (MQ=255) gactggtgcggtaatccggctccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCgtgg > 1:3454588‑M2/30‑100 (MQ=255) GACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCgtgg > 1:1856755‑M1/1‑100 (MQ=255) GACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCgtgg > 1:2071803‑M1/1‑100 (MQ=255) GACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCgtgg < 1:49909‑M1/100‑1 (MQ=255) actggtgcggtaatccggctccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCgtggt > 1:279047‑M2/29‑100 (MQ=255) tGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATcaccacgatcccggtggta < 2:3747014‑M1/100‑20 (MQ=255) GGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGAt < 1:751962‑M1/100‑1 (MQ=255) aGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATcaccacgatcccggtggtatca < 2:3398840‑M1/100‑23 (MQ=255) cGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCAccc < 2:1214839/100‑1 (MQ=255) cGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCAccc > 1:1910019/1‑100 (MQ=255) ggATTACCGCAGCAGGCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATcaccacgatcccggtggtatcaccac < 1:3529621‑M1/100‑27 (MQ=255) gATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATcaccacgatcccggtggtatcaccatt < 2:2989507‑M1/100‑28 (MQ=255) gATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATcaccacgatcccggtggtatcaccact < 2:1284243‑M1/100‑28 (MQ=255) gATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAg > 2:3822110/1‑100 (MQ=255) aTTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATcaccacgatcccggtggtatcaccact < 1:2512477‑M1/99‑28 (MQ=255) ttACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCACGCAGGTTGATATTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATcaccacgatcccggtggtatcaccactgg < 1:715778‑M1/100‑30 (MQ=255) ttACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGAc < 2:1991617/100‑1 (MQ=255) tACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACg > 2:643867/1‑100 (MQ=255) aCCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGc > 2:1370538/1‑100 (MQ=255) cGCACCAGTCGAGGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGGGGTGATcaccacgatcccggtggtatcaccactggag < 1:2345338‑M1/98‑32 (MQ=255) gCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGCATc > 2:3323794/1‑100 (MQ=255) cACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGCATcc < 1:498209/100‑1 (MQ=255) ccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGCATCCTa < 2:2850133‑M2/92‑1 (MQ=255) ccagtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGCATCCTa > 2:386955‑M2/9‑100 (MQ=255) agtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGCATCCTATc < 1:3336612‑M2/94‑1 (MQ=255) gtcgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGCATCCTATCg < 1:2592524‑M2/95‑1 (MQ=255) cgaTGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGCATCCTATCg < 1:4268891‑M2/95‑1 (MQ=255) cGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATcaccacgatcccggtggtatcaccactggagatttggttacc < 2:4159899‑M1/100‑43 (MQ=255) gaTGGTCGTGTTGGTCGCAAGCAGGGTGATGTGCGTAACCAAATCTCCAGGGGTTATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGCATCCTATCGAtt < 1:2124486‑M2/98‑1 (MQ=255) | GCTGGTCAGTGAAACCGAAGGCACCATTAAGGCTGATGAAGCAAGCGTTGCCAGCGCGCAGCTGCAACTCGACTGGAGCCGGATTACCGCACCAGTCGATGGTCGCGTTGGTCTCAAGCAGGTTGATGTTGGTAACCAAATCTCCAGTGGTGATACCACCGGGATCGTGGTGATCACCCAGACGCATCCTATCGATT > NC_000913/2154525‑2154721 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |