| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3392342 | NA (NA) | 29 (0.200) +CTACAAACG |
8/160 | NT | NA | noncoding (267/308 nt) | REP245 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 7 REP sequences | REP245 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 7 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3392393 | NA (NA) | intergenic (‑365/+65) | tldD/yhdP | putative peptidase/DUF3971‑AsmA2 domains protein | |||||
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
GTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCAACA > NC_000913/3392294‑3392492 | gTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTc < 1:414967/100‑1 (MQ=38) gaTGTTCCGTTCGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCt < 1:225906/98‑1 (MQ=255) aTGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTgg < 2:753085/100‑1 (MQ=255) ttCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCCGGCAACGACTGCCGGCTCCGGCGTGAACGCCCTATCCGCCCCACGGTTATGTTCTGGCTc > 1:427191/1‑100 (MQ=14) tCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCt > 1:2073175/1‑98 (MQ=255) tCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCg > 1:3929620/1‑100 (MQ=255) tCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCg > 2:4217466/1‑100 (MQ=255) tttGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTgg < 2:2746636/100‑1 (MQ=255) ttGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAATGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGc < 1:2917139/100‑1 (MQ=255) ttGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACTCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGTTCGCTGGc > 1:1879252/1‑100 (MQ=255) ttGGAGGCCTGATAAGACGAACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGGCCTACGGTTATGTTGTGGCGCGTTgg > 1:1291967/1‑99 (MQ=14) tGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGcc < 2:1444249/100‑1 (MQ=255) gTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGGCTCGTTgccta > 1:2090809/1‑96 (MQ=255) tAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCtt > 2:1326957/1‑100 (MQ=255) ggCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑Tg < 1:3178146/100‑1 (MQ=255) gcctgatAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTggctcgttgccaaaggc > 1:376583‑M2/8‑92 (MQ=255) gcctgatAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑Tgg > 2:2025038‑M2/8‑100 (MQ=255) cgtgatAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGc > 2:2986607‑M2/7‑100 (MQ=255) cctgatAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTccggctctaggcc > 1:1089025‑M2/7‑87 (MQ=255) cctgatAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGc < 2:2813112‑M2/94‑1 (MQ=255) tgatAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCaa > 2:3987682‑M2/5‑100 (MQ=255) atAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACg < 2:3854366‑M2/98‑1 (MQ=255) aaGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGAt > 2:2235882/1‑100 (MQ=255) aaGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGAt < 2:3733438/100‑1 (MQ=255) gACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTa > 1:2706512/1‑100 (MQ=255) cGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTAtn < 2:3910144/100‑2 (MQ=255) cGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATc > 1:2859639/1‑100 (MQ=255) gCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGTTC‑TTGGCCTTATAGCAACGAttgcg > 1:4073304/1‑96 (MQ=14) gCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATcc < 2:1929156/100‑1 (MQ=255) cacaGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCt > 2:3065614/1‑100 (MQ=255) cacaGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCt < 1:2155768/100‑1 (MQ=255) acaGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCCGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTa < 2:651048/100‑1 (MQ=255) caGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTAt > 2:2617942/1‑100 (MQ=255) caGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTAt < 1:1573278/100‑1 (MQ=255) aGCGTCGCATCTGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATg < 2:1696372/100‑1 (MQ=255) aGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATg < 1:3437706/100‑1 (MQ=255) aGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATg < 2:3621320/100‑1 (MQ=255) gCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATga < 2:1074501/100‑1 (MQ=255) gTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATgaga > 2:2495710/1‑100 (MQ=255) gCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTg > 1:819314/1‑100 (MQ=255) gCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATATTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTg > 1:2810141/1‑100 (MQ=255) gCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCcgtttgtaggcctgatgcgacgctgtgcgtcttatcaggc > 1:1186652‑M2/1‑60 (MQ=255) gCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCcgtttgtaggcctgatgcgacgctgtgcgtcttatcaggc > 2:442712‑M2/1‑60 (MQ=255) cATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCcgtttgtaggcctgatgcgacgctgtgcgtcttatcaggcc > 1:2125132‑M2/1‑59 (MQ=255) cATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGGCCTACGGTTATGGTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTgg > 1:2467830/1‑100 (MQ=255) cATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTgg > 2:165754/1‑100 (MQ=255) cATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCcgtttgtaggcctgatgcgacgctgtgcgtcttatcaggcc > 2:2614132‑M2/1‑59 (MQ=255) cATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCcgtttgtaggcctgatgcgacgctgtgcgtcttatcaggcc > 1:1037704‑M2/1‑59 (MQ=255) aTCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTggg < 2:951071/100‑1 (MQ=255) aTCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCcgtttgtaggcctgatgcgacgctgtgcgtcttatcaggcct > 2:288021‑M2/1‑58 (MQ=255) cAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGc > 2:4042400/1‑100 (MQ=255) ggCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCaa > 2:3277907/1‑100 (MQ=255) cAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGGTATGTTCcgtttgtaggcctgatgcgacgctgtgcgtcttatcaggcctacaaac > 1:449436‑M2/1‑52 (MQ=255) aCGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGTCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTAc < 2:4177390/100‑1 (MQ=255) ccgttGCCTGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTAcg > 2:2107792/5‑100 (MQ=255) cGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTAcg < 1:4315345/100‑1 (MQ=255) gCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTAcgcg < 2:2369799/100‑1 (MQ=255) cTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACgcgc < 1:3125468/100‑1 (MQ=255) gCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGccc < 1:2941753/100‑1 (MQ=255) gCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGccc > 2:3451739/1‑100 (MQ=255) cGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTc > 2:3704450/1‑100 (MQ=255) ggATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCg < 1:1769774/100‑1 (MQ=255) gATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGt < 2:2915279/100‑1 (MQ=255) tGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCa > 1:2228808/1‑100 (MQ=255) gcgTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATc < 1:1109602/100‑1 (MQ=255) gcgTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATc < 1:368018/100‑1 (MQ=255) cgTGAACGCCCTCTCCGACCAACGGATATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCCCGTCAAATc > 1:3688041/1‑99 (MQ=255) cgTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCa < 2:1364438/100‑1 (MQ=255) gAACGCCCTATCCGACCTGCGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTCTCCGATGAGATTGGGGCAATTACGCGACCTCGTCAAATCATTg < 1:1700602/100‑1 (MQ=255) gAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTg > 2:2134276/1‑100 (MQ=255) aaCGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTgc > 2:81715/1‑100 (MQ=255) cGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTgcgc > 2:1543537/1‑100 (MQ=255) cGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTgcgc < 2:3546582/100‑1 (MQ=255) cGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCGCGTCAAATCATTgcgc > 2:537692/1‑100 (MQ=255) gCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCt > 2:1992378/1‑100 (MQ=255) cccTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCtt > 1:2987696/1‑100 (MQ=255) cccTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCtt < 1:2280808/100‑1 (MQ=255) cccTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGGCAAATCATTGCGCtt > 2:4328129/1‑100 (MQ=255) cccTATCCGACCTACGGTTATGTTCTCGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCtt > 2:2673538/1‑100 (MQ=255) ccTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCttt > 2:3128757/1‑100 (MQ=255) tATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCttttt > 1:1384975/1‑100 (MQ=255) aTCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTc < 1:2986331/100‑1 (MQ=255) gagcTACGGTTATGTTCGGGCTCGTGGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCtt < 1:2768015/95‑1 (MQ=255) tACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTAcgcg > 2:1569097/1‑100 (MQ=255) aCGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCgg < 2:591347/100‑1 (MQ=255) cGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCCAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGt > 1:613944/1‑100 (MQ=255) cGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGt > 2:2194513/1‑100 (MQ=255) cGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGt < 2:1793374/100‑1 (MQ=255) gTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGtt > 1:2546640/1‑99 (MQ=255) ttATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTTGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTgg < 1:32658/100‑1 (MQ=255) ttATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTgg < 1:3821252/100‑1 (MQ=255) ttATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTgg < 1:3320570/100‑1 (MQ=255) tATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGgc < 2:2307956/100‑1 (MQ=255) aTGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGgcg < 1:3594851/100‑1 (MQ=255) aTGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGgcg < 1:781920/100‑1 (MQ=255) tGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGgcgc < 1:4184714/100‑1 (MQ=255) gTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCa < 2:1220610/100‑1 (MQ=255) gTTCTGGCACGTTGGCCTT‑TGGGAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTAAGCGCCCTCGTCACATCATTGCGCTTTTTCTTTACGGGGTTGgcgc > 1:471157/1‑99 (MQ=255) tCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCAac < 1:969418/100‑1 (MQ=255) cTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCAaca < 1:1959586/100‑1 (MQ=255) | GTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTT‑TGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAATCATTGCGCTTTTTCTTTACGCGGTTGGCGCAACA > NC_000913/3392294‑3392492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |