| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4421 | 125 (0.840) | 25 (0.180) | 14/168 | NT | 16.8% | coding (688/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase |
| ? | NC_000913 | = 4450 | 130 (0.920) | coding (717/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase | |||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
TTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCG > NC_000913/4323‑4520 | ttGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGt < 1:658285/100‑1 (MQ=255) tgatgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGtt > 2:3458065/1‑100 (MQ=255) tgatgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGtt > 2:496176/1‑100 (MQ=255) tgatgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGtt > 2:3494086/1‑100 (MQ=255) atgctgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTAGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGGAGATTTGCTACTAATTTGAAGCTGTTgc > 2:31539/1‑100 (MQ=255) tgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCTTTTGCTGGTGAAGATTTGCTACTACTTTAAAGCTGTTgcg > 2:1214435/1‑100 (MQ=255) tgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTgcg > 1:3580583/1‑100 (MQ=255) tgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTgcg > 2:2660124/1‑100 (MQ=255) tgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGATAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTgcg > 2:2580982/1‑100 (MQ=255) atgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCa < 2:3943983/100‑1 (MQ=255) atgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCa < 1:3547953/100‑1 (MQ=255) tgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAg > 2:2487497/1‑100 (MQ=255) tgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAg > 1:2601314/1‑100 (MQ=255) gaagaaCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGc < 1:1451575/100‑1 (MQ=255) gaagaaCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACGCGGCTAACTCGATTTACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGc < 2:3923669/100‑1 (MQ=255) nagaaCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCt > 2:4044129/2‑100 (MQ=255) aagaaCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCt > 1:487805/1‑100 (MQ=255) aagaaCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACAGCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCt < 1:1223264/100‑1 (MQ=255) gaaCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGc < 1:1577759/100‑1 (MQ=255) aCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCg > 2:2000508/1‑100 (MQ=255) aCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCg > 2:3734183/1‑100 (MQ=255) cTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGGTTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGc > 2:1892078/1‑97 (MQ=255) aaGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGga > 1:4072424/1‑100 (MQ=255) aGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGgag > 1:665757/1‑100 (MQ=255) gTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGgaga < 1:824029/100‑1 (MQ=255) gcgcTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGAcgc > 1:1348545/1‑100 (MQ=255) cgcTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGAcgcg > 2:1278301/1‑100 (MQ=255) cTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgc < 2:1859080‑M1/100‑28 (MQ=255) aGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaac < 2:348401‑M1/100‑30 (MQ=255) aGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAAc < 2:1062059/100‑1 (MQ=255) aGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAAc > 1:2553872/1‑100 (MQ=255) gggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaaca < 2:307009‑M1/100‑31 (MQ=255) gggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACc > 1:3149063‑M2/1‑99 (MQ=255) gggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACc > 2:4072397‑M2/1‑99 (MQ=255) gggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACc > 1:148665‑M2/1‑99 (MQ=255) gggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACc < 1:597611‑M2/100‑2 (MQ=255) ggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacag < 2:1195636‑M1/100‑32 (MQ=255) ggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACca < 1:3351019‑M2/100‑3 (MQ=255) ggTTAAACTCGGCTAACTAGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGAGTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACca < 2:1315264‑M2/100‑3 (MQ=255) gTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacag < 1:3561332‑M1/100‑33 (MQ=255) gTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcag < 1:2062611‑M2/100‑4 (MQ=255) tAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagctt < 1:1441584‑M1/100‑35 (MQ=255) tAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagct < 1:89617‑M1/100‑35 (MQ=255) aaaCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagct > 2:278958‑M2/1‑94 (MQ=255) aaaCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGC‑Ggttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttc < 1:2927257‑M1/100‑37 (MQ=255) aaCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTgg > 1:3009447/1‑100 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttca < 2:1195357‑M1/100‑38 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGt < 1:2099796/100‑1 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGt < 1:2286518/100‑1 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGt < 1:3324799/100‑1 (MQ=255) cTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaa < 1:470494‑M1/100‑39 (MQ=255) cGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaag < 1:906961‑M1/100‑41 (MQ=255) cGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTg < 1:1748133/99‑1 (MQ=255) ggCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGtc < 1:1825656/100‑1 (MQ=255) gCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGtct > 1:2811018/1‑100 (MQ=255) aaCTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCgg < 1:3950690/100‑1 (MQ=255) aCTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGt > 1:2236589/1‑100 (MQ=255) cTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTg < 1:1899476/100‑1 (MQ=255) tCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagca < 1:2025667‑M1/100‑49 (MQ=255) tCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGc < 1:596325/100‑1 (MQ=255) gATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCa < 1:1515267/100‑1 (MQ=255) gATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCa < 2:2382782/100‑1 (MQ=255) ttAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAg > 1:2393344/1‑100 (MQ=255) tAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGc < 1:3936883/100‑1 (MQ=255) aaCATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCg < 1:71714/100‑1 (MQ=255) cATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGa > 2:1589159/1‑100 (MQ=255) ttCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTAGCTACTACTTTGAGGCTGTGGCGCAGCTGCCGCAGGAGGCGGGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCgg < 2:419549/97‑1 (MQ=255) tCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTTCTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGaaa > 2:2113962/1‑100 (MQ=255) tCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTTCTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAAGcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgcc < 1:2112700‑M2/100‑30 (MQ=255) tCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCGCACCGGaaa > 2:2535545/1‑100 (MQ=255) gCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACtt > 2:1719880/1‑100 (MQ=255) gCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACtt > 1:3828144/1‑100 (MQ=255) gTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCgg > 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actTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGc > 2:580095/1‑100 (MQ=255) actTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGc > 1:3471970/1‑100 (MQ=255) ctTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGc > 2:2779329/1‑99 (MQ=255) ctTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGCAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCCCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGACTTGCCGGCGGGTCTGCTGGc > 2:3553477/1‑99 (MQ=255) ttGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGaa < 1:2487503/100‑1 (MQ=255) gAAGCTGTTGCGCAGTTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagttt < 1:3404222‑M2/100‑65 (MQ=255) gAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtt < 2:1708007‑M2/100‑65 (MQ=255) gAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGaa > 2:174545/1‑98 (MQ=255) aaGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagttta < 1:3254762‑M2/100‑66 (MQ=255) aGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcacacggctgatgttaatcgagttagctgagttta < 2:2161907‑M2/100‑67 (MQ=255) aGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagttta < 1:1595698‑M2/100‑67 (MQ=255) aGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagttta < 2:1288495‑M2/100‑67 (MQ=255) gCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaa > 1:1709546‑M1/1‑4 (MQ=255) gCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggcttatgtgaatcgagttagccgagtttaa < 1:780189‑M2/100‑68 (MQ=255) gCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaac < 1:3504557‑M2/100‑68 (MQ=255) cTGgttgcgcgtttcctgcggcagcttcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaac < 2:1054084‑M1/100‑98 (MQ=255) cTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaacc < 1:496177‑M2/100‑69 (MQ=255) tGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaacc < 1:1551117‑M1/100‑99 (MQ=255) ggttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccc < 2:1691219‑M1/100‑100 (MQ=255) gTTTCGCAGCTCCCGCATAACACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTc < 2:3211492/95‑1 (MQ=255) | TTGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCG > NC_000913/4323‑4520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |