| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 526041 | NA (NA) | 6 (0.050) | 6/170 | NT | 100% | coding (2781/4281 nt) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 526069 | 0 (0.000) | coding (2809/4281 nt) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGATAACCGCATCGCGGAGGATGCGCACTATGTCTACCGCCACGATGAATACGGCAGGCTGACGGAGAAGACGGACCGCATCCCGGCGGGTGTGATACGGA > NC_000913/525970‑526168 | ccAGACCTGGGCATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGG > 1:2193271‑M2/1‑100 (MQ=255)ccAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGG < 1:1415320‑M2/100‑1 (MQ=255)ccAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGG < 1:187238‑M2/100‑1 (MQ=255)ccAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGG > 2:643273‑M2/1‑100 (MQ=255)ccAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGG < 1:2558548‑M2/100‑1 (MQ=255)ccAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGG < 2:1111333‑M2/100‑1 (MQ=255)ccAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGG < 2:1831666‑M2/100‑1 (MQ=255)ccAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTACACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGG < 2:1704655‑M2/100‑1 (MQ=255) ggACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgc < 2:2475810‑M2/100‑57 (MQ=255) gCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtcca < 1:2368924‑M2/100‑66 (MQ=255) tGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccagg < 1:308437‑M2/100‑68 (MQ=255) gCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggt < 2:1262011‑M2/100‑69 (MQ=255) cccGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccagg < 1:2924986‑M2/96‑68 (MQ=255) ccGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctg < 2:903516‑M2/99‑72 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccag < 2:360929‑M2/100‑97 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggctgcggatgtccaggtctggcgcgagggtgcgcacactctccagcc < 1:2661232‑M2/100‑99 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 2:3075486‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 1:3229853‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 2:1399960‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 1:781547‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc < 1:1198649‑M2/100‑99 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 1:3063753‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 1:2677264‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 1:2296011‑M2/1‑2 (MQ=255) ggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcct < 1:748037‑M2/100‑100 (MQ=255) ggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcct < 1:1333243‑M2/100‑100 (MQ=255) | CCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGATAACCGCATCGCGGAGGATGCGCACTATGTCTACCGCCACGATGAATACGGCAGGCTGACGGAGAAGACGGACCGCATCCCGGCGGGTGTGATACGGA > NC_000913/525970‑526168 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |