| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2842423 = | NA (NA) | 9 (0.070) | 7/164 | NT | NA | noncoding (1/79 nt) | REP197 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP197 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 4554508 | NA (NA) | noncoding (4/34 nt) | REP346 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP346 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
GTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTA > NC_000913/4554409‑4554607 | gTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAg < 1:3607485/100‑1 (MQ=255)gTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCAAACTGTACGTGCCAACTTCCAGGGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAg > 1:3316968/1‑100 (MQ=255) tGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgc < 1:249558‑M2/100‑3 (MQ=255) gACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgcc < 2:3438057‑M2/100‑4 (MQ=255) aCCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgccg < 2:951057‑M2/100‑5 (MQ=255) aCCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgccg > 2:3674721‑M2/1‑96 (MQ=255) ccAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgccgg > 2:3637540‑M2/1‑95 (MQ=255) ccAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgccg > 1:3069164‑M2/1‑95 (MQ=255) ccAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgccg > 1:1915810‑M2/1‑95 (MQ=255) gTTTTCGTTTTTTTTCTCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATa > 1:478302/1‑100 (MQ=255) gTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATa > 2:657445/1‑100 (MQ=255) gTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATa > 2:2304258/1‑100 (MQ=255) ttCGTTTTTTTTCCCACTTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAgg < 2:481602/100‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGAGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGc < 2:1073432/100‑1 (MQ=255) cGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCg > 1:2293922/1‑100 (MQ=255) cGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCg > 2:2995234/1‑100 (MQ=255) cGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCg > 2:2894448/1‑100 (MQ=255) gTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGt > 2:3592032/1‑100 (MQ=255) tttttGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCa > 2:1909790/1‑100 (MQ=255) tttttGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGATATAGTTTGAGATTAACGGGTGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGttga < 2:2531041/100‑3 (MQ=255) ttGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgc < 2:2401591/100‑1 (MQ=255) tGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 2:540133/100‑1 (MQ=255) cACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgccgc < 1:1122691/98‑1 (MQ=255) ccTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgccggatgcggcgtgaacgccttatcc > 1:2808613‑M2/1‑73 (MQ=255) tGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgccggatgcggcgtgaacgccttatccgg > 2:2045305‑M2/1‑71 (MQ=255) gacgtggcctgataaacatatcgcatcaggccacgtcttaatgtaatgctttggatttgcaaattTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCgg > 1:135816‑M2/66‑100 (MQ=255) gacgtggcctgataaacatatcgcatcaggccacgtcttaatgtaatgctttggatttgcaaattTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCgg < 2:3129760‑M2/35‑1 (MQ=255) gacgtggcctgataaacatatcgcatcaggccacgtcttaatgtaatgctttggatttgcaaattTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCgg > 1:3129738‑M2/66‑100 (MQ=255) gTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTTTAGTTTGAGATTAACTGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgccggatgcggcgtgaacgccttatccggc > 1:3487406‑M2/1‑70 (MQ=255) gTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCACGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc > 1:1504762/1‑100 (MQ=255) tACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcc > 1:2926672‑M2/1‑69 (MQ=255) tACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCa < 2:927821/100‑1 (MQ=255) cgtggcctgataaacatatcgcatcaggccacgtcttaatgtaatgctttggatttgcaaattTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCa > 1:525669‑M2/64‑100 (MQ=255) gtggcctgataaacatatcgcatcaggccacgtcttaatgtaatgctttggatttgcaaattTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCa > 2:1888291‑M2/63‑99 (MQ=255) aCGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACTGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcct > 2:627982‑M2/1‑68 (MQ=255) tggcctgataaacatatcgcatcaggccacgtcttaatgtaatgctttggatttgcaaattTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGgcatc > 2:1434163‑M2/62‑98 (MQ=255) tggcctgataaacatatcgcatcaggccacgtcttaatgtaatgctttggatttgcaaattTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGgcatc > 2:3576420‑M2/62‑98 (MQ=255) ggcctgataaacatatcgcatcaggccacgtcttaatgtaatgctttggatttgcaaattTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCggcatca > 2:1698443‑M2/61‑97 (MQ=255) tGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaaaaa > 1:3192044/1‑100 (MQ=255) gcctgataaacatatcgcatcaggccacgtcttaatgtaatgctttggatttgcaaattTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCcggcatcaa > 1:2768463‑M2/60‑96 (MQ=255) ccAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAtt > 2:153406/1‑100 (MQ=255) ccAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAtt > 1:975886/1‑100 (MQ=255) 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2:856569/1‑100 (MQ=255) tGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGAc < 2:2262985/100‑1 (MQ=255) gggccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacatgtcgcacgaaccatgaaggcccgataagcgcagcgcatcgggcaatttagcatttggcatca > 2:3392538‑M2/2‑2 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCtt < 1:2189702/100‑1 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACCACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCtt > 1:3264437/1‑99 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTa > 1:563099/1‑100 (MQ=255) | GTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTA > NC_000913/4554409‑4554607 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |