| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4554509 = | NA (NA) | 5 (0.050) | 4/164 | NT | NA | noncoding (5/34 nt) | REP346 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP346 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 4554539 = | NA (NA) | intergenic (+178/‑37) | uxuB/uxuR | D‑mannonate oxidoreductase, NAD‑dependent/fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTA > NC_000913/4554411‑4554607 | tGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGc < 2:489814/100‑1 (MQ=255)gatcgcggatcatcgccccgacttcctggtaaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGc < 2:742048‑M1/2‑1 (MQ=255)gatcgcggatcatcgccccgacttcctggtaaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGc < 2:2712375‑M1/2‑1 (MQ=255) atcgcggatcatcgcctcgacttcctggtaaggtctttgcgcagaggcggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGcc > 1:1030382‑M1/98‑100 (MQ=255) tcgcggatcatcgccccgacttcctggtaaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGCCg > 2:936945‑M1/97‑100 (MQ=255) tcgcggatcatcgccccgacttcctggtaaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGCCg > 1:2026757‑M1/97‑100 (MQ=255) aCCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCg > 1:2316776/1‑100 (MQ=255) cgcggatcatcgccccgacttcctggtaaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGCCgg < 2:1228233‑M1/5‑1 (MQ=255) ccAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCgg > 1:2134083/1‑100 (MQ=255) gTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTTCCAACTTCCATTGATAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATa < 2:1391125/100‑1 (MQ=255) tttCGTTTTTTTGCCCACCTGTGCGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAg < 1:1725818/100‑1 (MQ=255) ttCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAgg < 2:1756224/100‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGc < 2:3017182/100‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGc > 1:976764/1‑100 (MQ=255) tCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGc > 1:3017211/1‑100 (MQ=255) tCGTTTGTTTGCCCACCTGTACGGGCCAACTTCCAGTGCTAATTGTCTAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAgn < 2:1105239/99‑2 (MQ=255) gTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGt > 2:2281886/1‑100 (MQ=255) tGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 2:64950/100‑1 (MQ=255) ncccACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgccg > 2:2996888/2‑100 (MQ=255) gCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgccg > 2:1174508/1‑100 (MQ=255) ccACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACTGGGTCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCa < 2:3093911/100‑1 (MQ=255) ccACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCa < 1:2708227/100‑1 (MQ=255) cACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCAt > 1:776335/1‑100 (MQ=255) ccTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATcc < 1:2594345/100‑1 (MQ=255) tGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCgg < 2:237628/100‑1 (MQ=255) gtaaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc > 1:305333‑M1/71‑100 (MQ=255) gTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGc < 1:64990/100‑1 (MQ=37) gTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGc < 1:1294590/100‑1 (MQ=37) gTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGc < 2:1560963/100‑1 (MQ=37) gTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc < 1:1507882/100‑1 (MQ=255) taaggtctttgcgcagaggtggcagatttcatggtgttgtgtccgttaggtgcggttaatcaaatttttGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCa > 1:888623‑M1/70‑100 (MQ=255) aCGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc > 2:2852610/1‑98 (MQ=255) aCGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaa > 1:2512762/1‑100 (MQ=255) aCGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaa > 2:2144193/1‑100 (MQ=255) cGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGccta < 1:457046/100‑4 (MQ=25) gCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAt > 2:1364395/1‑100 (MQ=255) gCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAt < 1:201074/100‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAttt > 2:659894/1‑100 (MQ=255) cAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAttt < 1:946146/100‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAttt > 1:1646276/1‑100 (MQ=255) cAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCAGTTGTAGGCAGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCAGGCaaaaa > 2:799367/1‑97 (MQ=255) aaCTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTg < 2:62117/100‑1 (MQ=255) aaCTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTg < 1:716883/100‑1 (MQ=255) aaCTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTg < 1:2754037/100‑1 (MQ=255) ttCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGAtt < 1:793557/100‑1 (MQ=255) aGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAAcc > 1:1303969/1‑100 (MQ=255) aGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAAcc < 2:1359424/100‑1 (MQ=255) gTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAAcc < 1:1065037/99‑1 (MQ=255) tGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGc < 1:802218/100‑1 (MQ=255) gCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCa > 2:561639/1‑100 (MQ=255) cTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCAc > 2:2001921/1‑100 (MQ=255) aaTGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCt < 2:1646262/100‑1 (MQ=255) tGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTaa > 1:1395181/1‑100 (MQ=255) ggTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAAc > 1:2515343/1‑100 (MQ=255) ggTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAAc > 2:1334841/1‑100 (MQ=255) tataGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACgg > 1:3077355/1‑100 (MQ=255) ataGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGa < 1:359231/100‑1 (MQ=255) taGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGac < 1:1115003/100‑1 (MQ=255) taGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGac < 1:3014334/100‑1 (MQ=255) aGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGaca < 1:285804/100‑1 (MQ=255) gTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGacac > 1:1146060/1‑100 (MQ=255) gTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGacac > 1:1476325/1‑100 (MQ=255) tttGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGaca < 2:154670/98‑1 (MQ=255) tttGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGAcaca < 2:2316754/100‑1 (MQ=255) ttGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGAcaca < 2:2465447/99‑1 (MQ=255) gaTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACAcc < 1:1568010/100‑1 (MQ=255) aTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGTATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCa < 1:2403023/100‑1 (MQ=255) aTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCa < 1:2728450/100‑1 (MQ=255) ttAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCAt < 2:799649/100‑1 (MQ=255) ttAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCAt < 1:558370/100‑1 (MQ=255) aaCGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGa > 1:1283387/1‑100 (MQ=255) aaCGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGa > 1:1256519/1‑100 (MQ=255) aCGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGaa < 2:2609749/100‑1 (MQ=255) cGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGaaa > 1:1964130/1‑100 (MQ=255) gggggCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAAt < 1:1029241/100‑1 (MQ=255) ggggCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTCCCGGACACAACACCATGAAATc > 2:2175448/1‑100 (MQ=255) ggCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGTCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTGACGGACACAACACCATGAAATCTg < 2:1523924/100‑1 (MQ=255) ggCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCTGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATAAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTg < 2:1042593/100‑1 (MQ=255) ggCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCtn < 1:2996917/100‑2 (MQ=255) ggCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATACGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAAt > 2:2471439/1‑97 (MQ=255) gTAAAATTGCCCGATGTAGGCCGGATAAGGCCTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCAc > 1:2091471/1‑100 (MQ=255) aaaTTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACctc > 1:554328/1‑100 (MQ=255) aaTTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACctct < 2:2924146/100‑1 (MQ=255) aTTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTg > 1:742050/1‑100 (MQ=255) tGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTgcg > 1:472855/1‑100 (MQ=255) tGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTgcg > 2:1549226/1‑100 (MQ=255) tGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTgcg < 2:585838/100‑1 (MQ=255) tGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTgcg > 1:2770576/1‑100 (MQ=255) ccGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCaa < 2:1715972/100‑1 (MQ=255) ccGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCaa > 1:2891560/1‑100 (MQ=255) ccGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCaa > 1:15403/1‑100 (MQ=255) cGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCaaa > 1:840309/1‑100 (MQ=255) ttGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGa < 2:151125/100‑1 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCtt > 2:1803266/1‑100 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTa > 1:1539103/1‑100 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTa > 2:28378/1‑100 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTa > 1:2013513/1‑100 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTa < 2:2532124/100‑1 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTa > 1:3094065/1‑100 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTa > 2:1102287/1‑100 (MQ=255) | TGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTA > NC_000913/4554411‑4554607 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |