| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,793,843 | IS2 (–) +5 bp | 100% | intergenic (‑160/‑140) | yibB ← / → hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3793847 | 0 (0.000) | intergenic (‑164/‑140) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3793843 = | 0 (0.000) | 144 (1.170) | 84/178 | NT | 100% | intergenic (‑160/‑144) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
ATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATTCGTGT > NC_000913/3793748‑3793946 | attatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtg > 1:1080313‑M2/1‑98 (MQ=255) ttatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAg > 1:2146988/1‑97 (MQ=255) tatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtgg < 1:1379858‑M2/99‑4 (MQ=255) ttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAc > 2:1851242‑M1/89‑100 (MQ=255) ccATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggattt < 2:644522‑M2/100‑8 (MQ=255) cATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttg < 1:2970193‑M2/100‑9 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcc > 1:455701‑M2/1‑90 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcc > 2:681602‑M2/1‑90 (MQ=255) tccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCa > 1:277604‑M1/86‑100 (MQ=255) cAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccc < 1:2129032‑M2/100‑13 (MQ=255) cAAATGCTTCCGTTATTTATCATACACCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccc > 2:1330240‑M2/1‑88 (MQ=255) tgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTa < 2:579690‑M1/20‑1 (MQ=255) gCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatat > 1:195476‑M2/1‑83 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGt < 1:872560‑M1/22‑1 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGtt < 2:1750060‑M1/23‑1 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttg < 1:2036916‑M1/25‑1 (MQ=255) ccGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttcc > 1:1858938‑M2/1‑79 (MQ=255) cGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttcca > 2:1510123‑M2/1‑78 (MQ=255) cGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttcca < 2:3315468‑M2/100‑23 (MQ=255) gTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccag > 2:3241090‑M2/1‑77 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttgttg < 2:1176893‑M1/28‑1 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttgttg > 2:1709481‑M1/73‑100 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCa > 2:461803‑M1/71‑100 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCa < 1:2545284‑M1/30‑1 (MQ=255) ctagtattaacactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAg > 1:2252299‑M1/66‑100 (MQ=255) atCATACATCGGAATCTTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctg > 2:3368749‑M2/1‑70 (MQ=255) tagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGc > 1:1688019‑M1/65‑100 (MQ=255) aTACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACAGCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgtta > 1:2619085‑M2/1‑67 (MQ=255) gacaaccaatatcacttaaataagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATc < 2:1405548‑M1/39‑1 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCAtct < 1:1402101‑M1/40‑2 (MQ=255) aaccaatatcacttaaataagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCtt < 1:1614547‑M1/42‑1 (MQ=255) aTCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac < 1:2813325‑M2/100‑38 (MQ=255) aTCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac > 1:152706‑M2/1‑63 (MQ=255) accaatatcacttaaataagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTg < 2:2996992‑M1/43‑1 (MQ=255) agtatcacttaaataagtgatattggttgtctggagattcagagggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCAc < 2:2313558‑M1/46‑1 (MQ=255) ctatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCAcc > 1:1176889‑M1/54‑100 (MQ=255) aaTATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac > 2:1379864‑M2/1‑58 (MQ=255) atatTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc > 1:2218404‑M2/1‑57 (MQ=255) tatTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc < 1:1883563‑M2/100‑45 (MQ=255) tatTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc > 1:72816‑M2/1‑56 (MQ=255) atcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACctc > 2:1470268‑M1/52‑100 (MQ=255) cacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTa < 2:925270‑M1/51‑1 (MQ=255) cacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTa > 1:158908‑M1/50‑100 (MQ=255) gATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta > 1:524043‑M2/1‑52 (MQ=255) gATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta < 2:2499683‑M2/100‑49 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCACACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATg > 1:3372688‑M1/48‑100 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATg > 2:2827183‑M1/48‑100 (MQ=255) ttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGt > 1:2931645‑M1/47‑100 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |