| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,793,843 | IS2 (–) +5 bp | 100% | intergenic (‑160/‑140) | yibB ← / → hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | NC_000913 | = 3793847 | 3 (0.030) | intergenic (‑164/‑140) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3793843 = | 3 (0.030) | 113 (1.040) | 76/178 | NT | 97.3% | intergenic (‑160/‑144) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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TGTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATT > NC_000913/3793745‑3793941 | tGTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGAc > 2:1286018/1‑100 (MQ=255)caatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaa < 2:708921‑M1/1‑1 (MQ=255) gTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACt > 1:1097401/1‑100 (MQ=255) gTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACt < 2:552998/100‑1 (MQ=255) gTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACt < 1:1351615/100‑1 (MQ=255) atatTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAg < 1:1383796/100‑1 (MQ=255) atatTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAg < 1:1961179/100‑1 (MQ=255) tattatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGt < 1:866821‑M2/100‑2 (MQ=255) ttatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtg > 2:2602853‑M2/1‑97 (MQ=255) tatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtgga < 1:215616‑M2/100‑5 (MQ=255) tgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTaaa > 1:675517‑M1/91‑100 (MQ=255) tctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAcc > 2:2703449‑M1/88‑100 (MQ=255) cATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttg < 2:1113794‑M2/100‑9 (MQ=255) cATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttg < 1:2835673‑M2/100‑9 (MQ=255) ctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAccc < 2:2551459‑M1/14‑1 (MQ=255) ctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAccc > 2:493791‑M1/87‑100 (MQ=255) aTTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgc > 2:2447584‑M2/1‑91 (MQ=255) aTTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAAccc < 1:1984041/100‑1 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtagatcggaa < 2:3070377‑M2/100‑11 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCaa < 1:1457745‑M1/16‑1 (MQ=255) caatgactagtcgaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCaaa > 2:2643908‑M1/84‑100 (MQ=255) cAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccc > 1:2909084‑M2/1‑88 (MQ=255) cAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccc < 1:202651‑M2/100‑13 (MQ=255) cttccgatctgttatTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccct > 1:256201‑M2/8‑87 (MQ=255) aatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAAc < 1:2266584‑M1/18‑1 (MQ=255) aaaTGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccc > 1:1372923‑M2/1‑87 (MQ=255) atgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACt > 2:1562895‑M1/82‑100 (MQ=255) aTGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctat > 1:319754‑M2/1‑85 (MQ=255) ttCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatattt < 1:2983671‑M2/100‑20 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttg > 2:644747‑M1/76‑100 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttg > 1:1652116‑M1/76‑100 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttg > 2:1618391‑M1/76‑100 (MQ=255) gtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttgt < 2:1504790‑M1/26‑1 (MQ=255) ccGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttcc < 2:919227‑M2/100‑22 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |