| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2597686 = | NA (NA) | 10 (0.080) | 8/166 | NT | NA | noncoding (14/46 nt) | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 2597714 = | NA (NA) | noncoding (42/46 nt) | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
TTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGC > NC_000913/2597587‑2597785 | ttACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGt < 2:2636955/100‑1 (MQ=255)atccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtt < 1:1263197‑M1/1‑1 (MQ=255) tACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTc > 1:3273230/1‑100 (MQ=255) aCCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCg < 2:1349915/100‑1 (MQ=255) aCCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCg < 2:1069296/100‑1 (MQ=255) cggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCgg > 2:893038‑M1/97‑100 (MQ=255) cggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCgg > 2:463666‑M1/97‑100 (MQ=255) cggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCgg < 1:3487510‑M1/4‑1 (MQ=255) ccACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCgg > 2:539715/1‑100 (MQ=255) aCGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGAt < 2:2718168/100‑1 (MQ=255) cGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATg < 2:1157359/100‑1 (MQ=255) aTACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcg < 2:2368226/100‑1 (MQ=255) tACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCCCTCCTGGGTGTGTATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgc < 1:391037/98‑1 (MQ=255) aaCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGt > 2:2909657/1‑100 (MQ=255) aCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTg < 2:1388895/100‑1 (MQ=255) cTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGa > 1:1429146/1‑100 (MQ=255) tCAGCTTGCTTTTGTATCTTTATTACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcgg < 1:477296/94‑1 (MQ=255) tCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCCCTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGTCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGaa < 1:774114/100‑1 (MQ=255) aGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACg < 1:1020434/100‑1 (MQ=255) ttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCt < 1:358366/100‑1 (MQ=255) ttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTACCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCt < 1:690074/100‑1 (MQ=255) gatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTa > 2:1821576‑M1/78‑100 (MQ=255) cttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAt > 1:2064868/1‑100 (MQ=255) ttttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc < 2:600892/100‑1 (MQ=255) ttttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc < 1:316912/100‑1 (MQ=255) acgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc > 1:2474811‑M1/75‑100 (MQ=255) ttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCg < 2:3418803/100‑1 (MQ=255) tGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGa > 1:2214823/1‑100 (MQ=255) gCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGaa > 2:1633022/1‑100 (MQ=255) gCATCTTTATCACTCCTGGGGGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGAAGCGGCGTGAACGCCTTATCCGaa > 2:1190069/1‑100 (MQ=255) cATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCGGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTCTCCGAAc > 1:3125556/1‑100 (MQ=255) cATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAAc < 1:2802567/100‑1 (MQ=255) cATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAAc < 1:1655615/100‑1 (MQ=255) cATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAAc > 2:2551037/1‑100 (MQ=255) cATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAAc > 2:583761/1‑100 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt < 2:2821991/100‑1 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt > 1:1554632/1‑100 (MQ=255) cTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTAc > 2:1522730/1‑100 (MQ=255) tttATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACg > 2:3151491/1‑100 (MQ=255) gtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACg > 1:1208541‑M1/67‑100 (MQ=255) cTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGaca > 1:34577/1‑100 (MQ=255) cTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGac < 2:2930924/99‑1 (MQ=255) cTCCTGGGTGTGAATTAACGTTGTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGaca > 1:169572/1‑100 (MQ=255) ccTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaaa > 2:2344777/1‑100 (MQ=255) cTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaaac < 1:61513/100‑1 (MQ=255) ggTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGAcaaacaaa > 2:1029097/1‑100 (MQ=255) tgtgAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCGTTATCCGAACTACGTGCGACAAACAAAt > 1:1554934/1‑99 (MQ=255) gtgAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAAttt > 2:3464719/1‑100 (MQ=255) gtgAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAAttt > 2:1263203/1‑100 (MQ=255) gAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCg > 2:2735013/1‑100 (MQ=255) cgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgccggatgttttgTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCg > 2:1940217‑M1/49‑100 (MQ=255) tcttccgatctAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTg < 2:148252/90‑1 (MQ=255) aTTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTg < 2:769485/100‑1 (MQ=255) ttAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGCACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGc > 1:746485/1‑100 (MQ=255) ttAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGc > 2:213223/1‑100 (MQ=255) tAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCg > 2:3706360/1‑100 (MQ=255) aaCGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATTCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAGACAAATTTCGTGc > 1:2573721/1‑98 (MQ=255) aaCGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGa > 2:2670458/1‑100 (MQ=255) 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2:1705583/100‑1 (MQ=255) tGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGttt > 1:1844461/1‑100 (MQ=255) gTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTg > 2:2846884/1‑100 (MQ=255) gTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTg > 2:1166760/1‑100 (MQ=255) TCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGc < 2:2378709‑M1/100‑1 (MQ=255) | TTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGC > NC_000913/2597587‑2597785 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |