| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4584195 = | 122 (1.130) | 15 (0.150) | 7/164 | NT | 11.9% | coding (2567/3513 nt) | hsdR | endonuclease R Type I restriction enzyme |
| ? | NC_000913 | 4584232 = | 109 (1.100) | coding (2530/3513 nt) | hsdR | endonuclease R Type I restriction enzyme | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCA > NC_000913/4584096‑4584294 | tgcgtaaagtacgcagccgcattctgtacgaacagatgaaaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactg < 1:19642‑M1/1‑1 (MQ=255)tgcgtaaagtacgcagccgcattctgtacgaacagatgaaaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactg < 2:2176987‑M1/1‑1 (MQ=255)cGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATgg < 2:63327/100‑1 (MQ=255)cGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATgg < 1:2536113/100‑1 (MQ=255)cGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATgg > 1:210791/1‑100 (MQ=255)cGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATgg < 2:2521607/100‑1 (MQ=255) gcgtaaagtacgcagccgcattctgtacgaacagatgaaaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactgt < 1:2010368‑M1/2‑1 (MQ=255) gCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGgtg > 1:897359/1‑100 (MQ=255) cgtaaagtacgcagccgcattctgtacgaacagatgaaaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactgt > 2:342720‑M1/98‑99 (MQ=255) cATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTc < 1:790699/100‑1 (MQ=255) tCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGa > 2:2864510/1‑100 (MQ=255) ccGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGATTTGTTAATTTCATTGACCAGTGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGAc < 1:99693/100‑1 (MQ=255) cGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCGCACTTCGGGCGCACAACCACCGGACGCATgggcccgac > 2:1748755/1‑92 (MQ=255) cTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGct > 2:2185425/1‑100 (MQ=255) tCGGTGATTTTATAGGTTTCTGTATCTGTAATTTCATTGACCAGCTTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGctct < 1:2574858/100‑1 (MQ=255) tCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGctct > 2:226950/1‑100 (MQ=255) cGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGCcgccgccccc > 2:2124972/1‑96 (MQ=255) ggTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTcc < 2:2900917/100‑1 (MQ=255) tGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAg < 2:2609806/100‑1 (MQ=255) aTTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCA‑‑A‑CACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGc < 1:2801675/100‑1 (MQ=255) tataGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCt < 2:236582/100‑1 (MQ=255) tataGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCt < 1:2373586/100‑1 (MQ=255) ataGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCt > 2:843305/1‑99 (MQ=255) taGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACTACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGt < 2:2782848/100‑1 (MQ=255) taGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGt < 2:2475885/100‑1 (MQ=255) aGGTTTCTGAATCGGTATTTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTGCCGGCGCACCACCACCGTACGCATGTTGTCGTTGCTCTCCAGCGTGCTGt < 2:2872822/99‑1 (MQ=255) ggTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCATCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAg < 2:1607980/100‑1 (MQ=255) ggTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAg > 2:523965/1‑100 (MQ=255) ggTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAg < 2:2629766/100‑1 (MQ=255) ggTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCAACGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTa < 1:678076/99‑1 (MQ=255) gTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGATCAGCGTTTGCAGTTCTACCTTCGGGCGCACCACAACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGa < 1:918031/100‑1 (MQ=255) tttCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGa < 1:601174/99‑1 (MQ=255) acagatgaaaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATc > 2:1488250‑M1/69‑100 (MQ=255) tgatttgttAATTTCTTTGACCAGCGTTTGCAGTTCTACCTTCGGGCGGAGAACCACCGGATGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCg < 2:787335/92‑1 (MQ=255) gTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGt < 1:2168582/100‑1 (MQ=255) aaggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGt > 2:2593206‑M1/61‑100 (MQ=255) aggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTc > 1:2922747‑M1/60‑100 (MQ=255) aggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTc > 2:2175175‑M1/60‑100 (MQ=255) aggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTc > 2:2072841‑M1/60‑100 (MQ=255) ggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagctttttgactGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTc > 2:598736‑M1/59‑99 (MQ=255) ggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCa > 1:2871431‑M1/59‑100 (MQ=255) ggccgcgccacgcgcttatgcccggaggtgaataaaaccagctttaagatttttgactGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCa > 1:2345093‑M1/59‑100 (MQ=255) aaTTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCa > 2:1522691/1‑100 (MQ=255) tttCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCTACACAGTcca > 2:1536624/1‑97 (MQ=255) tttCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCaaa > 1:1211915/1‑100 (MQ=255) aTTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCATCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATc < 1:523968/100‑1 (MQ=255) tGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCtt > 1:1866351/1‑100 (MQ=255) gACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACGGTCCAAAATCCTa > 2:612193/1‑100 (MQ=255) gACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTa > 1:1774109/1‑100 (MQ=255) gACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTa > 2:442311/1‑100 (MQ=255) gACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTa > 2:1958872/1‑100 (MQ=255) ccAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTaaa > 2:1060199/1‑100 (MQ=255) ccAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTaaa < 2:1455030/100‑1 (MQ=255) cAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTaaa < 1:1866235/99‑1 (MQ=255) aGCGTTTGCAGTTCCACCTTCTGGCGCATCTCCATCGGACTCATAGTGTCGACGCTCACCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAg < 1:893263/99‑1 (MQ=255) aGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGc > 1:3027931/1‑100 (MQ=255) tttGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGt < 1:297845/100‑1 (MQ=255) tggCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTTTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGtt < 2:1668230/98‑1 (MQ=255) tGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGttt < 2:1909065/100‑1 (MQ=255) tGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGttt > 1:1307714/1‑100 (MQ=255) gCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGtttt > 2:344192/1‑100 (MQ=255) cAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTa > 2:384730/1‑100 (MQ=255) cAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTa > 1:1568106/1‑100 (MQ=255) cAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTa > 2:576737/1‑100 (MQ=255) aGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTAt < 1:2963697/100‑1 (MQ=255) ttCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTc < 1:384733/100‑1 (MQ=255) tCCAGCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCACGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCa < 2:1205946/100‑1 (MQ=255) tCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCa < 2:2336336/100‑1 (MQ=255) tCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCa > 1:1018483/1‑100 (MQ=255) cACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCAcc < 2:787740/100‑1 (MQ=255) ccTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTc > 1:965554/1‑100 (MQ=255) cGGGCGCACCACCTCCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCggg < 1:2692723/100‑1 (MQ=255) gggCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGc > 1:1070630/1‑100 (MQ=255) ggCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCa < 2:390896/100‑1 (MQ=255) cgcACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATa > 1:2367657/1‑100 (MQ=255) gcACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATaa > 1:489390/1‑100 (MQ=255) caccaccacCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACTCAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCAGCTCCGGGCATAAg > 1:2158029/1‑100 (MQ=255) caccaccacCGGACGAATGGAGTCGACGCTCTAAAGCGAGCTGAAGAAATCGAAACAGTCAAAAATTTTAAAGCTAGTTTTATTTACGTCCTGGCATaa > 2:2042357/1‑99 (MQ=255) caacaccaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAg < 1:2734633/97‑1 (MQ=255) caacaccaccAGACGCATGGTGTCGACTCTCACCAGCGTGCTGTACATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCCCCTCCGGGCATAAg < 2:2200487/97‑1 (MQ=255) ccaccaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAgcg < 1:1273196/100‑1 (MQ=255) ccaccaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAgcg < 1:1536921/100‑1 (MQ=255) ccaccaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAgcg < 1:2702146/100‑1 (MQ=255) ccaccaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAgcg > 2:1678008/1‑100 (MQ=255) accaccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGcgcg > 1:1623189/1‑100 (MQ=255) caccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTg > 1:748239/1‑100 (MQ=255) caccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTg > 2:2712131/1‑100 (MQ=255) caccGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTg < 1:1678028/100‑1 (MQ=255) accGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCTAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTgg < 1:2773347/100‑1 (MQ=255) accGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTgg > 1:546182/1‑100 (MQ=255) gACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGcgcg > 1:2103834/1‑100 (MQ=255) cGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGc > 1:640645/1‑100 (MQ=255) gCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGcc > 2:1306133/1‑100 (MQ=255) cATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCt > 1:2640164/1‑100 (MQ=255) tGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCttt < 2:2442711/100‑1 (MQ=255) tGGTGTCGACGCTCTCCAGAGAGCTATAGATATCAACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCgg > 2:1281361/1‑95 (MQ=255) ggTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTc > 1:286597/1‑100 (MQ=255) GTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCa > 1:2974817‑M1/1‑100 (MQ=255) GTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCa > 2:1568088‑M1/1‑100 (MQ=255) GTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCa > 1:1969858‑M1/1‑100 (MQ=255) | CGGCCATCCGCTTCGGTGATTTTATAGGTTTCTGAATCGGTAATTTCATTGACCAGCGTTTGCAGTTCCACCTTCGGGCGCACCACCACCGGACGCATGGTGTCGACGCTCTCCAGCGTGCTGTAGATATCGACACAGTCAAAAATCTTAAAGCTGGTTTTATTCACCTCCGGGCATAAGCGCGTGGCGCGGCCTTTCA > NC_000913/4584096‑4584294 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |