| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,793,843 | IS2 (–) +5 bp | 100% | intergenic (‑160/‑140) | yibB ← / → hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 134 (1.090) | 76/178 | NT | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3793847 | 0 (0.000) | intergenic (‑164/‑140) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3793843 = | 0 (0.000) | 144 (1.170) | 84/178 | NT | 100% | intergenic (‑160/‑144) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
CTGTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACAT > NC_000913/3793744‑3793940 | tcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaa < 2:2276712‑M1/1‑1 (MQ=255)tcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaa < 2:1213680‑M1/1‑1 (MQ=255)tcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaa > 2:1638913‑M1/100‑100 (MQ=255) tGTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGAc > 1:511142/1‑100 (MQ=255) caatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAc > 1:2527158‑M1/99‑100 (MQ=255) gTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACt < 1:3100816/100‑1 (MQ=255) catctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGc < 1:3362371‑M1/6‑1 (MQ=255) attatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtg > 1:1080313‑M2/1‑98 (MQ=255) attatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtg < 2:2423246‑M2/100‑3 (MQ=255) ttatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtgg < 1:3321832‑M2/100‑4 (MQ=255) tctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTa < 2:158909‑M1/8‑1 (MQ=255) tatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtgga < 2:3340451‑M2/100‑5 (MQ=255) tatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtgg < 1:1379858‑M2/99‑4 (MQ=255) atCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggat > 2:514908‑M2/1‑95 (MQ=255) ttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAc > 1:1975370‑M1/89‑100 (MQ=255) tctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAcc > 2:28257‑M1/88‑100 (MQ=255) cATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATAGATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggattt > 1:1178745‑M2/1‑92 (MQ=255) cATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttg < 1:2847713‑M2/100‑9 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcc > 1:455701‑M2/1‑90 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcc > 2:115111‑M2/1‑90 (MQ=255) tccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCa < 2:1710375‑M1/15‑1 (MQ=255) taattagtctaaaaacaagtattaagactatcacttatttacgtgacattgcttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACt > 1:1509393‑M1/81‑99 (MQ=255) aTGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctat > 2:1341149‑M2/1‑85 (MQ=255) aTGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctat > 1:3298780‑M2/1‑85 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGt > 1:2289532‑M1/79‑100 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGt < 1:872560‑M1/22‑1 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttg < 1:2564247‑M1/25‑1 (MQ=255) cGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttcca > 2:654414‑M2/1‑78 (MQ=255) cGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttcca > 2:2129043‑M2/1‑78 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttgttg < 2:691036‑M1/28‑1 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGc > 2:1414219‑M1/72‑100 (MQ=255) tatttatCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagac > 1:1686345‑M2/1‑75 (MQ=255) tatttatCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccaaga < 2:2604968‑M2/100‑26 (MQ=255) aaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAAt > 1:2809353‑M1/69‑100 (MQ=255) aactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAAtt > 2:2564260‑M1/68‑100 (MQ=255) tatCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatct < 1:1319586‑M2/100‑30 (MQ=255) aTACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgtta > 1:2359808‑M2/1‑67 (MQ=255) aTACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACAGCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgtta > 1:2619085‑M2/1‑67 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCAtct < 1:1402101‑M1/40‑2 (MQ=255) cATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCAGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca < 2:72816‑M2/100‑37 (MQ=255) aaccaatatcacttaaataagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCtt < 1:1614547‑M1/42‑1 (MQ=255) accaatatcacttaaataagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTg < 2:2996992‑M1/43‑1 (MQ=255) aagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTg > 2:64167‑M1/58‑100 (MQ=255) cGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac > 2:2457101‑M2/1‑61 (MQ=255) agactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGc < 2:1790814‑M1/44‑1 (MQ=255) aatatcacttaaataagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtataACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCa < 1:1784016‑M1/45‑1 (MQ=255) ctatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCAcc < 1:2057807‑M1/47‑1 (MQ=255) aaTATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac > 2:1379864‑M2/1‑58 (MQ=255) atatTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc > 1:2218466‑M2/1‑57 (MQ=255) tatTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc > 1:72816‑M2/1‑56 (MQ=255) atTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccca < 2:1484541‑M2/100‑46 (MQ=255) atTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc < 2:1863416‑M2/99‑45 (MQ=255) cacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTa > 2:1539393‑M1/50‑100 (MQ=255) cacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTa < 2:925270‑M1/51‑1 (MQ=255) cacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTa > 1:158908‑M1/50‑100 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |