| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4541922 = | 101 (1.110) | 8 (0.090) | 6/170 | NT | 7.9% | intergenic (+363/‑115) | fimB/fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
| ? | NC_000913 | 4541952 = | 91 (1.040) | intergenic (+393/‑85) | fimB/fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTT > NC_000913/4541823‑4542021 | tCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTg < 1:1081464/100‑1 (MQ=255)cgacgtttactcacaatagtagtactcctaactgagatatatttgaataaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattaacccaatagataaaaag < 2:2288602‑M1/1‑1 (MQ=255) gacgtttactcacaatagtagtactcctaactgagatatatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGa > 2:937879‑M1/99‑100 (MQ=255) ccACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGa > 1:796548/1‑100 (MQ=255) ccACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGa < 2:1071800/100‑1 (MQ=255) cACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGAt > 1:874590/1‑100 (MQ=255) aCTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGAt > 2:229472/1‑99 (MQ=255) aCTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATa < 2:2108883/100‑1 (MQ=255) aCTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATGTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATa < 2:496880/100‑1 (MQ=255) cTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAg < 1:832958/100‑1 (MQ=255) tGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATTAAAAGAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAg < 1:519667/99‑1 (MQ=255) gCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATa > 1:511691/1‑97 (MQ=255) gCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGcc > 2:326520/1‑100 (MQ=255) cAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCca > 1:1614251/1‑100 (MQ=255) aaTCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCcac < 1:505783/100‑1 (MQ=255) aaTCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCcac < 1:1696412/100‑1 (MQ=255) tCTATTGTTATATAGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTAACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCcaca > 1:1736699/1‑99 (MQ=255) aTTGTTCTATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCAc > 1:578657/1‑100 (MQ=255) tttttATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACt < 2:2165447/97‑1 (MQ=255) ttGTTATAATGAATCAAATCAATGAAAATAAATGTTGTCACAGCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACGGATAGCCACATCACt < 2:402328/100‑1 (MQ=255) gTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTcc > 1:351641/1‑100 (MQ=255) gTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTcc > 1:2405456/1‑100 (MQ=255) atatTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg < 1:2530244/100‑1 (MQ=255) atatTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg < 1:2471342/100‑1 (MQ=255) tatTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgt > 1:771852/1‑100 (MQ=255) atTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtg < 1:555639/100‑1 (MQ=255) gAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTgg > 1:1031793/1‑100 (MQ=255) gAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTgg < 1:1827239/100‑1 (MQ=255) gAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTgg < 2:649624/100‑1 (MQ=255) gAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTgg < 2:584427/100‑1 (MQ=255) aatcaaatcaATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTgg < 2:1257993/99‑1 (MQ=255) aatcaaatcaATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt < 1:701585/100‑1 (MQ=255) aatcaaatcaATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt > 1:2484354/1‑100 (MQ=255) aatcaaatcaATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt < 1:1137633/100‑1 (MQ=255) aatcaaatcaATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt < 2:1333216/100‑1 (MQ=255) aatcaaatcaATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt < 1:1565456/100‑1 (MQ=255) aatcaaatcaATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt < 1:1530467/100‑1 (MQ=255) tctaatcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTa < 2:1585228/97‑1 (MQ=255) tcaaatcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTa < 1:1702097/100‑1 (MQ=255) aactgagatatatttgaattaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATc > 2:1918511‑M1/71‑100 (MQ=255) aaatcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATc > 2:1156341/1‑100 (MQ=255) aaatcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATc < 1:2543052/100‑1 (MQ=255) aaatcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATc > 1:707080/1‑100 (MQ=255) aaatcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTAACTGCTATCCACATCACTCTGTGTGTTGTTATc > 2:585632/1‑100 (MQ=255) tcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCttt < 2:44530/100‑1 (MQ=255) aaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCttttt > 1:712834/1‑100 (MQ=255) aTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTa < 1:1878930/100‑1 (MQ=255) tGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTAt < 1:1230643/100‑1 (MQ=255) tatatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATc > 2:191232‑M1/63‑100 (MQ=255) tatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTa > 1:568657‑M1/61‑100 (MQ=255) aaaTAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTa < 2:1020656/100‑1 (MQ=255) aaTAGATGTTGTCGCATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATGTTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTAt > 1:1736295/1‑100 (MQ=255) gaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTggg > 1:102274‑M1/56‑100 (MQ=255) gATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTggg < 2:584769/100‑1 (MQ=255) aTGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACCTCCCTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGc < 1:1274588/100‑1 (MQ=255) tgtCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAAt > 1:1000270/1‑100 (MQ=255) gtCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAAtt < 2:176929/100‑1 (MQ=255) cacaTCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAAtttt < 2:90701/100‑1 (MQ=255) aTCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGAc < 1:769043/100‑1 (MQ=255) aTCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGAc > 1:1967087/1‑100 (MQ=255) tctgTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTATTGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTCTCTATTGCGCTAATTTTGAcc < 2:755509/97‑1 (MQ=255) tCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGAcc < 1:1241115/100‑1 (MQ=255) tCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGAcc < 1:144340/100‑1 (MQ=255) tCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGAcc < 2:1792990/100‑1 (MQ=255) aGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGa > 1:1860939/1‑100 (MQ=255) gTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGAt > 2:2248580/1‑100 (MQ=255) tattttatttTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGAGAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAg < 2:1061893/100‑1 (MQ=255) attttattttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAgg > 1:2098869/1‑100 (MQ=255) attttattttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAg > 2:1509479/1‑99 (MQ=255) ttttattttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGt > 1:2382506/1‑100 (MQ=255) ttttattttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGt > 1:2415878/1‑100 (MQ=255) ttattttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGttt < 1:1412618/100‑1 (MQ=255) attttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTcc > 2:469412/1‑100 (MQ=255) attttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTcc < 2:443842/100‑1 (MQ=255) attttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTcc > 2:406940/1‑100 (MQ=255) tttttGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCt < 1:1317801/100‑1 (MQ=255) tccgtcaaaattagcccaatagataaaaaGATATCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGACTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCt > 2:672824‑M1/30‑100 (MQ=255) ttttGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCta > 1:64575/1‑100 (MQ=255) tttGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCtat < 2:2382491/100‑1 (MQ=255) gTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAgg < 1:1291181/100‑1 (MQ=255) tATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGt < 1:34794/100‑1 (MQ=255) tGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTat > 1:2093620/1‑100 (MQ=255) tGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTat < 2:809049/100‑1 (MQ=255) tatTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTattca < 2:1521606/100‑1 (MQ=255) ttAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTattcattc < 2:685339/100‑1 (MQ=255) tAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTAttcattca < 2:436301/100‑1 (MQ=255) tAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTAttcattca < 1:1849500/100‑1 (MQ=255) tAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTAttcattca > 2:1450309/1‑100 (MQ=255) aaTGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCaa < 1:1024955/100‑1 (MQ=255) aaTGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCaa < 1:2172246/100‑1 (MQ=255) tGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAat < 1:663036/100‑1 (MQ=255) gTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAata > 1:2368931/1‑100 (MQ=255) aaTTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTCTCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAatata < 2:1645063/100‑1 (MQ=255) aTTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAatatat > 1:838078/1‑100 (MQ=255) ttGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATAtc > 1:2162971/1‑100 (MQ=255) ttGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATAtc < 1:841301/100‑1 (MQ=255) aaaaaGATAACCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGTGATAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATAtc > 2:1045938‑M1/6‑99 (MQ=255) aCTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCa < 2:2310159/100‑1 (MQ=255) cTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAg < 2:1251390/100‑1 (MQ=255) GATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGtt < 2:856162‑M1/100‑1 (MQ=255) | TCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTT > NC_000913/4541823‑4542021 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |