| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2405625 | 81 (0.750) | 14 (0.140) | 8/164 | NT | 15.8% | intergenic (‑553/+78) | nuoA/lrhA | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit A/transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes |
| ? | NC_000913 | = 2405660 | 75 (0.750) | intergenic (‑588/+43) | nuoA/lrhA | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit A/transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAA > NC_000913/2405527‑2405722 | ggCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTaaaaaaa > 1:244330/1‑100 (MQ=255) gCGATTATTTGTGCTTTCTGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTaaaaaaan < 1:673477/100‑2 (MQ=255) gCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTaaaaaaaa > 2:1424934/1‑100 (MQ=255) cGATTATTTGTTCATTCGGGACGTGAATCTCTGGTTGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGGTCTGCACTATGCTATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAg < 2:1875444/100‑1 (MQ=255) gATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAg < 1:1648159/99‑1 (MQ=255) gATTATTTGTGCGTTCCGGACGTGAATCTCCGGTGTTTGAAAAATCAACACTTTTGTACGTTCTGCACTATTCGATGAAGGATTTTTACTaaaaaaaa < 2:1852947/98‑1 (MQ=255) tgtgCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAAAGCCGCTgggg > 2:2032246/1‑100 (MQ=255) tgtgCGTTCGGGACGTGAATCTCAGTTGTTTGAAAAATGAAAAGAGATGGAGATACTGAACTAAGCGAGGAAGGTTTTTTACTAAAAAAAAg > 2:322092/1‑92 (MQ=255) gtgCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGGTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTCCACTATGCGATGAAGGCTTTTTACTAACACACAGCCCCTggg > 2:88157/1‑99 (MQ=255) tgCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATTATCAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGt < 1:36774/100‑1 (MQ=255) gCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGtt > 1:704974/1‑100 (MQ=255) cGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGttt < 1:1424948/100‑1 (MQ=255) gtttttgACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGAACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGtt < 2:1449373/92‑1 (MQ=255) gTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTa < 2:1510851/100‑1 (MQ=255) ttCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTaa < 1:2612549/100‑1 (MQ=255) ttCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTaa < 2:2753066/100‑1 (MQ=255) tCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTaaa < 2:476145/100‑1 (MQ=255) tCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTaaa < 1:185144/100‑1 (MQ=255) tCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTaaa < 1:2747227/100‑1 (MQ=255) cGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTaaaa > 2:294389/1‑100 (MQ=255) gggACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAac > 1:361651/1‑100 (MQ=255) ggACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAaca > 2:1147603/1‑100 (MQ=255) gACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAacac < 1:1057449/100‑1 (MQ=255) tGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACAccccc > 2:333497/1‑100 (MQ=255) tGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAACCGCTGGGGTTTAAAACAccccc > 1:922713/1‑100 (MQ=255) gAATCACTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCa > 1:155870/1‑100 (MQ=255) ctctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCgg < 1:1902477/100‑1 (MQ=255) tctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAaagccgctggggtgttttaaaccccagcggct < 1:654765‑M1/100‑33 (MQ=255) tctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAaagccgctgggggtgttttaaaccccagcggc < 1:2984445‑M1/100‑33 (MQ=255) tctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAaagccgctgggggtgttttaaaccccagcggc < 1:1359069‑M1/100‑33 (MQ=255) ctGGTTGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAcgagccgctgggggtgttttaaaccccagcggc < 1:1303207‑M1/100‑34 (MQ=255) ctGGTGGTTGAAAAATGAACTGTTTTGTACGTTCTGCAATATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAaagccgctgggggtgttttaaaccccagcggct < 1:1217562‑M1/100‑34 (MQ=255) ctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAcgagccgctgggggtgtttcaaaccccagcggc < 1:2065116‑M1/100‑34 (MQ=255) ctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAaagccgctgggggtgttttaaaccccagcggct < 1:3026056‑M1/100‑34 (MQ=255) ctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAaagccgctgggggtgttttaaaccccagcggct < 1:907099‑M1/100‑34 (MQ=255) tggtggTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTc < 1:2930183/100‑1 (MQ=255) ggtggtTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTCTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGc > 2:17060/1‑97 (MQ=255) ttGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGttttt > 2:712078‑M2/1‑95 (MQ=255) ttGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGttttt < 2:807873‑M2/100‑6 (MQ=255) tGAATAATGAATATTTTTGTAATTTCTGCACTATGTGATTAAGGTTTTTTACTAAAAAAAAGTCGCTGTGGTTTAAAACACCTCCAGCGACTCGtttttt < 2:2798343/100‑1 (MQ=255) tGAAAAATGAACAGTTTTGTACTTTCTGCATTATGCGATGAAGTTTTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGTGTTTAAATCACCTCCAGCGGCTCGtttttt < 2:2377222/100‑1 (MQ=255) gAAAAATGAACAGTTTTTTACGTTCTGTACTATGCTATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGtttttta > 1:2078612‑M2/1‑93 (MQ=255) gAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAaagccgctgggggtgttttaaaccccagcggcttttttttag < 1:1912760‑M1/100‑43 (MQ=255) gAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGtttttta > 1:1707196‑M2/1‑93 (MQ=255) aaaaaTGAACAGTTTTGTACGTTCTGCATTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTac < 1:533766/100‑1 (MQ=255) aaaaTGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGTGTTTTAGGATTTTTACTAAAAAAcgagccgctgggggtgttttaaaccccagcggcttttttttagt < 1:1100305‑M1/100‑45 (MQ=255) atcaaCAGATTTTTACGTTCTGCAACACCAGATAAAGGAACATTACCCAAAAAAAGCCGCTGGGATTAAACACACCAACAGCGCCTAGTTATTTAAACt > 2:466967/4‑99 (MQ=255) aaCAGTTTTTTATGTTCTGCACTTTGTGATTAAGGATTTTTATTAAAAAAcgagccgctgggggtgttttaaaccccagcggcttttttttagtaaaaat < 1:2621440‑M1/100‑51 (MQ=255) cAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAcgagccgctgggggttttttaaaccccagcggcttttttttagtaaaaatc < 2:759386‑M1/99‑52 (MQ=255) aGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGtct < 1:651770/100‑1 (MQ=255) gTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGtctc < 1:1859398/100‑1 (MQ=255) gTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGACTCGTTTTTTACACTATTGtctc > 1:1997027/1‑100 (MQ=255) gTTTTGTACGTTCAGCACTATGCGATGAAGGGTTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGtctc > 1:2041518/1‑100 (MQ=255) ttGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAgg > 2:1775101/1‑100 (MQ=255) gTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGaa < 2:1145488/100‑1 (MQ=255) cGTTCTGCACTATGCGATTAAGGATTTTTTCTAAAAAAAAGCCTCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATta < 1:1194082/100‑1 (MQ=255) cGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTCCTAAACAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCAAGCGGCACGttttttagtaaaaatccttcatcgcat < 1:792687‑M2/100‑28 (MQ=255) ttttGCACTATGCGATGAAGGATTTTTATTTAAAAAAATACGCTGGTGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatc < 1:242804/97‑1 (MQ=255) ttCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatc < 1:2705397/100‑1 (MQ=255) cTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatcta > 2:2844175/1‑100 (MQ=255) tGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatctat > 1:1459117/1‑100 (MQ=255) gtaCTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatctatc > 2:1370153/3‑100 (MQ=255) gCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAACAAGCCACTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatctatc < 2:2041495/100‑1 (MQ=255) gCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatctatc > 1:1856644/1‑100 (MQ=255) gCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTAGTTTTTTACACTATTATCTCAGGAATtatctatc > 1:347753/1‑100 (MQ=255) cTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATcgtc > 1:1721215/1‑100 (MQ=255) 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aTTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGa > 1:2006225/1‑100 (MQ=255) aTTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGa < 2:2987553/100‑1 (MQ=255) aTTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGa > 1:585931/1‑100 (MQ=255) aTTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGa > 1:1957911/1‑100 (MQ=255) ttttACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGata > 2:2793513/1‑100 (MQ=255) cgatcTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGatat < 2:40910/96‑1 (MQ=255) aCTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACTCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATccc < 2:1296547/100‑1 (MQ=255) aCTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGttttttagtaaaaatcctaaaacacatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttt < 1:1100305‑M2/100‑57 (MQ=255) cTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTTtttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttttc < 1:1912760‑M2/100‑58 (MQ=255) cTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCt > 1:279060/1‑100 (MQ=255) cTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCt > 2:320050/1‑100 (MQ=255) cTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCt > 2:2544154/1‑100 (MQ=255) cTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCAat > 1:2445113/1‑94 (MQ=255) tAAAAAAcgagccgctgggggtgttttaaaccccagcggcttttttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttttc > 1:1707196‑M1/1‑7 (MQ=255) tAAAAAAcgagccgctgggggtgttttaaaccccagcggcttttttttagtaaaaatccttcatagcatagtacagaacgtaaaaaactgttcatttttc > 1:2078612‑M1/1‑7 (MQ=255) tAAAAAAAAGCCGCTAGGGTTTAAAACGCCCCCAGCGGCTTGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCTGTCGATTACTCGATATCCCt < 2:576576/99‑1 (MQ=255) aaaaaaaaTCCGCTGGTGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCtt < 2:2717305/99‑1 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGatatagatcg > 1:40910/1‑94 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCttt > 2:2544602/1‑100 (MQ=255) aaaaacgagccgctgggggtgttttaaaccccagcggcttttttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttttcaa > 1:2667280‑M1/1‑5 (MQ=255) aaaaacgagccgctgggggtgttttaaaccccagcggcttttttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttttcaa > 2:712078‑M1/1‑5 (MQ=255) aaaaacgagccgctgggggtgttttaaaccccagcggcttttttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttttcaa < 2:807873‑M1/100‑96 (MQ=255) aaaaaaaGTCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtc < 1:2700311/100‑1 (MQ=255) aaaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtc < 1:2905177/100‑1 (MQ=255) aaaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtc < 2:867180/100‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACTTCCATCGTCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtca < 1:2761692/100‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTTtttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttttcaac < 2:2774788‑M2/99‑61 (MQ=255) | GGCGATTATTTGTGCGTTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAA > NC_000913/2405527‑2405722 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |