| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4542537 = | 107 (0.880) | 3 (0.030) | 6/168 | NT | 2.9% | coding (501/597 nt) | fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
| ? | NC_000913 | 4542560 = | 99 (0.860) | coding (524/597 nt) | fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAA > NC_000913/4542464‑4542659 | caaacctcttctctttttaatttttcgtttatgagattatttctttcccataatccggcaaaacgagcagcattactgtgcgttataccgccagtaAtgc < 1:2573751‑M2/4‑1 (MQ=255) aaacctcttctctttttaatttttcgtttatgagattatttctttcccataatccggcaaaacgagcagcattactgtgcgttataccgccagtaAtgct < 1:706230‑M2/5‑1 (MQ=255) aacctcttctctttttaatttttcgtttatgagattatttctttcccataatccggcaaaacgagcagcattactgtgcgttataccgccagtaAtgctg < 1:2050626‑M2/6‑1 (MQ=255) aTGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAAtgctgc < 1:2901046/100‑1 (MQ=255) acctcttctctttttaatttttcgtttatgagattatttctttcccataatccggcaaaacgagcagcattactgtgcgttataccgccagtaAtgctgc < 2:1467138‑M2/7‑1 (MQ=255) cctcttctctttttaatttttcgtttatgagattatttctttcccataatccggcaaaacgagcagcattactgtgcgttataccgccagtaATgctgct < 1:3010894‑M2/8‑1 (MQ=255) ggCGGAGTGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGtttt < 2:3257907/100‑1 (MQ=255) ggCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGtttt > 1:2936399/1‑100 (MQ=255) ggCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGtttt > 1:836450/1‑100 (MQ=255) ggAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGcc < 1:2168529/100‑1 (MQ=255) ggAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGcc > 1:1442063/1‑100 (MQ=255) aacGTGGTTCAGATACTCGTTTAATTGAGGATTATCTCGGGCATCGAAATAGGCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAACGCTGCTCGTTTTGCCg < 2:1628645/97‑1 (MQ=255) gCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGa < 1:1395596/100‑1 (MQ=255) gtggtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGAtt < 2:2242068/100‑1 (MQ=255) gtggtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGAt < 2:2292085/99‑1 (MQ=255) ggtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTAt > 2:1734388/1‑100 (MQ=255) ggtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTAt > 2:1991463/1‑100 (MQ=255) ggtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTAt > 2:1423480/1‑100 (MQ=255) ggtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTAt > 1:3073479/1‑100 (MQ=255) agtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGGCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATTCTGCACGATTTGcaagaata > 2:313877/2‑92 (MQ=255) gtgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATg < 2:1100764/100‑1 (MQ=255) tgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTTGCCATAGTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGGCGGATTATgg > 2:1467750/1‑100 (MQ=255) tgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATgg < 2:2478005/100‑1 (MQ=255) tgCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATgg < 2:1257297/100‑1 (MQ=255) gCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATggg < 2:1570013/100‑1 (MQ=255) gCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATggg > 2:1320037/1‑100 (MQ=255) ttccgatctgTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGga < 1:906303/91‑1 (MQ=255) aGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaa < 1:2661883/100‑1 (MQ=255) aGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaa > 2:1833707/1‑100 (MQ=255) aGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaa > 1:2725165/1‑100 (MQ=255) tACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaaaga > 2:715064/1‑100 (MQ=255) tACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaaaga > 1:1788853/1‑100 (MQ=255) cTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaaagaaa > 1:2058239/1‑100 (MQ=255) cTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGgaaagaaa > 1:1950987/1‑100 (MQ=255) tCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAaat < 2:1538682/100‑1 (MQ=255) tCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAaat < 1:3150441/100‑1 (MQ=255) tttAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAaataat < 1:2602313/100‑1 (MQ=255) tAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAAtct > 1:3140854/1‑100 (MQ=255) aaTTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCGATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAGGAAGTAAtctc < 2:1719907/100‑1 (MQ=255) cAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATaa > 2:2194439/1‑100 (MQ=255) cAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATaa > 1:2088674/1‑100 (MQ=255) aGGATTATCTCGGGCATCGACATATCCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CCGTAAAGCTCCTCATTTTGCCGTATTATGGGAATGAAATAATCTTATaaa > 2:2594623/1‑100 (MQ=255) ggATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAAc < 1:1228460/100‑1 (MQ=255) ggATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAAc > 2:513801/1‑100 (MQ=255) ggATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAAc > 1:339178/1‑100 (MQ=255) ggATTATCTCGGCCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAAc < 2:731631/100‑1 (MQ=255) aTCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGCAATAATCTCATAAACGaaaa < 2:1995526/100‑1 (MQ=255) aTCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑AAGGAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGaaaa < 2:517725/100‑1 (MQ=255) tctcGGGCATCGAAATATACGCTATCCTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCTTTTTGCCGGCTTATGGGAAAGAAATACTCTCATAAACGa < 2:614220/96‑1 (MQ=255) tcGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAAtt < 2:1026746/100‑1 (MQ=255) cGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTa < 1:3199557/100‑1 (MQ=255) cGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTa > 2:1392566/1‑100 (MQ=255) cGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTa > 1:1876924/1‑100 (MQ=255) gggCATCGAAATATTCGCCAGACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGATTCTCGTTTGGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAAt < 2:2744441/97‑1 (MQ=255) ggCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTaaa < 2:89639/100‑1 (MQ=255) gCATCGAAATATTTGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑GAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTaaaa < 2:2915035/100‑1 (MQ=255) gCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTaaaa < 1:1530530/100‑1 (MQ=255) aTCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaag < 1:591803/100‑1 (MQ=255) tatTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAaagagaagag < 1:2539128/100‑1 (MQ=255) atTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAgg < 2:1343196/100‑1 (MQ=255) atTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAgg > 1:338851/1‑100 (MQ=255) agcagcatTACTG‑GCGGTATAACGCACAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAgg < 1:3010894‑M1/92‑1 (MQ=255) cGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGttt > 1:2699880/1‑100 (MQ=255) cGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGtt < 2:1627361/99‑1 (MQ=255) agcatTACTG‑GCGGTATAACGCACAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGttt < 1:706230‑M1/95‑1 (MQ=255) ccATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTg < 1:1951416/99‑1 (MQ=255) cATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGa < 2:1040137/99‑1 (MQ=255) atTACTG‑GCGGTATAACGCACAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGAt < 1:236638‑M1/98‑1 (MQ=255) aTACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGAtt < 2:2870788/100‑1 (MQ=255) TACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGAttt < 1:1653950‑M1/100‑1 (MQ=255) TACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGAttt > 2:2626322‑M1/1‑100 (MQ=255) ACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTa > 1:1006310‑M1/1‑100 (MQ=255) TGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAAc > 1:1423483‑M1/1‑100 (MQ=255) TGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAAc > 1:308619‑M1/1‑100 (MQ=255) GTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACt > 1:1730783‑M1/1‑100 (MQ=255) GTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACt < 2:176621‑M1/100‑1 (MQ=255) tgCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACtt > 1:2638381/1‑100 (MQ=255) gCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTa > 2:2818385/1‑100 (MQ=255) 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taCCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGata > 2:2648737/1‑100 (MQ=255) taCCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGata > 1:1261574/1‑100 (MQ=255) taCCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGata > 1:285917/1‑100 (MQ=255) aCCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGataa < 1:264078/100‑1 (MQ=255) aCCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGataa > 2:2380150/1‑100 (MQ=255) ccGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGataat > 1:2314279/1‑100 (MQ=255) cGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGataata < 1:65421/100‑1 (MQ=255) gC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGAtaataa > 1:1370514/1‑100 (MQ=255) agtaATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTCATTTAACTTATTGATAATAAAGt > 1:1509851‑M2/5‑100 (MQ=255) gtaATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGtt < 1:265840‑M2/97‑1 (MQ=255) taATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTa < 1:1734393‑M2/98‑1 (MQ=255) taATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTa < 1:1641225‑M2/98‑1 (MQ=255) taATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTa < 1:2785963‑M2/98‑1 (MQ=255) aATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTaa > 1:3073720‑M2/2‑100 (MQ=255) aTGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTaaa < 2:1921250/100‑1 (MQ=255) | GTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGC‑CAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAA > NC_000913/4542464‑4542659 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |