| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4548883 = | 132 (1.030) | 8 (0.070) | 5/160 | NT | 6.6% | coding (76/903 nt) | fimH | minor component of type 1 fimbriae |
| ? | NC_000913 | 4548916 = | 109 (0.950) | coding (109/903 nt) | fimH | minor component of type 1 fimbriae | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
GCTGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGATC > NC_000913/4548784‑4548982 | gCTGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTaaaa > 2:1569546/1‑100 (MQ=255)gCTGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTaaaa > 1:828409/1‑100 (MQ=255) taatcgttatggcaaaagatttgcgtcgaaagatccacgaccagggtttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccAc < 2:2864590‑M1/2‑1 (MQ=255) aatcgttatggcaaaagatttgcgtcgaaagatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccAcc > 1:1882773‑M1/98‑100 (MQ=255) atcgttatggcaaaagatttgcgtcgaaagatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCg < 2:2547929‑M1/4‑1 (MQ=255) cgttatggcaaaagatttgcgtcgaaagatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGcc < 2:1652859‑M1/6‑1 (MQ=255) cgttatggcaaaagatttgcgtcgaaagatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGcc > 2:1413354‑M1/95‑100 (MQ=255) aCCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGcc > 2:3101433/1‑100 (MQ=255) gttatggcaaaagatttgcgtcgaaagatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCa > 2:2041738‑M1/94‑100 (MQ=255) cccGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCa > 2:1161853/1‑100 (MQ=255) ccGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTTGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCa > 1:1355319/1‑99 (MQ=255) cGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAAt < 2:439732/100‑1 (MQ=255) gatgatTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTAcc > 2:1100885/1‑100 (MQ=255) gatgatTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTAcc > 2:782459/1‑100 (MQ=255) tgatTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTTGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCg > 1:2705706/1‑99 (MQ=255) gatTGTCATGAACCGAGTTATTAACCTGTGTGCTGCACCGCTGATGGGCTGGTCGGCACCTGCCCGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGc < 1:3542206/99‑1 (MQ=255) ttGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTAt > 1:1509080/1‑100 (MQ=255) ttGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCATGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTAt > 1:3086391/1‑100 (MQ=255) tGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATc < 2:232271/100‑1 (MQ=255) aaTGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCt > 2:3189345/1‑100 (MQ=255) aTGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTa > 2:787949/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTg < 2:1176732/100‑1 (MQ=255) aaaCGAGTTAGTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTg < 1:2345154/100‑1 (MQ=255) aaCGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTgg > 2:1947721/1‑100 (MQ=255) aCGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAATCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGc < 2:613648/100‑1 (MQ=255) gatgcacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccATCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGt > 1:2115579‑M1/68‑100 (MQ=255) gatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGt > 1:2674649‑M1/68‑100 (MQ=255) gTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTg < 2:1459849/100‑1 (MQ=255) gTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTg > 2:2073547/1‑100 (MQ=255) gTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTg < 1:3419182/100‑1 (MQ=255) gTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTg < 1:1655282/100‑1 (MQ=255) atccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTg > 2:1045‑M1/67‑100 (MQ=255) atccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTg > 1:2285968‑M1/67‑100 (MQ=255) ttattaCCCTGTTTGCTTTACTGTTGAGGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATTGTACCGCTATCCCTATTGGCg < 1:1702475/96‑1 (MQ=255) ttattaCCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTgg > 2:235516/1‑100 (MQ=255) tattaCCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGc > 1:1515346/1‑100 (MQ=255) tattaCCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGc < 2:2821469/100‑1 (MQ=255) tattaCCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGGAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGc < 1:840695/100‑1 (MQ=255) ccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGc > 1:1230106‑M1/65‑100 (MQ=255) cacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCa > 1:2229564‑M1/64‑100 (MQ=255) attaCCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCa < 2:1268700/100‑1 (MQ=255) attaCCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCa > 2:19164/1‑100 (MQ=255) aCCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAgcg > 1:3453646/1‑100 (MQ=255) aCCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAgcg > 2:2353024/1‑100 (MQ=255) cccTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAgcgc > 2:643007/1‑100 (MQ=255) cccTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAgcgc > 2:1011639/1‑100 (MQ=255) ccTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGcc < 2:1407951/100‑1 (MQ=255) ccTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGcc > 2:1541838/1‑100 (MQ=255) cTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCa > 1:3221865/1‑100 (MQ=255) tGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCTGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGcc < 1:1346076/98‑1 (MQ=255) gTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAAt < 1:19164/100‑1 (MQ=255) ttGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGt < 2:828413/100‑1 (MQ=255) ttGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGt > 2:2182277/1‑100 (MQ=255) tGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGCTGCCACCGCCAAtagg < 2:1797271/100‑4 (MQ=255) tGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGCTGCCACCGCCAAtagg < 2:3509072/100‑4 (MQ=255) gCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGttt > 2:653079/1‑100 (MQ=255) gCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGttt > 2:184274/1‑100 (MQ=255) gCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGCTGCCACCGCCAAtagg < 1:87505/99‑4 (MQ=255) cTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTa < 1:337298/100‑1 (MQ=255) gTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATg < 2:2982144/100‑1 (MQ=255) gTACTGCTGATGGGCTGGTCAGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATg < 1:893017/100‑1 (MQ=255) aCTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTa > 1:3296645/1‑100 (MQ=255) ctgctgATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTaa > 1:528251/1‑100 (MQ=255) gctgATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCCATGTTTATGTAAAc > 2:971928/1‑100 (MQ=255) gctgATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTaaaa > 1:3538727/1‑99 (MQ=255) ctgATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAAcc < 1:2073536/100‑1 (MQ=255) ctgATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAAcc < 1:2539511/100‑1 (MQ=255) ctgATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAAcc > 2:2621419/1‑100 (MQ=255) ctgATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCACTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAAcc > 1:54165/1‑100 (MQ=255) tgATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCt > 2:2164483/1‑100 (MQ=255) aTGTGCTGGTCGGTAATTGCCTGGTCATTCGCCTGTAAATCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTg < 1:1569204/100‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCACTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTgcg < 1:1939055/100‑1 (MQ=255) ggTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTg > 2:726309/1‑100 (MQ=255) aaTGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAAtg > 1:1694656/1‑100 (MQ=255) tGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATAGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAAtg < 1:1389445/98‑1 (MQ=255) ccTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTggg < 1:2950548/100‑1 (MQ=255) ccTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTggg < 2:3544418/100‑1 (MQ=255) ccTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTggg > 2:2670587/1‑100 (MQ=255) ccTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTggg < 1:2595006/100‑1 (MQ=255) cTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTgggg < 1:775859/100‑1 (MQ=255) tGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGc > 2:1198760/1‑100 (MQ=255) ggTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCa > 2:2946154/1‑100 (MQ=255) ttCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAAcc > 1:2463117/1‑100 (MQ=255) cGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAACCCTg > 1:2864571/1‑100 (MQ=255) cGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTg > 1:3186203/1‑100 (MQ=255) cGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTg > 1:1003071/1‑100 (MQ=255) ccTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGt > 2:1806488/1‑100 (MQ=255) tGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCg > 1:1218839/1‑100 (MQ=255) gTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGTCAGCACCAATGTTTATGTAAACCTTGCTCCCGTCGTGAATGTGGTGCAAAACCTGGGCGt > 1:675456/1‑100 (MQ=255) gTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGt > 2:916951/1‑100 (MQ=255) aaaaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTgg > 1:1435102/1‑100 (MQ=255) aaaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGa < 2:3295128/100‑1 (MQ=255) aaaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGa < 1:248933/100‑1 (MQ=255) aaaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGa > 2:2691600/1‑100 (MQ=255) aaaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGa > 1:107306/1‑100 (MQ=255) aaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAATCCGTGCGCGCGTCGTGAAGGTGGGGCAAAACCTGGTCGTgg < 1:619874/98‑1 (MQ=255) aaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTgg > 2:159096/1‑98 (MQ=255) aaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGAt > 2:2202013/1‑100 (MQ=255) ACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGATc < 1:100705‑M1/100‑1 (MQ=255) ACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGGTGATGTAAAGCTTACGCCCGTCGGGAATCTGGAGCAAAACCTGGTCGTGGATc < 1:2268521‑M1/100‑1 (MQ=255) | GCTGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGATC > NC_000913/4548784‑4548982 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |