| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2304653 | 37 (0.340) | 30 (0.300) | 9/164 | NT | 63.8% | noncoding (237/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 2304669 | 0 (0.000) | noncoding (253/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
CGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAC > NC_000913/2304554‑2304752 | cgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGAT < 2:531492‑M1/100‑1 (MQ=255) gcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATa > 1:1021433/1‑100 (MQ=33) naTCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa > 2:1622338/2‑100 (MQ=18) aTCCGACATCCAACGCCCTAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAg < 2:799729/100‑1 (MQ=17) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 1:2473346/100‑1 (MQ=32) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 2:498242/100‑1 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 1:506575/1‑100 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 1:506573/1‑100 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGCATAAGGc < 1:1586983/100‑1 (MQ=18) cGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg < 1:833504/100‑1 (MQ=32) cGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg > 1:2277334/1‑100 (MQ=33) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 2:938938/100‑1 (MQ=32) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 2:218777/100‑1 (MQ=33) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:2670539/100‑1 (MQ=32) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:2000751/100‑1 (MQ=33) cATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 1:1182631/100‑1 (MQ=32) cATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 1:352078/100‑1 (MQ=33) aTCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTa < 1:394282/100‑1 (MQ=33) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 2:637922/1‑98 (MQ=33) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 1:2971857/1‑100 (MQ=33) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 2:2601147/1‑100 (MQ=33) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg > 2:585097/1‑100 (MQ=33) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg > 2:2633931/1‑100 (MQ=33) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:2233110/1‑100 (MQ=33) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:3027606/1‑100 (MQ=33) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCTCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTActc < 1:2046474/99‑3 (MQ=16) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGGGGTTAcg > 2:2764676/1‑98 (MQ=17) aCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtca > 2:2922971/1‑93 (MQ=17) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGTAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 2:1867075/98‑1 (MQ=17) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc < 2:2134656/100‑1 (MQ=32) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc < 2:2542002/100‑1 (MQ=32) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTACTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc > 2:1534553/1‑100 (MQ=17) gCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc > 2:2182319/1‑99 (MQ=31) gCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCa > 2:2819543‑M2/1‑99 (MQ=255) ccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatc < 2:2180606‑M1/100‑20 (MQ=255) ccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatc > 1:1359399‑M2/1‑97 (MQ=255) ccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatc < 1:1794304‑M2/100‑4 (MQ=255) caagcCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 1:1705223‑M1/98‑21 (MQ=255) caagcCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 1:1248807‑M1/98‑21 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 1:2382400‑M1/100‑21 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatcc < 2:1811160‑M2/100‑5 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatcc < 1:800362‑M2/100‑5 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatcc > 1:2508156‑M2/1‑96 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGCGACATGCTCCACCGCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGACACatcc < 2:599852‑M2/100‑5 (MQ=255) gtgccGGTTGCCTGTTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccg > 1:802674‑M2/3‑95 (MQ=255) gAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTGGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccg < 2:2708896‑M2/100‑6 (MQ=255) aagCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatcca < 1:1534571‑M1/99‑22 (MQ=255) aGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTTTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGATCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccga > 1:656364‑M2/1‑94 (MQ=255) aGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccga > 1:2914870‑M2/1‑94 (MQ=255) aGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccga > 1:407979‑M2/1‑94 (MQ=255) ggcggTTGCCTGATGCGGCGCGGGCGCGTCTTATCAGGGCTACACCGCTGTGAAGTGCTTCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccgac > 2:1642999‑M2/3‑93 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTTTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgcctcatccgac < 1:1594479‑M1/100‑24 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaac < 1:2130685‑M1/100‑24 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaac < 2:1069887‑M1/100‑24 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgac < 2:2787291‑M1/100‑24 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgac < 1:1522404‑M1/100‑24 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgac < 1:2400897‑M1/100‑24 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccgac > 2:2621584‑M2/1‑93 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccga < 2:441485‑M2/99‑7 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatcccac < 2:2211245‑M2/100‑8 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAAGCGGTTACGCCGCatccaac < 1:2029413‑M2/100‑8 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaacct < 1:2126771‑M1/100‑26 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacct < 1:497646‑M1/100‑26 (MQ=255) ggTTGCGTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGGGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatcn < 2:2453184‑M1/94‑21 (MQ=255) gATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgc > 2:441039‑M1/1‑66 (MQ=255) aTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGACGGATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtgga > 1:1142181‑M1/1‑65 (MQ=255) gACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcac < 2:1142170‑M1/100‑40 (MQ=255) gTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacatcggtgtaggcctgataatacgcgccagcgcc < 1:2044607‑M1/100‑78 (MQ=255) gTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtc < 2:1142170‑M2/100‑62 (MQ=255) gCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccgacctacggggtggagcacttcaaagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgc < 1:1151203‑M2/100‑64 (MQ=255) tCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccgtcctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcat > 1:1142181‑M2/1‑35 (MQ=255) gcaCCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatc > 2:441039‑M2/2‑34 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccg < 1:1441653‑M2/100‑76 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggc < 2:1069887‑M2/100‑78 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggc < 1:196474‑M2/100‑78 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcatgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggc < 1:2130685‑M2/100‑78 (MQ=255) gTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggc > 1:1043390‑M1/1‑7 (MQ=255) gTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtgaagcacttcacagcggtgtagccctgataagacgcgcccgcgccgcatcaggcaaccgcc > 2:1642999‑M1/1‑7 (MQ=255) gTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggc < 1:2400897‑M2/100‑78 (MQ=255) tCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggatcacttcacagcggtgtaggcctgataaaacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggct > 1:656364‑M1/1‑6 (MQ=255) tCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggct > 1:2914870‑M1/1‑6 (MQ=255) tggaTAAGGCGGTTACGCCGCatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctt < 1:1534571‑M2/99‑80 (MQ=255) cGGATgcggcgtaaccgccttatcccacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctc < 2:2708896‑M1/100‑96 (MQ=255) gtatggggcgcaaccgccttatccgacctacgggggggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcg < 2:1638552‑M1/98‑97 (MQ=255) ggATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgatcagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcg > 2:1593684‑M1/1‑4 (MQ=255) ggATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcg > 1:2563038‑M1/1‑4 (MQ=255) 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ggATAAGGCGGTTACGCCGCatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttg < 1:1210188‑M2/100‑81 (MQ=255) gATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgg < 1:1794304‑M1/100‑98 (MQ=255) gATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgg > 1:1359399‑M1/1‑3 (MQ=255) gATAAGGCGGTTACGCCGCatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgg < 2:239542‑M2/100‑82 (MQ=255) gATAAGGCGGTTACGCCGCatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgg < 2:962596‑M2/100‑82 (MQ=255) tgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggc > 2:2819543‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcagaaaaccggcgcgg > 1:2734367‑M1/1‑1 (MQ=255) | CGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAC > NC_000913/2304554‑2304752 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |