| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2042125 | 66 (0.720) | 12 (0.150) | 7/158 | NT | 16.8% | intergenic (+100/‑243) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog |
| ? | NC_000913 | = 2042138 | 60 (0.740) | intergenic (+113/‑230) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACC > NC_000913/2042026‑2042223 | aTTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCt < 1:1970036/100‑1 (MQ=255) tctcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtca < 1:1015372/100‑1 (MQ=255) tctcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtca > 2:1711193/1‑100 (MQ=255) tctcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTCAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtca < 2:1773999/100‑1 (MQ=255) ctcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcat < 2:1571767/100‑1 (MQ=255) tcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcatc > 2:555974/1‑100 (MQ=255) tGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACt > 2:956592/1‑100 (MQ=255) tAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATg < 2:976925/100‑1 (MQ=255) aaCGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGa < 2:1192518/100‑1 (MQ=255) cGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcg < 1:371177‑M2/100‑3 (MQ=255) cGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcg < 1:1018910‑M2/100‑3 (MQ=255) cGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcg > 2:1590313‑M2/1‑98 (MQ=255) ccTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtg < 1:2431481‑M1/100‑18 (MQ=255) ccTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtg < 1:280365‑M2/100‑5 (MQ=255) ccTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtg < 2:2472740‑M2/100‑5 (MQ=255) ccTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtg < 2:1009655‑M2/100‑5 (MQ=255) tctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTc > 2:2118801‑M1/72‑100 (MQ=255) ctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttagtggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCt < 2:1369845‑M1/30‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtct < 1:151515‑M1/100‑21 (MQ=255) cGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGATACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtct < 1:2007401‑M1/100‑21 (MQ=255) tttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTg > 1:434442‑M1/70‑100 (MQ=255) gATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctg < 2:171758‑M1/100‑22 (MQ=255) gATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctg < 1:1231434‑M1/100‑22 (MQ=255) gATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctg < 1:284137‑M1/100‑22 (MQ=255) gATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctg < 1:906697‑M1/100‑22 (MQ=255) gATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtctg > 1:576579‑M2/1‑92 (MQ=255) tcctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGt > 1:987307‑M1/69‑100 (MQ=255) aTGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctgt < 1:2436610‑M1/100‑23 (MQ=255) tGCCGCTTTAGTACGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtctgta > 2:2062736‑M2/1‑90 (MQ=255) tGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtctgta > 2:564140‑M2/1‑90 (MQ=255) gCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctgtag < 1:663585‑M1/100‑25 (MQ=255) ctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGtat > 1:1450560‑M1/67‑100 (MQ=255) tctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGtata > 1:1202754‑M1/66‑100 (MQ=255) ccGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctgtagc < 1:95996‑M1/100‑26 (MQ=255) cGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTatat > 2:2334478/1‑100 (MQ=255) cGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTatat > 1:2342325/1‑100 (MQ=255) tgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATAtt > 1:1369854‑M1/64‑100 (MQ=255) cTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTAAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATta < 2:32608/100‑1 (MQ=255) cTTTAGTAAGTCATCATAACTGCCACTGTGCCATCCACAAACGCCACTGAACTCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATta < 1:852802/100‑1 (MQ=255) gTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg > 1:925398/1‑100 (MQ=255) tAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGc < 2:1834551/100‑1 (MQ=255) gTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTaa > 1:1873128/1‑100 (MQ=255) tATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAcc < 1:459820/100‑1 (MQ=255) aTCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAccc < 2:2021504/100‑1 (MQ=255) tCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCg < 1:379511/100‑1 (MQ=255) tCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCg < 2:1876785/100‑1 (MQ=255) cATAACTGCCACTGGCCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGGGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCg > 2:475237/1‑99 (MQ=255) aTAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCa > 2:1920022/1‑100 (MQ=255) aTAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCa < 1:151753/100‑1 (MQ=255) aTAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCa > 1:1934365/1‑100 (MQ=255) aTAACTGCCACTGGTCCATCAACAGACGCCACTGATCGCAAGCTAGCTAAAGACACGCTCATCACTATGACGTGTATGTATATTAATAAGCTAAccc < 2:1157757/97‑1 (MQ=255) aaCTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCAtt < 2:1974569/100‑1 (MQ=255) cTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgttt < 1:2395645‑M1/100‑48 (MQ=255) cTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGa > 2:189656/1‑100 (MQ=255) tGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAg > 2:2315920/1‑100 (MQ=255) cACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTa < 1:811521/100‑1 (MQ=255) ttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAAc > 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aaaCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcag < 1:2395645‑M2/100‑54 (MQ=255) aCTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATacac > 2:2498016/1‑100 (MQ=255) aCTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATac > 2:1548835/1‑98 (MQ=255) aaCGCAATCTAGCTACAGACAAGTTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCTCATTGAGTTATCCAATAAAGGATTCCATaca < 2:1246571/95‑1 (MQ=255) gCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACgg < 1:394780/100‑1 (MQ=255) aaGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGcc < 2:2495127/100‑1 (MQ=255) gctagctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCaa > 1:2296579/1‑100 (MQ=255) ctagctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCAGTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAAc < 2:1397949/100‑1 (MQ=255) tagctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACa < 1:1765604/100‑1 (MQ=255) agctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACag > 2:149500/1‑100 (MQ=255) agctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACag < 1:405890/100‑1 (MQ=255) gctaCAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcgg < 1:95996‑M2/100‑76 (MQ=255) ctaCAGACACGCTCATCACTATGAcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggc < 1:663585‑M2/100‑77 (MQ=255) ctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACagag > 1:1778141/1‑100 (MQ=255) ctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACagag > 1:496834/1‑100 (MQ=255) 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aGACACGCTCATCACTATGAcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcg < 1:151515‑M2/100‑81 (MQ=255) AGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAg > 1:361335‑M1/1‑100 (MQ=255) AGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAg > 1:1444606‑M1/1‑100 (MQ=255) GACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGa < 2:293198‑M1/100‑1 (MQ=255) GACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGa < 2:715645‑M1/100‑1 (MQ=255) cacGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcgagg < 2:1009655‑M1/100‑97 (MQ=255) cacGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcgagg < 1:280365‑M1/100‑97 (MQ=255) CACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGaaa < 1:1657288‑M1/96‑1 (MQ=255) ACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATAc > 1:1540709‑M1/1‑100 (MQ=255) cGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcgaggcg > 2:1590313‑M1/1‑2 (MQ=255) cGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcgaggcg < 1:371177‑M1/100‑99 (MQ=255) cGtcatagtgatgagcgtgtctgtagctagcttgcgttcagtggcgtttgtggatggaccagtggcagttatgataacttactaaagcggcatcgaggcg < 1:1018910‑M1/100‑99 (MQ=255) CGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATAcc > 2:1568687‑M1/1‑100 (MQ=255) CGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATAcc > 2:823378‑M1/1‑100 (MQ=255) | GTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACC > NC_000913/2042026‑2042223 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |