| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3241202 | 81 (0.890) | 16 (0.190) | 11/162 | NT | 17.1% | coding (543/552 nt) | ygjV | Imp‑YgjV family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 3241215 | 81 (0.980) | coding (530/552 nt) | ygjV | Imp‑YgjV family inner membrane protein | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAA > NC_000913/3241120‑3241314 | gggctGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGaagg < 1:1730227‑M2/98‑5 (MQ=255)gTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGaagg < 2:312895‑M2/100‑5 (MQ=255)gTGCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGaagg < 1:1730246‑M2/100‑5 (MQ=255) gCTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGaagggg < 2:1663513‑M2/100‑7 (MQ=255) cTGTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGaaggggt < 1:176431‑M2/100‑8 (MQ=255) gTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGttt > 1:99929/1‑100 (MQ=255) tCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtc > 2:295914/1‑100 (MQ=255) tCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtc > 2:716119/1‑100 (MQ=255) tCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtc > 2:664124/1‑100 (MQ=255) cACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtct > 1:2327322/1‑100 (MQ=255) cACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtct > 1:2378314/1‑100 (MQ=255) tGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTCCGCCGTAGACGAaaggggttaaacaat > 2:1957604‑M2/1‑85 (MQ=255) gCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAAc < 2:2149289/100‑1 (MQ=255) gCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAAc < 1:2734/100‑1 (MQ=255) gCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAAc > 1:1259676/1‑100 (MQ=255) gCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAAc < 1:875019/100‑1 (MQ=255) gCGGCAGCGTGCCAGGCAGAAGACGAGCGTCTGGCAAATAGCGTCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAAc < 2:91848/100‑1 (MQ=255) cGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACt > 2:2308992/1‑100 (MQ=255) ggCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTATCCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACtt < 1:781421/100‑1 (MQ=255) ggCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACtt > 1:2450595/1‑100 (MQ=255) cTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAAc < 2:2105737/100‑1 (MQ=255) gCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGa < 1:23350/100‑1 (MQ=255) ccAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGAt < 1:1107102/100‑1 (MQ=255) ccAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGAt > 1:1425921/1‑100 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATc > 2:91948/1‑100 (MQ=255) aGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCa < 1:2200160/100‑1 (MQ=255) gCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAAt > 2:562895/1‑100 (MQ=255) aagaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGCATCAATTccc < 2:1813425/100‑1 (MQ=255) agaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTcccc < 2:889010/100‑1 (MQ=255) agaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTcccc < 2:1092817/100‑1 (MQ=255) agaCGATCGTCAGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTCTCGTCTACGGCGGAATGGGTTTTCTCAACCTTAAACGGATCAATTcccc > 2:2394940/1‑100 (MQ=255) cGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCACTTCCCCttt > 2:289226/1‑100 (MQ=255) aTCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTc < 2:1737840/100‑1 (MQ=255) aTCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTc < 2:1736542/100‑1 (MQ=255) aTCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGGTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTc > 1:2225709/1‑100 (MQ=255) cGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTg < 1:562902/100‑1 (MQ=255) cGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTg < 2:871383/100‑1 (MQ=255) cGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTg < 2:2249781/100‑1 (MQ=255) cGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTg > 2:125611/1‑100 (MQ=255) cGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTGCTTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTg < 1:172637/100‑1 (MQ=255) gTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGc > 1:2350717/1‑100 (MQ=255) tCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCa < 2:597704/100‑1 (MQ=255) tCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATGCCCCTTTTCTGCa < 1:1722361/100‑1 (MQ=255) cTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCAt > 2:1327526/1‑100 (MQ=255) cTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCAt > 1:942423/1‑100 (MQ=255) cAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTggcggatg < 1:1785499/100‑8 (MQ=255) cAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGc > 1:2446133/1‑100 (MQ=255) aaTAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCa < 2:176429/100‑1 (MQ=255) aGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTCCGCCGTAGACGAaaggggttaaacaattaattacgcagggcgctatttgccagacgatcgtcttctg > 1:1447820‑M2/1‑45 (MQ=255) gcCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACg < 1:1114929/100‑1 (MQ=255) gcCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACg > 1:1764320/1‑100 (MQ=255) gcCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACg > 1:258274/1‑100 (MQ=255) cTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGaaggggttaaacaattaattacgcagggcgctatttgccagacgatcgtcttctgcctggc < 2:1277576‑M2/100‑62 (MQ=255) cTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAAt < 1:1844091/100‑1 (MQ=255) tGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATg < 1:1129665/100‑1 (MQ=255) tGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATg > 1:1613030/1‑100 (MQ=255) gttatttattGTTTAACCCCTTTCGTCTAGGGGTGAAGGGGTTTTCTCAACATTTAACGGATCAATTAGCGTTTTATACTTCCGACAGAAACAAATGata > 2:388246/4‑100 (MQ=255) gTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGata < 1:437805/100‑1 (MQ=255) 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ttGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGGAGGGGTTTTCTCTACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAAGcc < 2:844831/100‑1 (MQ=255) gTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGaaggggttaaacaattaattacgcagggcgctatttgccagacgatcgtcttctgcctggcaagctgccgcagtg < 1:728697‑M2/100‑76 (MQ=255) gTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGaaggggttaaacaattaattacgcagggcgctatttgccagacgatcgtcttctgcctggcaagctgccgcagtg < 1:562119‑M2/100‑76 (MQ=255) gTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGaaggggttaaacaattaattacgcagggcgctatttgccagacgatcgtcttctgcctggcaagctgccgcagtg > 2:1202540‑M2/1‑25 (MQ=255) gTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCAt > 1:446630/1‑100 (MQ=255) gTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCAt > 1:1989652/1‑100 (MQ=255) gTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCAt < 1:421364/100‑1 (MQ=255) 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1:2028286/1‑100 (MQ=255) tCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCACAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAAc < 2:1369205/100‑1 (MQ=255) cTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACt > 2:307140/1‑100 (MQ=255) tACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGaaagatc > 1:1785837/1‑96 (MQ=255) tACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTa > 2:2467503/1‑100 (MQ=255) aCGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTAc < 1:570376/100‑1 (MQ=255) ggcggAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTAccc < 1:1213735/100‑1 (MQ=255) ggcggAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTAccc < 2:1976962/100‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |