| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4624213 = | 124 (0.940) | 6 (0.050) | 4/168 | NT | 5.1% | coding (577/645 nt) | ytjB | SMP_2 family putative membrane‑anchored periplasmic protein |
| ? | NC_000913 | 4624245 = | 105 (0.840) | coding (545/645 nt) | ytjB | SMP_2 family putative membrane‑anchored periplasmic protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
ACTCTTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCGTAT > NC_000913/4624147‑4624344 | aCTCTTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGt < 2:3337164/100‑1 (MQ=255) ctctTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTg > 2:2707605/1‑100 (MQ=255) tctTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGc > 2:1081451/1‑100 (MQ=255) ccactaacattttacgcctgatgttgctgctctcactggcaatcggtgtagtgctgacccgcacGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGc > 1:711311‑M1/65‑100 (MQ=255) ctTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGAGTGCGTTTACCATGTAGCAGCGTGc < 1:543823/99‑1 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggn < 2:2120932/100‑2 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg < 2:102059/100‑1 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg < 1:3570262/100‑1 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg < 2:1184029/100‑1 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg < 2:1467210/100‑1 (MQ=255) ctaacattttacgcctgatgttgctgctctcactggcaatcggtgtagtgctgacccgcacGCTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGc > 2:973763‑M1/62‑100 (MQ=255) tctcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAg < 2:1363514/100‑1 (MQ=255) tctcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAg < 1:1081445/100‑1 (MQ=255) ttttacgcctgatgttgctgctctcactggcaatcggtgtagtgctgacccgcacGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCa > 2:2941740‑M1/56‑100 (MQ=255) ttgcttgcttCCTCTGCCGGGACCGGGTTTCGGGCTGTTAACAGGTTGGGCTATTGGTGT‑‑‑CAGCTGGTGCGTTTAGCCTTTAGCAGCGTGCGGGTCAGCa < 1:1274655/98‑1 (MQ=255) tcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCa > 1:429043/1‑100 (MQ=255) tcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCa < 2:353014/100‑1 (MQ=255) gCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACt < 1:3597518/100‑1 (MQ=255) tttCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTac < 1:56383/100‑1 (MQ=255) tcttcctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTacac < 1:2630770/100‑1 (MQ=255) cctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGAt > 1:67218/1‑100 (MQ=255) ctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGAtt > 1:2103189/1‑100 (MQ=255) cttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGc > 2:2182407/1‑100 (MQ=255) tccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCa < 2:3125778/100‑1 (MQ=255) ggCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑TAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAg > 1:1616119/1‑98 (MQ=255) ggCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CTGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTg < 1:2360387/100‑1 (MQ=255) ggCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTg > 1:2897716/1‑100 (MQ=255) ggCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTg < 2:2685126/100‑1 (MQ=255) ggCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTg < 1:2215198/100‑1 (MQ=255) ggCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATGGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTg < 2:1114313/100‑1 (MQ=255) cACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTgag < 2:3419688/100‑1 (MQ=255) cACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTgag < 1:2503986/100‑1 (MQ=255) aCCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTgaga < 1:1547945/100‑1 (MQ=255) ccGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTgaga < 1:2707590/99‑1 (MQ=255) cGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagc < 2:390319/100‑1 (MQ=255) gTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACAACGATTGCCAGTGAGagcag > 1:2095509/1‑100 (MQ=255) tttGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagcagc < 2:3245689/100‑1 (MQ=255) tttGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagcagc < 2:2720393/100‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAAc > 2:3395802/1‑100 (MQ=255) gCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAAc > 1:1035295/1‑100 (MQ=255) gCTGGCAGTTACCACGGAGGGCCACGGCGGC‑‑‑CAGCGGGTGAGCTTACCCCGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGCTGGCCAGTGAGAGCAGCAAc < 1:1258853/100‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTGACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACa < 1:2360439/100‑1 (MQ=255) ggCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATc > 2:2277126/1‑100 (MQ=255) ggCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATc < 2:1523820/100‑1 (MQ=255) ggCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAATGAGAGCAGCAACATc > 1:2160943/1‑100 (MQ=255) gCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCa > 2:3526679/1‑100 (MQ=255) gTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGc < 1:1214829/100‑1 (MQ=255) ttAACAGGCAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCg < 1:838107/100‑1 (MQ=255) aaCAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCg > 1:867704/1‑98 (MQ=255) aaCAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTa < 1:3395775/100‑1 (MQ=255) cAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTaaa > 1:2944382/1‑100 (MQ=255) gAAGGGCGATGGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATg < 1:3560373/100‑1 (MQ=255) aGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCGAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGt > 2:86867/1‑99 (MQ=255) aGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGtt < 2:2035740/100‑1 (MQ=255) ggCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAg < 2:3533100/100‑1 (MQ=255) gCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgt > 1:329364/1‑100 (MQ=255) cGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtg < 2:173771/100‑1 (MQ=255) gATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtgg < 2:1579015/100‑1 (MQ=255) gcacgctgctacagggtaaacgcacccgctggcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtgg < 1:2941719‑M2/64‑1 (MQ=255) gcacgctgctacagggtaaacgcacccgctggcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtgg > 1:711694‑M2/37‑100 (MQ=255) gcacgctgctacagggtaaacgcacccgctggcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtgg > 1:711311‑M2/37‑100 (MQ=255) cacgctgctacagggtaaacgcacccgctggcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtggt > 1:3119062‑M2/36‑100 (MQ=255) CTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTa > 2:402704‑M1/1‑100 (MQ=255) CTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTa > 2:1849815‑M1/1‑100 (MQ=255) CTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTa > 2:329364‑M1/1‑100 (MQ=255) TGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACAGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTAt < 1:464644‑M1/100‑1 (MQ=255) GC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATc < 1:1747321‑M1/100‑1 (MQ=255) GC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATc < 2:294857‑M1/100‑1 (MQ=255) C‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATcc > 2:1777676‑M1/1‑100 (MQ=255) C‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGAACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATcc > 1:1062633‑M1/1‑100 (MQ=255) cAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCa < 2:2671194/100‑1 (MQ=255) cAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCa < 1:2199908/100‑1 (MQ=255) aGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCAc < 1:2917837/100‑1 (MQ=255) aGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCAc < 1:1849239/100‑1 (MQ=255) aGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCAc < 2:3388149/100‑1 (MQ=255) aGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCAc < 1:1849310/100‑1 (MQ=255) aGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCAc < 2:3030639/100‑1 (MQ=255) gCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCAcc < 2:3268767/100‑1 (MQ=255) gggTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTg > 2:1975643/1‑100 (MQ=255) ggTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGt > 2:2534137/1‑100 (MQ=255) ggTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGt < 1:122393/100‑1 (MQ=255) gTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGtt < 2:753318/100‑1 (MQ=255) gCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTgg < 2:1330004/100‑1 (MQ=255) gCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTgg < 2:557371/100‑1 (MQ=255) cGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTggg < 2:932035/100‑1 (MQ=255) cGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTggg > 1:2454282/1‑100 (MQ=255) gTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTCCAACGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGGGTTATCCACCTGTTGGGc < 1:573950/100‑1 (MQ=255) aCCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCg > 2:1819049/1‑100 (MQ=255) cccTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACTCCGATCGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTc < 1:2496504/98‑1 (MQ=255) cccTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCgg > 2:1618914/1‑100 (MQ=255) cTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTg < 1:2508826/100‑1 (MQ=255) gTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGc < 2:603150/100‑1 (MQ=255) tAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCg < 2:3106793/100‑1 (MQ=255) agcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGa > 1:2209769/1‑100 (MQ=255) gccgcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGCCGGAAAATGTTAATGGTGTTATCCACCTGCTGGGCTTCGGTGGCg > 1:1448876‑M2/6‑98 (MQ=255) gcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGTCGAg > 1:248782‑M2/6‑100 (MQ=255) gcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAg < 2:3625749‑M2/95‑1 (MQ=255) agcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCg < 2:2149046‑M2/97‑1 (MQ=255) gTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCGTAt > 1:3150208/1‑100 (MQ=255) gTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCGTAt < 1:1579090/100‑1 (MQ=255) | ACTCTTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGC‑‑‑CAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCGTAT > NC_000913/4624147‑4624344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |