| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1436228 | 48 (0.550) | 11 (0.140) | 8/162 | NT | 19.7% | coding (666/1134 nt) | ompN | outer membrane pore protein N, non‑specific |
| ? | NC_000913 | = 1436244 | 46 (0.580) | coding (650/1134 nt) | ompN | outer membrane pore protein N, non‑specific | |||||
TGCCAGGTAAATATTGTTAGCATCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATGGCGAACATCACG > NC_000913/1436129‑1436326 | gaaggcaccaacaacggacgtgatgttcgccatgaaaacggtgacggctggggtctttccacaacatatgatttaggcatgggctttagcgcTGGTGCgg > 1:1535028‑M1/93‑100 (MQ=255) ccAGGTAAATATTGTTAGCATCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTc > 2:1714955/1‑100 (MQ=255) ccAGGTAAATATTGTTAGCATCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGAAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGt > 1:858906/1‑99 (MQ=255) cAGGTAAATATTGTTAGCATCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCa > 2:60072/1‑100 (MQ=255) ggTAAATATTGTTGGCATCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCaga < 2:399348/100‑1 (MQ=255) atatTGTTAGCATCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAgg < 1:2225949/100‑1 (MQ=255) atTGTTAGCATCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGgtg < 1:799869/100‑1 (MQ=255) gTTAGCATCGTATTTTAGCACAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATAACAACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTAt > 2:1831804/1‑100 (MQ=255) aGCATCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGcatacacctcttctgacc < 1:7032‑M1/100‑19 (MQ=255) cATCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgc > 1:959276‑M2/1‑96 (MQ=255) aTCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgca < 1:2373623‑M2/100‑6 (MQ=255) aTCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgca > 1:2068292‑M2/1‑95 (MQ=255) aTCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgca > 2:1177306‑M2/1‑95 (MQ=255) aTCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgca < 2:854449‑M2/100‑6 (MQ=255) aTCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgca < 1:1394415‑M2/100‑6 (MQ=255) tCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGcatacacctcttctgaccgcac < 2:2057861‑M1/100‑23 (MQ=255) tCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgc < 2:1475256‑M2/98‑5 (MQ=255) tCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGGGCGGcatacacctcttctgaccgcac < 1:1457474‑M1/100‑23 (MQ=255) cGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGcatacacctcttctgaccgcacc < 1:2253684‑M1/100‑24 (MQ=255) cGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGcatacacctcttctgaccgcacc < 1:317691‑M1/100‑24 (MQ=255) gTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGcatacacctcttctgaccgcacca < 1:1467870‑M1/100‑25 (MQ=255) gTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgcacca < 2:1641687‑M2/100‑9 (MQ=255) ttcgccatgaaaacggtgacggctggggtctttccacaacatatgatttaggcatgggctttagcgcTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAg > 1:1369534‑M1/68‑100 (MQ=255) tATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAg < 1:112365/100‑1 (MQ=255) tATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAg > 1:1776302/1‑100 (MQ=255) tcgccatgaaaacggtgacggctggggtctttccacaacatatgatttaggcatgggctttagcgcTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAgc > 1:729536‑M1/67‑100 (MQ=255) aTTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAgc < 1:2191329/100‑1 (MQ=255) aTTTTAGCCAAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaat < 1:989181‑M1/100‑27 (MQ=255) ttttAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatg < 1:1049990‑M1/100‑28 (MQ=255) ttttAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAgcg > 1:154576/1‑100 (MQ=255) tttAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatga < 1:892720‑M1/100‑29 (MQ=255) tttAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatga < 1:985178‑M1/100‑29 (MQ=255) tttAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAgcgc < 2:432840/100‑1 (MQ=255) tttAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAgcgc < 1:2084719/100‑1 (MQ=255) ccatgaaaacggtgacggctggggtctttccacaacatatgatttaggcatgggctttagcgcTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCt > 1:2215787‑M1/64‑100 (MQ=255) ccatgaaaacggtgacggctggggtctttccacaacatatgatttaggcatgggctttagcgcTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCt > 1:1972865‑M1/64‑100 (MQ=255) cagcagTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGcc > 1:1697243/1‑100 (MQ=255) cagcagTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGcc < 1:1048990/100‑1 (MQ=255) gcagTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCa > 1:1067260/1‑100 (MQ=255) agTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatgaccaggttaacc < 1:1776059‑M1/100‑40 (MQ=255) gTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGc > 1:1581069/1‑100 (MQ=255) tCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGcc < 1:860900/100‑1 (MQ=255) cACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGGAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTa > 1:214750/1‑100 (MQ=255) cttCTGCTTTATCCCCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAACGCCCATGCCTAAATc < 1:18259/98‑1 (MQ=255) tCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCat > 2:2232475/1‑100 (MQ=255) tCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGCTCATTGGTGCGGTCAGAAGCGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCat < 2:1305793/100‑1 (MQ=255) cTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCata < 2:304485/100‑1 (MQ=255) gCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATAtg < 2:613553/100‑1 (MQ=255) tttATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATAtgtt > 2:2364397/1‑100 (MQ=255) tATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATAtgttgt < 1:1747221/100‑1 (MQ=255) aTCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCGAAATCATAtgttggg > 2:1794506/1‑98 (MQ=255) tCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTTGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCAATGCCTAAATCATATGTTGTgg > 2:1961531/1‑100 (MQ=255) caccacCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGa > 2:1301558/1‑100 (MQ=255) caccacCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGa > 1:1042030/1‑100 (MQ=255) caccacCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGa > 2:2316658/1‑100 (MQ=255) caccacCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGCCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGa > 2:1819207/1‑100 (MQ=255) accaccCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGaa > 1:2045278/1‑100 (MQ=255) accaccCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCAATGCCTAAATCATATGTTGTGGaa > 1:1297416/1‑100 (MQ=255) ccaccCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGaaa > 1:948399/1‑100 (MQ=255) ccaccCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGaaa < 2:1599416/100‑1 (MQ=255) caccCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAg < 2:2137311/100‑1 (MQ=255) accCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGa > 1:55189/1‑100 (MQ=255) gccgcAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGAcccc < 1:1994452/100‑1 (MQ=255) cgcAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAg < 1:1301572/100‑1 (MQ=255) cAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGcc > 1:1025252/1‑100 (MQ=255) ggTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggact < 1:1776059‑M2/100‑62 (MQ=255) tAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGtt < 1:1200733/100‑1 (MQ=255) aaCCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGttt > 2:2294933/1‑100 (MQ=255) ccTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTc > 2:100092/1‑100 (MQ=255) cTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCa < 1:964832/100‑1 (MQ=255) ggTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCAt > 1:138068/1‑99 (MQ=255) ggTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATg < 2:1228001/100‑1 (MQ=255) gTCATTGGTGCGGTCATAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATgg < 2:1953812/100‑1 (MQ=255) gTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATgg < 1:49456/100‑1 (MQ=255) gTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATgg > 2:1779971/1‑100 (MQ=255) tCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaa < 1:985178‑M2/100‑73 (MQ=255) tCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaa < 1:892720‑M2/100‑73 (MQ=255) tCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATGGc < 1:1594066/100‑1 (MQ=255) tCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATGGc < 2:1201567/100‑1 (MQ=255) cATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaa < 1:1049990‑M2/100‑74 (MQ=255) aTTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgcttggctaaaat < 1:989181‑M2/100‑75 (MQ=255) tGGTGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatac < 2:1641687‑M1/100‑93 (MQ=255) tGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatac < 1:1467870‑M2/100‑77 (MQ=255) ggTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacg < 1:2253684‑M2/100‑78 (MQ=255) ggTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacg < 1:317691‑M2/100‑78 (MQ=255) GGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATGGCGAACa < 1:639443‑M1/100‑1 (MQ=255) GGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATGGCGAACa > 1:1841690‑M1/1‑100 (MQ=255) GGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATGGCGAACa < 1:905784‑M1/100‑1 (MQ=255) gTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgccccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacga < 1:1457474‑M2/100‑79 (MQ=255) gTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacga < 2:2057861‑M2/100‑79 (MQ=255) GTGCGGTCAGAAGAGGTGTATACCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCATAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATGGCGAACAt < 2:981181‑M1/100‑1 (MQ=255) tGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacgat > 2:1177306‑M1/1‑5 (MQ=255) tGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacgat < 1:2373623‑M1/100‑96 (MQ=255) tGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacgat > 1:2068292‑M1/1‑5 (MQ=255) tGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacgat < 2:854449‑M1/100‑96 (MQ=255) tGCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacgat < 1:1394415‑M1/100‑96 (MQ=255) gCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacgatg > 1:959276‑M1/1‑4 (MQ=255) gCGGcatacacctcttctgaccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacga < 2:1475256‑M1/98‑95 (MQ=255) GCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATGGCGAACATCa > 1:1921235‑M1/1‑100 (MQ=255) ggTCAGAAGAGGTGTATGccgcaccaatgaccaggttaaccatactgcggcgggtggtgataaagcagacgcgtggactgctgggctaaaatacgatgct < 1:7032‑M2/100‑83 (MQ=255) | TGCCAGGTAAATATTGTTAGCATCGTATTTTAGCCCAGCAGTCCACGCGTCTGCTTTATCACCACCCGCCGCAGTATGGTTAACCTGGTCATTGGTGCGGTCAGAAGAGGTGTATGCCGCACCAGCGCTAAAGCCCATGCCTAAATCATATGTTGTGGAAAGACCCCAGCCGTCACCGTTTTCATGGCGAACATCACG > NC_000913/1436129‑1436326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |