| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,793,843 | IS2 (–) +5 bp | 100% | intergenic (‑160/‑140) | yibB ← / → hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 116 (1.060) | 72/178 | NT | 97.3% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3793847 | 3 (0.030) | intergenic (‑164/‑140) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3793843 = | 3 (0.030) | 113 (1.040) | 76/178 | NT | 97.3% | intergenic (‑160/‑144) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
ATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGT > NC_000913/3793748‑3793946 | tcatctgttctcccatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAg > 2:2593542‑M1/96‑100 (MQ=255) tattatCCATTCAAATGCTTCCGATATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAACGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAg > 2:23880/1‑99 (MQ=255) catctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGc > 2:2129006‑M1/95‑100 (MQ=255) attatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtg < 1:2716260‑M2/100‑3 (MQ=255) ttatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtg > 2:2602853‑M2/1‑97 (MQ=255) tctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTa < 1:924248‑M1/8‑1 (MQ=255) atCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggat < 1:1478187‑M2/100‑6 (MQ=255) tctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAcc > 2:2703449‑M1/88‑100 (MQ=255) tctccaatgactagtctaaaaactaggattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAcc > 2:705170‑M1/88‑100 (MQ=255) cATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttg < 2:1255132‑M2/100‑9 (MQ=255) cATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttg < 2:531941‑M2/100‑9 (MQ=255) ctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAccc < 2:2551459‑M1/14‑1 (MQ=255) aTTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgc > 2:2447584‑M2/1‑91 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCGAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcc < 2:2093487‑M2/100‑11 (MQ=255) caatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCaaa > 1:2985555‑M1/84‑100 (MQ=255) cttccgatctgttatTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccct > 1:256201‑M2/8‑87 (MQ=255) aaaTGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccc > 1:1372923‑M2/1‑87 (MQ=255) atgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACt > 2:1562895‑M1/82‑100 (MQ=255) aaTGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTACAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgccccta < 2:2191146‑M2/100‑15 (MQ=255) aaTGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgccccta < 1:913637‑M2/100‑15 (MQ=255) aTGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctat > 1:319754‑M2/1‑85 (MQ=255) ctattctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGtt < 1:383424‑M1/23‑1 (MQ=255) tCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttc < 2:1084979‑M2/100‑21 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttg > 2:644747‑M1/76‑100 (MQ=255) gtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttgt < 2:1504790‑M1/26‑1 (MQ=255) ccGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttcc < 2:919227‑M2/100‑22 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggcgagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTtcgttg < 1:3076530‑M1/28‑1 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttgttg < 1:2393757‑M1/28‑1 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttgttg < 1:1952361‑M1/28‑1 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGc > 2:2748530‑M1/72‑100 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGc < 1:639657‑M1/29‑1 (MQ=255) tatttatCATACATCAGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttcc > 2:1782328‑M2/1‑75 (MQ=255) atttatCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagaca < 1:1767577‑M2/100‑27 (MQ=255) ttatCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatc > 2:2201928‑M2/1‑72 (MQ=255) ttatCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatc > 2:1995495‑M2/1‑72 (MQ=255) tatCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatct < 1:1696673‑M2/100‑30 (MQ=255) ctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAg < 2:307260‑M1/35‑1 (MQ=255) tattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATc < 1:1033761‑M1/39‑1 (MQ=255) tACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttat > 1:1337345‑M2/1‑66 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATcc < 1:1090349‑M1/40‑1 (MQ=255) aCATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatc > 1:1553379‑M2/1‑65 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttttctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCt > 2:1684197‑M1/60‑100 (MQ=255) cATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca > 1:1381‑M2/1‑64 (MQ=255) aTCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac > 1:247600‑M2/1‑63 (MQ=255) aTCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac > 1:2611533‑M2/1‑63 (MQ=255) aagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTg < 1:1789817‑M1/43‑1 (MQ=255) caatatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCa < 1:2264609‑M1/45‑1 (MQ=255) caatatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCa < 1:2342412‑M1/45‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |