| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4515778 | 135 (0.980) | 9 (0.070) | 6/166 | NT | 6.4% | coding (900/2325 nt) | fecA | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer; ferric citrate extracelluar receptor; FecR‑interacting protein |
| ? | NC_000913 | = 4515794 | 139 (1.080) | coding (884/2325 nt) | fecA | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer; ferric citrate extracelluar receptor; FecR‑interacting protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCC > NC_000913/4515696‑4515892 | gCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTAGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAg < 1:596426‑M2/100‑2 (MQ=255) cACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgc < 1:2745171‑M2/100‑3 (MQ=255) aCCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGGGTAGAGCAgcg < 1:3382501‑M2/100‑4 (MQ=255) aCCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCACGCGCGGCAGTGACTGGCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAg > 2:2064080‑M2/1‑99 (MQ=255) cTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgcgcg > 1:3774032‑M2/1‑95 (MQ=255) tCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGc > 2:608607/1‑100 (MQ=255) tCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGc < 2:2094109/100‑1 (MQ=255) cGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCa < 1:686742/100‑1 (MQ=255) cgcATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGTGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCTCGGGGCCaaaa < 1:2030117/100‑1 (MQ=255) cATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAAcc < 1:651631/100‑1 (MQ=255) tatTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGt > 1:1522486/1‑100 (MQ=255) tatTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGt > 2:3255928/1‑100 (MQ=255) tttGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTg < 2:3570817/100‑1 (MQ=255) tttGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTg < 2:1353179/100‑1 (MQ=255) tttGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTg < 2:2974235/100‑1 (MQ=255) ttGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTg < 2:2297783/99‑1 (MQ=255) tGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTc > 2:3096981/1‑100 (MQ=255) ccgatctCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCGGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTc < 2:1016837/94‑1 (MQ=255) cTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCg > 1:2944457/1‑100 (MQ=255) cTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCg > 2:1868511/1‑100 (MQ=255) cTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCg < 2:1420837/100‑1 (MQ=255) cTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAAACGTTGTc > 1:3335353/1‑98 (MQ=255) ttttCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGc < 2:2745193/100‑1 (MQ=255) ttttCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGc > 1:1813735/1‑100 (MQ=255) ttCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCtg < 2:569461/100‑1 (MQ=255) cAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTcagatcgg > 1:1016829/1‑93 (MQ=255) cATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgccg < 2:32532/100‑1 (MQ=255) aTCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgccgc > 1:1347149/1‑100 (MQ=255) aTCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgccgc > 1:100467/1‑100 (MQ=255) ggTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCccac > 2:939471/1‑100 (MQ=255) ggTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCccac > 2:3380366/1‑100 (MQ=255) gtcgtcGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCccacc < 2:2837056/100‑1 (MQ=255) cgtcgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCAt > 2:3620696/1‑100 (MQ=255) tcgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGGGCGTGCCGGGGTAGGGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTGGGCCGCTGTGCCGCccacc > 1:369927/1‑96 (MQ=255) gATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGTCGCGCGGACCGGAGGAGAGCAGCGCGTTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGGGCCGCCCACCATCAgg > 1:2246059/1‑100 (MQ=255) cGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTtgt > 1:398962/1‑100 (MQ=255) gactGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTtgtg > 2:1120407/4‑100 (MQ=255) gTGGGGCTGTGCTCGCGG‑‑CAGTCACGGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCg < 1:663289/100‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGTGCTCCCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCg < 1:3856909/100‑1 (MQ=255) ggCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGtc > 1:1105720/1‑100 (MQ=255) cgcTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGtctc < 1:457028/100‑1 (MQ=255) gcTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTctct < 2:37548/100‑1 (MQ=255) gcTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTctct < 2:106641/100‑1 (MQ=255) gtgCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCtt > 1:432502/1‑98 (MQ=255) tgCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCg > 1:2113349/1‑100 (MQ=255) gCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCgg > 1:360583/1‑100 (MQ=255) gCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCgg > 2:552075/1‑100 (MQ=255) gCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCACCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCgg > 2:549196/1‑100 (MQ=255) cTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCggg > 2:2929667/1‑100 (MQ=255) cTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCggg < 2:3062845/100‑1 (MQ=255) cTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCggg > 2:313246/1‑100 (MQ=255) cTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGATGTGCGTCTCTTTCggg > 1:1267479/1‑100 (MQ=255) cgcgC‑‑CAGTCACCGCCGCGCGTGCCGGAGTACAGCAGCGCGGTGCAAAAACCGTGGTCCGCTGTGCCGCACACCATCAGGTTGTGCGGCTCTTCCgg > 1:1526109/1‑97 (MQ=255) gcgc‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGgttg < 2:1288260/100‑1 (MQ=255) gcgc‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGgttg < 2:354830/100‑1 (MQ=255) cAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGtttt < 2:140147/100‑1 (MQ=255) aGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTtg < 2:34695/100‑1 (MQ=255) aGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTtg < 2:2494327/100‑1 (MQ=255) gTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGtttt > 1:3207659/1‑98 (MQ=255) gTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTtgt > 2:925722/1‑100 (MQ=255) tCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAATCCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTtgtg < 1:2339737/100‑1 (MQ=255) tCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTtgtg < 2:3715274/100‑1 (MQ=255) tCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTtgtg < 1:232692/100‑1 (MQ=255) aCTGCCGCGCGTGCCGGGGTAGAGCAgcgcggcagtgactggcgcgagcacagcgccacccgcatcgacggcctgatgctgaaaagcaaatatgcgccgg < 1:951277‑M2/100‑75 (MQ=255) cTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgcgcggcagtgactggcgcgagcacagcgccacccgcatcgacgacctgatgctgaaaagcaaatatgcgccgga < 2:1674455‑M2/100‑76 (MQ=255) cTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAag < 1:1200722/100‑1 (MQ=255) tGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGaaca < 2:2611871/100‑3 (MQ=255) gCCGCGCGTGTCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGCTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAagag < 1:2526913/100‑1 (MQ=255) gCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgcgcggcagtgactggcgcgagcacagcgccacccgcatcgacgacctgatgctgaaaaacaaatatgcgccggatg < 2:290225‑M2/100‑78 (MQ=255) gCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAagag > 1:3654895/1‑100 (MQ=255) ccGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAagagn < 2:1036989/100‑2 (MQ=255) ccGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAgg < 1:2016375/100‑1 (MQ=255) ccGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAgg < 2:1111097/100‑1 (MQ=255) cgcgcgTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGt < 2:2745009/100‑1 (MQ=255) gcgcgTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGtt < 2:398968/100‑1 (MQ=255) gcgTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTgg < 2:3847998/100‑1 (MQ=255) gcgGGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAGGACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACGATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTgg < 1:297213/100‑1 (MQ=255) cgTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTggg > 1:2275891/1‑100 (MQ=255) gTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAGAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCGACGATCAGGGTGTGCGTCTCTATAGGAGTGTTTTGTGAAGAGGCTGGgc > 1:2403891/1‑100 (MQ=255) gCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctg > 2:2885433/1‑100 (MQ=255) ncGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctga > 1:1693523/2‑100 (MQ=255) ccGGAGTATAGCAGCGCGGAGCCAAAACCGTTTTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctg < 1:3340999/99‑1 (MQ=255) ccGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctga > 2:1372499/1‑100 (MQ=255) ccGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCAGCAGGCTGTGCGTCCCTTTCGGGTTGCTTTGTGAATAGGTTGGgctga > 1:262224/1‑100 (MQ=255) ggAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctgagc < 2:579640/100‑1 (MQ=255) ggAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctgagc < 2:2348434/100‑1 (MQ=255) ggAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGATGGgctgagc > 1:2523618/1‑100 (MQ=255) gAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctgagct > 2:2171641/1‑100 (MQ=255) gAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctgagct < 1:2907665/100‑1 (MQ=255) gAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctgagct < 1:3491878/100‑1 (MQ=255) gTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctgagctga < 2:2386029/100‑1 (MQ=255) agagCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGAcc < 1:1287322/100‑1 (MQ=255) gagCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCt > 2:3240485/1‑100 (MQ=255) gagCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCt > 2:3763803/1‑100 (MQ=255) gagCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCt < 2:1340785/100‑1 (MQ=255) gagCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCt > 2:1174954/1‑100 (MQ=255) gcagcGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTc > 2:58883/1‑100 (MQ=255) gcagcGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTc > 1:3010450/1‑100 (MQ=255) cagcGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTcc > 2:1553531/1‑100 (MQ=255) cagcGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTCTTGTGAAGAGGTTGGGTTGAGCTGACCTTcc > 1:2918492/1‑100 (MQ=255) | GCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGC‑‑CAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCC > NC_000913/4515696‑4515892 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |