| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2232735 | NA (NA) | 3 (0.030) | 3/166 | NT | NA | intergenic (+7/‑143) | cdd/sanA | cytidine/deoxycytidine deaminase/DUF218 superfamily vancomycin high temperature exclusion protein |
| ? | NC_000913 | = 2232765 | NA (NA) | noncoding (30/34 nt) | REP155 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP155 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
GCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAG > NC_000913/2232666‑2232863 | ccACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCt > 1:1758394/1‑100 (MQ=255) cACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCtt > 2:589127/1‑100 (MQ=255) aCCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTg < 2:3165866/100‑1 (MQ=255) cTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGcc < 2:93360/100‑1 (MQ=255) cTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGcc < 1:2505463/100‑1 (MQ=255) cGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGc < 2:3007334/100‑1 (MQ=255) cGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGc < 2:1040523/100‑1 (MQ=255) gCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGcc > 2:317743/1‑100 (MQ=255) aCGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCctc > 2:1477268/1‑100 (MQ=255) gAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTg < 2:3229132/100‑1 (MQ=255) aaaGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTgg < 1:1434909/100‑1 (MQ=255) aaGCTCTCGGGTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGgt > 1:2357201/1‑100 (MQ=255) aaGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTgg < 2:787852/99‑1 (MQ=255) gCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGgtgt < 1:2993918/100‑1 (MQ=255) ctctCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTc > 2:2710052/1‑100 (MQ=255) tctcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCg > 2:1178232/1‑100 (MQ=255) ctcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGa > 1:1246007/1‑100 (MQ=255) ctcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGa < 2:288336/100‑1 (MQ=255) tcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGaa < 2:1866608/100‑1 (MQ=255) cGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGaaa < 1:748700/100‑1 (MQ=255) cGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGaaa < 1:2525250/100‑1 (MQ=255) tCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTTCCg > 2:2816145/1‑100 (MQ=255) cacaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCGGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCGTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCgg < 1:1653675/100‑1 (MQ=255) acaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGc > 1:3262937/1‑100 (MQ=255) acaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGc > 1:1323127/1‑100 (MQ=255) acaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGc > 2:2242851/1‑100 (MQ=255) acaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGc < 1:1796793/100‑1 (MQ=255) caGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGTCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCa < 1:1008722/100‑1 (MQ=255) caGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCa > 2:24477/1‑100 (MQ=255) tATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAAc > 1:3170699/1‑100 (MQ=255) aTCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACa > 2:3049050/1‑100 (MQ=255) tCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAg < 2:2761529/100‑1 (MQ=255) gACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGtt > 2:2123453/1‑100 (MQ=255) gACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGtt > 2:2338289/1‑100 (MQ=255) gACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGtt > 1:970830/1‑100 (MQ=255) gACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGtt > 1:103750/1‑100 (MQ=255) aCCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGttt > 1:1848189/1‑100 (MQ=255) ccGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTg < 1:1943803/100‑1 (MQ=255) cGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTg > 1:661501/1‑99 (MQ=255) cGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGc < 1:15583/100‑1 (MQ=255) gAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGcc > 1:3185559/1‑100 (MQ=255) aGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCg > 2:2294842/1‑100 (MQ=255) tGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGtt < 2:1567123/100‑1 (MQ=255) tGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGtt < 2:1551915/100‑1 (MQ=255) tGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGtt < 2:1905856/100‑1 (MQ=255) gCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGttt > 1:2509151/1‑100 (MQ=255) cTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACTGTTTGCCgggaa < 1:1249338/100‑5 (MQ=255) cTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGttt > 2:195057/1‑99 (MQ=255) cTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTc < 1:782993/100‑1 (MQ=255) ttCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCt < 2:1758405/100‑1 (MQ=255) tctcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCTGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTc < 2:2989458/98‑1 (MQ=255) tcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTgc < 2:1345639/100‑1 (MQ=255) gCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACTGTTTGCCgggaatttcg < 1:964799/99‑10 (MQ=38) gCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTgcgc > 2:1419896/1‑100 (MQ=255) cTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCa < 2:686240/100‑1 (MQ=255) aaGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCaaaa < 2:2933359/100‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAAc < 2:1270880/100‑1 (MQ=255) gCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcgg < 1:2386947‑M2/100‑64 (MQ=255) gCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAAcc > 2:2828960/1‑100 (MQ=255) ccTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAAcc < 1:3086374/99‑1 (MQ=255) ccTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCa > 1:290785/1‑100 (MQ=255) ggTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCg < 2:3244507/100‑1 (MQ=255) gCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacacccgagagctttcagcgttgcggaggtggc < 1:2020774‑M2/100‑71 (MQ=255) ccGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcggaggtggca < 1:3042740‑M2/100‑72 (MQ=255) ccGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTa > 2:163694/1‑100 (MQ=255) ggATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTaaa < 2:1216782/100‑1 (MQ=255) aTGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGt < 2:970833/100‑1 (MQ=255) tGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTa < 2:2578871/100‑1 (MQ=255) gcggcgTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAg > 1:3164494/1‑100 (MQ=255) cggcgTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGc > 2:2009553/1‑100 (MQ=255) cggcgTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGc > 2:3240782/1‑100 (MQ=255) ggcgTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGcc < 1:2178415/100‑1 (MQ=255) ggcgTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGcc > 1:2009073/1‑100 (MQ=255) ggcgTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGcc < 1:1231309/100‑1 (MQ=255) ggcgTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGcc < 1:735583/100‑1 (MQ=255) cgTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTg < 1:2745390/100‑1 (MQ=255) gTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGa < 2:1246011/100‑1 (MQ=255) gTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGa > 2:1059324/1‑100 (MQ=255) tGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGAt > 2:2081704/1‑100 (MQ=255) tGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGAt > 1:2360350/1‑100 (MQ=255) tGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGAt > 2:74160/1‑100 (MQ=255) 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1:2670233/94‑1 (MQ=255) gCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGaaa < 2:3118492/100‑1 (MQ=255) ccTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAAt > 2:392887/1‑100 (MQ=255) ccTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAAt > 2:2716583/1‑100 (MQ=255) cTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAAtt < 1:2774338/100‑1 (MQ=255) tCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcggaggtggcatcccactgaatcaacggcgcatc < 1:560183‑M2/100‑95 (MQ=255) tCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTcc < 2:1311556/100‑1 (MQ=255) tCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTcc < 2:401026/100‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCtt < 2:2989964/100‑1 (MQ=255) ggCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTa < 2:2684125/100‑1 (MQ=255) ggCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTa < 1:285374/100‑1 (MQ=255) gCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAg > 2:347903/1‑100 (MQ=255) | GCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAG > NC_000913/2232666‑2232863 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |