| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3635910 = | 128 (0.860) | 27 (0.210) | 10/154 | NT | 20.5% | intergenic (+17/+298) | yhiM/yhiN | acid resistance protein, inner membrane/putative oxidoreductase |
| ? | NC_000913 | 3635946 = | 99 (0.770) | intergenic (+53/+262) | yhiM/yhiN | acid resistance protein, inner membrane/putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
GAGTTCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGTTTTTCTTAGGCATCATGAAATAACGCAGCATTAATGCATAGTGGTTAAGTATAAAAAACAGCAAAGT > NC_000913/3635811‑3636009 | gAGTTCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATA > 2:3901120‑M1/1‑100 (MQ=255)gAGTTCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATA < 2:2960214‑M1/100‑1 (MQ=255) aGTTCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAA > 1:2131422‑M1/1‑100 (MQ=255) ttCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAA < 1:1289883‑M1/100‑1 (MQ=255) atgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAc > 1:3239678‑M1/96‑100 (MQ=255) atgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAc > 1:2882626‑M1/96‑100 (MQ=255) atgaaataggaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAc > 1:3497819‑M1/96‑100 (MQ=255) tgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAcc > 1:1116223‑M1/95‑100 (MQ=255) tgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAcc > 1:2005282‑M1/95‑100 (MQ=255) tgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAcc > 2:716395‑M1/95‑100 (MQ=255) tgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgcggttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAcc > 1:1070976‑M1/95‑100 (MQ=255) gaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCa < 1:1556226‑M1/7‑1 (MQ=255) gaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCa < 2:1543357‑M1/7‑1 (MQ=255) gaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCa < 1:1257471‑M1/7‑1 (MQ=255) ggTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAG > 2:1943768‑M1/1‑100 (MQ=255) ggTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAG < 2:1116200‑M1/100‑1 (MQ=255) ggTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAG > 2:2026847‑M1/1‑100 (MQ=255) ggTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAG > 1:2188002‑M1/1‑100 (MQ=255) gTCGGTTTGGGAGCAGTATGCTTTACATTGTACTCAATCGTGTCAATATTAGAAGCAAAAAAAAAAAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCa < 2:3920368/98‑1 (MQ=255) ggTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTT > 2:830012‑M1/1‑100 (MQ=255) ggTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTT > 2:875014‑M1/1‑100 (MQ=255) atgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGtt > 1:3194900‑M1/89‑100 (MQ=255) gTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACagatcgga > 2:371004‑M1/1‑92 (MQ=255) tttGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGa < 2:4073313/100‑1 (MQ=255) tGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGAcc < 1:1738621/100‑1 (MQ=255) gggAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCa > 1:2710905/1‑100 (MQ=255) gggAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCa < 1:1486972/100‑1 (MQ=255) ggAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGatcggaagag > 1:1761892‑M1/1‑90 (MQ=255) gAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCAtt > 1:3620129/1‑100 (MQ=255) gAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACAAtt > 2:1189818/1‑100 (MQ=255) aGCGGTATGCTTTAGGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCAttt < 2:3774780/100‑1 (MQ=255) gCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTg < 1:698282/100‑1 (MQ=255) gCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTg > 1:1521693/1‑100 (MQ=255) ggTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCg > 1:2060352/1‑100 (MQ=255) ggTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCg > 1:2293598/1‑100 (MQ=255) ggTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCg > 1:4128987/1‑100 (MQ=255) gTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGt > 1:2994425/1‑100 (MQ=255) aaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTa > 2:2354160‑M1/76‑100 (MQ=255) attcTTTACGTTATTGTCAATCAGTTCAATATTACAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCACCGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGc < 2:2223553/93‑1 (MQ=255) gCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTaacg < 1:490969‑M2/100‑5 (MQ=255) gCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTaacg < 1:1011886‑M2/100‑5 (MQ=255) ttACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctg < 1:2621012‑M1/100‑20 (MQ=255) 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cGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctggtt < 2:1019455‑M1/100‑23 (MQ=255) cGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTaacgctggtt < 2:2701519‑M2/100‑11 (MQ=255) actttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGtttt > 1:1196089‑M1/65‑100 (MQ=255) actttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGtttt > 2:14111‑M1/65‑100 (MQ=255) tgttCTGAATTGGTTCAATATTGGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTaacgctggt > 2:3376588‑M2/1‑87 (MQ=255) ctttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGttttt > 1:3344685‑M1/64‑100 (MQ=255) gttCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGTTTTTc < 2:479937/100‑1 (MQ=255) 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GAGTTCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGTTTTTCTTAGGCATCATGAAATAACGCAGCATTAATGCATAGTGGTTAAGTATAAAAAACAGCAAAGT > NC_000913/3635811‑3636009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |