| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 116 (0.820) | 76/170 | NT | 100% | intergenic (+253/‑1684) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+1453/‑484) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1299396‑1299498‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ct‑aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAG > NC_000913/1300698‑1300796 CTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGC < 1:3467602/100‑1 CACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATCCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑A < 2:2212805/100‑1 CCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAA < 2:2907104/100‑1 CATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAAT > 1:1790084/1‑100 TCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAA > 2:709842/1‑100 CATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAAT < 2:3348022/100‑1 ATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATA < 1:2507157/100‑1 TGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAAATAATA > 1:1037386/1‑100 TGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAA < 1:445239/100‑1 TGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAA > 2:2877438/1‑100 GTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAAT > 1:1265255/1‑100 GTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAAT > 1:1377532/1‑100 TTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATC < 1:3227910/100‑1 TTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATC < 2:330607/100‑1 TATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCA < 2:236659/100‑1 ATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAA > 2:1274852/1‑100 TTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAAT > 2:2250227/1‑100 TTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATT > 1:1553881/1‑100 CGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTT < 2:4065574/100‑1 CGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTT > 1:989948/1‑100 GCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTA > 1:230782/1‑100 CACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAA > 2:2080449/1‑100 ACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAAT < 2:1650252/100‑1 CATCATAATCCTGTGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAAT < 2:2494654/99‑1 CATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATT > 1:3842811/1‑100 CATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATT < 1:3717819/100‑1 ATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTG < 1:586663/100‑1 ATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGC < 2:2787594/100‑1 ATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGC < 1:3747385/100‑1 ttcttgtCTTGCTGAAGAATAATTAAAATGATATTATTAATTCCACTGTCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTG < 2:2618716/91‑1 TCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCA < 2:451890/100‑1 TCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCA < 1:3554816/100‑1 TCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGC < 2:4138049/99‑1 CTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATT > 2:80944/1‑100 GGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTC > 2:62577/1‑100 GCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCAC > 2:2691700/1‑100 GCTTGCTGAAGAATAATTGAAAAGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGATGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCAC < 2:3963230/100‑1 TGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGG > 1:923889/1‑100 AGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGGAC > 2:3718961/1‑100 AGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAC < 1:2218646/100‑1 AGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAC < 2:362224/100‑1 GAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACT > 1:1718982/1‑100 AATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTG < 2:3440752/100‑1 ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTATAGTAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATAATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAA > 2:2498476/1‑99 ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > 2:2835597/1‑100 ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT < 1:2815775/100‑1 TTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATC < 1:3348599/100‑1 TGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCA < 2:1281850/100‑1 ATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAA < 1:2165730/100‑1 TGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAA < 1:2766715/100‑1 TATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT > 2:1098774/1‑100 ATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATA < 2:4159567/100‑1 ATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATA < 1:3484178/100‑1 TTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAG > 1:977140/1‑100 TATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGA < 1:1076211/100‑1 TATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGA > 1:1688301/1‑100 TATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGA > 1:515621/1‑100 TATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGAT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGn < 2:1792844/100‑2 ATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGAC > 1:1775716/1‑100 TAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACAT > 2:448061/1‑100 ATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGC < 1:1990007/100‑1 TCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTT < 1:2999326/100‑1 CCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTA > 2:582452/1‑100 CACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAG < 2:1646466/100‑1 CACTGCCTTTGGGAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATTAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAG < 2:2198781/100‑1 ACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGC < 1:2506639/100‑1 ACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGC < 1:1083715/100‑1 nCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAA > 2:1773322/2‑100 CCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAAT > 2:2296494/1‑100 CTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATC < 2:3686150/100‑1 CTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCAATACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATCTACATGCTTAGCCAATC > 2:3830278/1‑100 CTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATAAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATC < 2:1588077/100‑1 TTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCT > 1:625675/1‑100 TGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCT < 1:2296499/100‑1 TGGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCT > 1:307996/1‑100 GGTAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTA > 2:2806582/1‑100 TAGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATT < 1:964367/100‑1 AGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTGACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTT < 2:1684350/100‑1 AGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTT > 1:1271020/1‑100 AGAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTT > 1:987718/1‑100 GAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTG > 1:4141197/1‑100 GAGGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTAACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTT < 2:1047162/99‑1 ttccgatctT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGAT < 1:1686306/91‑1 GGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGAT < 2:132425/100‑1 GGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGAT < 2:3933288/100‑1 GGAAAGTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGAT > 1:809318/1‑100 GTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAAT < 2:154174/100‑1 GTGCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAAT < 2:2101934/100‑1 ctT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAAT < 1:1508356/96‑1 GCT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGTTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTG > 1:192022/1‑100 CT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGA < 2:3858947/100‑1 CT‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGA > 1:3405333/1‑100 T‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATATACATGCTTCGCCAATGTCTATTTGATTGAA > 2:3271008/1‑95 T‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATagatcggaa > 2:1686302/1‑91 T‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAA > 2:1615114/1‑100 T‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAA > 1:3987589/1‑100 T‑AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATAGA > 2:1508353/1‑99 AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAA < 1:1132424/100‑1 AAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGAT < 2:3640181/90‑1 AATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAG < 1:4181427/100‑1 CTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCT‑AA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1299396‑1299498‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ct‑aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAG > NC_000913/1300698‑1300796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |