| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 884917 | 117 (0.790) | 22 (0.160) | 12/160 | NT | 16.7% | intergenic (+12/+29) | mdfA/ybjH | multidrug efflux system protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 884930 | 114 (0.850) | intergenic (+25/+16) | mdfA/ybjH | multidrug efflux system protein/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
TTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACAT > NC_000913/884819‑885016 | ttCAGCCTTTTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGTGTATGGTTATCTTGTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAc < 2:3441911/100‑1 (MQ=255) cAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCAGAtcg > 1:2586905‑M1/1‑97 (MQ=255) cAACCTTGTCAACGGAATCTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTg > 2:1813355/1‑100 (MQ=255) ccTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCtt < 1:383753/100‑1 (MQ=255) cTTGTCAACGGAATTTTGTGAATGTCGCTGATAGTTATCATTGTAAAAGATAAACAGATGAGAAATTTTGACGAAGGGTAAAAAAATACCTACCTGCt > 2:3545983/1‑98 (MQ=255) ttGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaa > 2:3964110‑M1/1‑92 (MQ=255) gTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTtgtg > 2:3139416/1‑100 (MQ=255) tCAACGGAATTTTGTGGCTGGCGGTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTATAAAAAAAAAAAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGc < 1:3733478/100‑1 (MQ=255) cAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTTATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg < 2:2299590/100‑1 (MQ=255) cAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCg < 1:4011257/100‑1 (MQ=255) aaCGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTCATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGa < 2:2516239/100‑1 (MQ=255) aCGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAt < 2:1714141‑M2/100‑2 (MQ=255) cGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtc < 1:3352747‑M2/100‑3 (MQ=255) ggAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtca < 2:485015‑M1/100‑17 (MQ=255) ggAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtca < 2:3830310‑M2/100‑4 (MQ=255) gAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcag > 2:2423447‑M2/1‑96 (MQ=255) tttGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcat < 2:1925671‑M2/100‑9 (MQ=255) tttGTGGCTGTAGTTGATGGTTATCTTTTTAAAATATAAACAGATGGAAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgtacaaagcagtcaggcat < 2:29169‑M1/100‑22 (MQ=255) ttGTGTTTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGAAAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGTCAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatt < 1:2951437‑M1/100‑23 (MQ=255) ttGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatt < 2:3167425‑M1/100‑23 (MQ=255) tgtgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATtc > 2:4176177/1‑100 (MQ=255) tgtgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTGTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattt < 2:3671800‑M1/100‑24 (MQ=255) gtgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttt < 2:4094166‑M1/100‑25 (MQ=255) tgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattttt < 1:99616‑M1/100‑26 (MQ=255) tgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattttt < 1:1905938‑M1/100‑26 (MQ=255) tgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATtctc < 2:1497692/100‑1 (MQ=255) ggCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttt < 1:251831‑M1/100‑27 (MQ=255) ggCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttt < 2:2391381‑M1/100‑27 (MQ=255) ggCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCg < 1:2781528/100‑1 (MQ=255) gCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGAATATTCTCACGAAGGGTAACAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCg > 2:2281868/1‑99 (MQ=255) cTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGaa < 2:926453/100‑1 (MQ=255) tGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttac < 1:1093675‑M1/100‑30 (MQ=255) tGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAAt < 1:1813359/100‑1 (MQ=255) gTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacc < 1:971980‑M1/100‑31 (MQ=255) gTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAAtt < 2:217721/100‑1 (MQ=255) gTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAAtt < 2:731541/100‑1 (MQ=255) cGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTaa > 1:2255696/1‑100 (MQ=255) catctgtttATCTTTTAAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATACCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATg > 2:3780357/8‑100 (MQ=39) cTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATg < 2:113925/100‑1 (MQ=255) tGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATgg < 1:3522329/100‑1 (MQ=255) tGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGATGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGa > 2:2931481/1‑100 (MQ=255) ggTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCATGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGAt > 2:1735432/1‑100 (MQ=255) gTTATCTTTTTAAAAGATACACAGATGTGAAATTCTCATTTAGTTAAAAAAAATGCCTGACGGATTTGTGCGATTAGGCATTTTCGAATTAATGGTg > 2:2615696/1‑97 (MQ=255) ttATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATgg < 1:642024/100‑1 (MQ=255) tCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGTGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcg > 1:1201771/1‑100 (MQ=255) tCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcg > 1:2886489/1‑100 (MQ=255) tCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcg < 1:2329469/100‑1 (MQ=255) tCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcg < 2:598102/100‑1 (MQ=255) cTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgt < 1:1252805/100‑1 (MQ=255) cTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgt < 1:3396486/100‑1 (MQ=255) cTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgt > 1:1325558/1‑100 (MQ=255) tttttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGATGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgtc > 2:623733/1‑100 (MQ=255) tttttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgtc > 1:167348/1‑100 (MQ=255) tAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATc > 2:2421513/1‑100 (MQ=255) tAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTACTTTTTGCGATCAGGCATTCTCGAATTGATGGTGATGGTCGTCAATc > 2:3074713/1‑100 (MQ=255) aaaaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCt > 1:3609940/1‑100 (MQ=255) aaaGATAAACAGATGTTAAATTCTAAAAAAAAAAAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTg < 2:822437/100‑1 (MQ=255) aaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTgg < 2:1003311/100‑1 (MQ=255) aaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTgg < 2:3218739/100‑1 (MQ=255) aGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgt < 1:4090482/100‑1 (MQ=255) tAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGtt < 1:2989940/100‑1 (MQ=255) tAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGtt > 1:1408477/1‑100 (MQ=255) aaaCAGATGGGAAATTCTAAAAAAGAAAAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTc < 2:3174451/100‑1 (MQ=255) aCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGa < 2:3352731/100‑1 (MQ=255) aTGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAAc < 1:1448359/100‑1 (MQ=255) aTGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAAc < 2:3305935/100‑1 (MQ=255) aTGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAAc < 2:2736466/100‑1 (MQ=255) tGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAAcc < 1:1583942/100‑1 (MQ=255) tGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCACTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAAcc > 2:2458844/1‑100 (MQ=255) gggAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCa > 1:763788/1‑100 (MQ=255) gAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATc < 1:1925674/100‑1 (MQ=255) ttCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATGCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCt > 2:1626304/1‑99 (MQ=255) cACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCAcc > 2:1288203/1‑100 (MQ=255) cACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCAcc > 1:2043424/1‑100 (MQ=255) cACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCAc > 2:1384669/1‑99 (MQ=255) aCGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTTCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCAcc < 2:673012/99‑1 (MQ=255) gAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcag < 2:1710887‑M2/100‑67 (MQ=255) gggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagc < 2:1952722‑M2/98‑68 (MQ=255) gTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgaca < 1:1480056‑M2/100‑72 (MQ=255) gTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCt > 2:2684797/1‑98 (MQ=255) aaaaaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCa > 1:269328/1‑100 (MQ=255) aaaaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagcc < 1:3964137‑M2/100‑75 (MQ=255) aaaaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttctaaaaagataaccatcagcgacagcc < 2:3452564‑M2/100‑75 (MQ=255) aaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttattttttaaaaacataaccatcagcgacagccaca < 2:2759945‑M2/100‑78 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttatttttcttgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaa < 2:1167825‑M2/100‑79 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaa < 2:1520168‑M2/100‑79 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaa < 1:2134148‑M2/100‑79 (MQ=255) gCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaat > 2:4120364‑M1/1‑6 (MQ=255) ccTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaatt > 1:117564‑M1/1‑5 (MQ=255) ccTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaatt > 2:3089676‑M1/1‑5 (MQ=255) ccTGACTGGTGTGTGCGATCAGGAATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGa < 2:1238366/100‑1 (MQ=255) ccTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGa > 1:56490/1‑100 (MQ=255) ccTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGa > 1:3306461/1‑100 (MQ=255) cTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattc < 1:3826142‑M1/100‑97 (MQ=255) cTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGaa > 1:834132/1‑100 (MQ=255) tGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAAc > 1:1136194/1‑100 (MQ=255) gAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacacaattccg < 1:2194345‑M1/100‑99 (MQ=255) gAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattccg < 1:3352747‑M1/100‑99 (MQ=255) atcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattccgt < 1:2488229‑M1/100‑100 (MQ=255) atcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattccgt > 1:608466‑M1/1‑1 (MQ=255) | TTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACAT > NC_000913/884819‑885016 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |