| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3943635 | NA (NA) | 43 (0.340) | 21/164 | NT | 70.0% | intergenic (+125/‑69) | gltU/rrlC | tRNA‑Glu/23S ribosomal RNA of rrnC operon |
| ? | NC_000913 | = 4037446 | 20 (0.140) | intergenic (+111/‑73) | alaT/rrlA | tRNA‑Ala/23S ribosomal RNA of rrnA operon | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAgttgttc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3943537‑3943635‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTAC < NC_000913/4037446‑4037341 CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAG < 1:76784/100‑1CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAG > 2:1463514/1‑100CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAG < 2:912647/100‑1CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAG < 1:3307557/100‑1CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAG < 1:1376053/100‑1 TGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGT > 1:3677756/1‑100 TGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGT < 1:1211443/100‑1 GCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTT > 1:1081559/1‑100 GCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTT > 2:2827786/1‑100 GCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTT > 1:1115695/1‑100 CCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTG < 1:742043/100‑1 CCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTG < 2:2410171/100‑1 CTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGT > 1:3512692/1‑100 TTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTT > 2:1264296/1‑100 TTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTT > 2:732471/1‑100 TTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTT > 1:3552030/1‑100 TAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC < 2:2125081/100‑1 TAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC > 2:2985261/1‑100 TAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC > 2:2980502/1‑100 AATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC > 1:3251544/1‑99 ATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTTTCGTTGTTCAG < 2:2844374/100‑1 ATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCGAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTCTCGTTGTTCAGTG < 1:2677654/100‑1 ATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTTTCGTTGTTCAGTG < 2:721308/100‑1 ATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTTTCGTTGTTCAGTG < 2:289322/100‑1 TCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCCAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAACGCTGTTCAGTGT > 2:2421854/1‑100 TCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACCGAACAACTCTCGTTGTTCAGTGT < 2:2632772/100‑1 TCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAACTGAAAATTGAAACACCGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTT < 1:1685015/100‑1 AAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACCGAACAACTCTCGTTGTTCAGTGTTTC < 1:1794713/99‑1 AACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAAT < 2:2969087/100‑1 CTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTT < 2:3386649/100‑1 GGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACCGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGAT < 2:3753926/100‑1 TGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTCTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCC < 2:420138/100‑1 TGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAGAGTAGTTCCGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCC > 1:182856/1‑100 GAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACCGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTT < 1:275954/100‑1 ATATTTGCTCTTTAAAAATCTTGAGCAAGCTGAAAATTGAAACACCGAACAACTCTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAA < 1:3045450/100‑1 AAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTA > 2:2379978/1‑100 AAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTAC > 1:1388606/1‑100 AATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACA > 1:1820202/1‑100 AATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC‑GTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACAC > 2:1961501/1‑100 ATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCAAAATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACA > 1:2281008/1‑99 TGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTC > 1:523520/1‑100 AAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTG > 2:794859/1‑100 AACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAATAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGA > 1:2815173/1‑100 AACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGA > 1:2816451/1‑100 AACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGA > 2:574729/1‑100 AACACTGAACAACGAAAGTTGTTC‑GTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAA > 2:3811638/1‑100 ACACTGAACAATGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAA > 2:3329405/1‑100 ACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAA > 2:2769856/1‑100 ACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAA < 1:794852/100‑1 CACTGAACAATGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCTGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAG > 1:2059054/1‑100 CACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAG > 2:877941/1‑100 CACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAG > 2:1332814/1‑100 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ttttGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCTCAGTTAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATT < 1:3788937/96‑1 tttaTTGTTCAGTGTTTTAATTTTCAGCTTTATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAATTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTT < 2:252735/96‑1 GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTACAGAGCAAGACTTCTCGGTAAACCTTATCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAc > 1:2704858/1‑99 GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAT < 1:2181940/100‑1 GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAT < 1:3252822/100‑1 GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAT < 2:126840/100‑1 GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAA < 1:1299944/99‑1 GTTGTTCACTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTGTCAGGTAAAATCTAAAGTATTTTTTATTTAAT > 1:772634/1‑100 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |