| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4086865 | 96 (0.890) | 20 (0.210) | 9/154 | NT | 17.9% | intergenic (+16/‑137) | fdhD/yiiG | formate dehydrogenase formation protein/DUF3829 family lipoprotein |
| ? | NC_000913 | = 4086880 | 100 (1.070) | intergenic (+31/‑122) | fdhD/yiiG | formate dehydrogenase formation protein/DUF3829 family lipoprotein | |||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
ACACTGGTAGGTTTTTGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATC > NC_000913/4086781‑4086979 | acacTGGTAGGTTTTTGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAAtt > 1:63550/1‑100 (MQ=255) acTGGTAGGTTTTTGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgc > 1:1376474‑M2/1‑98 (MQ=255) cTGGTAGGTTTTTGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgca < 1:2761469‑M2/100‑4 (MQ=255) cTGGTAGGTTTTTGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgc > 2:2549444‑M2/1‑97 (MQ=255) tGGTAGGTTTTTGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcag > 2:1081290‑M2/1‑96 (MQ=255) tGGTAGGTTTTTGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcag > 2:2955915‑M2/1‑96 (MQ=255) ggTAGGTTTTTGTAAACCGGGTCGGGCAACGGATTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCTTGCGAAATATATTAAATTgcagg < 2:2440810‑M2/100‑6 (MQ=255) gTATGTTTTTCTAAACCGGGTGGGGCAACGGTTGATAGCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAAGTgcag > 2:1338589‑M2/1‑94 (MQ=255) gTTTTTGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggactta < 2:2730785‑M2/100‑11 (MQ=255) tttttGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggacttat < 2:1182309‑M2/100‑12 (MQ=255) tttttGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggacttat < 2:1182238‑M2/100‑12 (MQ=255) ttttGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggacttatt < 1:2555534‑M2/100‑13 (MQ=255) ttttGTAAACCGGGTCAAGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCATGCGAAATATATTAAATTgcaggacttatt < 2:382303‑M2/100‑13 (MQ=255) ttGTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCa < 2:1911956/100‑1 (MQ=255) gTAAACCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCAtt > 2:1911484/1‑100 (MQ=255) aaaCCGGGTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTc < 2:2102821/100‑1 (MQ=255) tctggTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTg < 1:935742/97‑1 (MQ=255) ggTCTGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTg < 2:1792212/97‑1 (MQ=255) ggTCGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAat > 2:2104017/1‑100 (MQ=255) cGGGCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAatttt > 2:2012028/1‑100 (MQ=255) gggCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAatttta < 2:14017/100‑1 (MQ=255) ggCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAattttat < 1:2251760/100‑1 (MQ=255) ggCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAattttat < 1:2460627/100‑1 (MQ=255) ggCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAattttat < 2:1142033/100‑1 (MQ=255) gCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAattttatt > 1:574734/1‑100 (MQ=255) gCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAattttatt > 1:128123/1‑100 (MQ=255) gCAACGGTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAattttat < 2:2811299/99‑1 (MQ=255) gTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAattttattatttta > 1:365412/1‑100 (MQ=255) ttATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAattttattattttatt < 2:1724189/100‑1 (MQ=255) tataCCTATCCGCAGCGTTTGAGTAATTAATTAAAATAAGTTTTGCTAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATtattttactt < 2:309602/100‑1 (MQ=255) ataCCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTTCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATtttattta < 1:798960/100‑1 (MQ=255) ataCCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATtttattta < 1:2626896/100‑1 (MQ=255) taCCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTttatttat > 1:851606/1‑100 (MQ=255) taCCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTttatttat > 1:2296311/1‑100 (MQ=255) taCCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTttatttat > 1:2747214/1‑100 (MQ=255) taCCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTttatttat > 1:895463/1‑100 (MQ=255) ccATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTTAATTTTATTATTTTATTTATaaa < 2:514605/100‑1 (MQ=255) ccATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATaaa < 2:2898187/100‑1 (MQ=255) aTCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACa < 1:461986/100‑1 (MQ=255) gCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAAt > 2:1051692/1‑100 (MQ=255) cAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATg < 1:257540/100‑1 (MQ=255) cGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATg > 1:1072121/1‑97 (MQ=255) gTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCgtg < 1:582541/100‑1 (MQ=255) ttGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCg > 2:1467865/1‑96 (MQ=255) tGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAg > 2:916023/1‑100 (MQ=255) tGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTAATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAg > 1:196616/1‑100 (MQ=255) aGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGt > 2:2648589/1‑99 (MQ=255) aGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTg > 1:268319/1‑100 (MQ=255) gCAATTAATTTAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTTAATTTTATTATTTTCTTTATAAACAAAATGCGTGTAGt > 2:2740095/1‑98 (MQ=255) gCAATTAATTAAAATAAGTCATGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTTGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTg > 2:2342282/1‑99 (MQ=255) aattaattAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCg < 2:2876424/100‑1 (MQ=255) attaattaAAATACGTCCTGCGAAAAATATTAAATTGCAGAACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTaataacgt > 2:1723236/1‑93 (MQ=255) attaattaAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGt > 2:1959479/1‑100 (MQ=255) taattaaAATAAGTCCTACGAAATATATTAAAATGACGGACTTATTAATTTAGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAAAGCGTGTAGt > 2:2534294/1‑93 (MQ=255) aattaaAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggacttattttaattaattgctcaaacgctgcggatgggtataaaccgttgcccgacccggttt < 1:1283573‑M2/100‑68 (MQ=255) aattaaAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGtttt > 1:1163688/1‑100 (MQ=255) aaaaTAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggacttattttaattaattgctcaaacgctgcggatgggtataaaccgttgcccgacccggtttacaa < 1:1895914‑M2/100‑72 (MQ=255) aaaaTAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggacttattttaattaattactcaaacactgcgaatgggtataaaccgttgcccgacccggtttacaa < 1:2303976‑M2/100‑72 (MQ=255) 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aaGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCa < 1:1581331/100‑1 (MQ=255) aGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggacttattttaattaattgctcaaacgctgcggatgggtataaaccgttgcccgacccggtttacaaaaacct < 2:1350296‑M2/100‑78 (MQ=255) aGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggacttattttaattaattgctcaaacgctgcggatgggtataaaccgttgcccgacccggtttacaaaaacca < 1:2704278‑M2/100‑78 (MQ=255) aGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggacttattttaattaattgctcaaacgctgcggatgggtataaaccgttgaccgacccggtttacaaaaaact < 1:2077905‑M2/100‑78 (MQ=255) aGTCCTGCGAAATATATTAAATTgcagaacttattttaattaattgctcaaacgctgcggatgggtataaaccgttgcccgacccggtttacaaagtcct < 2:2283636‑M2/100‑78 (MQ=255) gTCCTGCGAAATATATTAAATTgcaggacttattttaattaattgctcaaacgctgcggatgggtataaaccgttgcccgacccggattacaaaaaccta < 1:1235404‑M2/100‑79 (MQ=255) gTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCAtt > 1:261224/1‑100 (MQ=255) 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1:323879/1‑100 (MQ=255) aaaTATATTTGATTTCAGAACTTATTCATTTCGTTAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGt < 2:2463700/100‑1 (MQ=255) aaaTATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCTTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGt < 2:2002227/100‑1 (MQ=255) aaTATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGtt < 1:518574/100‑1 (MQ=255) aaTATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGt < 2:2184202/99‑1 (MQ=255) atTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCActc > 1:1576436/1‑100 (MQ=255) tAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCActctc < 1:1051699/100‑1 (MQ=255) tAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCActct > 2:592301/1‑99 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |