| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4541922 = | 136 (1.100) | 8 (0.070) | 8/170 | NT | 5.9% | intergenic (+363/‑115) | fimB/fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
| ? | NC_000913 | 4541952 = | 126 (1.070) | intergenic (+393/‑85) | fimB/fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
TCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTT > NC_000913/4541823‑4542021 | tCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTg < 2:971521/100‑1 (MQ=255)cgacgtttactcacaatagtagtactcctaactgagatatatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaag > 1:3232776‑M1/100‑100 (MQ=255) gacgtttactcacaatagtagtactcctaactgagatatatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaag > 1:1948726‑M1/99‑99 (MQ=255) ccACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGa > 2:3355504/1‑100 (MQ=255) cACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGAt > 2:3381288/1‑100 (MQ=255) cgtttactcacaatagtagtactcctaactgagatatatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGATa < 1:1835966‑M1/4‑1 (MQ=255) cgtttactcacaatagtagtactcctaactgagatatatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGATa > 2:1426357‑M1/97‑100 (MQ=255) aCTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATa < 2:2935932/100‑1 (MQ=255) cTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAg > 2:3244745/1‑100 (MQ=255) gCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGcc > 2:227699/1‑100 (MQ=255) aTCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTTATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCcaca < 1:3106162/100‑1 (MQ=255) cTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATc < 2:2052983/100‑1 (MQ=255) cTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATc < 1:227699/100‑1 (MQ=255) tATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCAACATCa > 1:532944/1‑100 (MQ=255) tGTTATATTTAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCAc < 2:2361453/98‑1 (MQ=255) gTTATATTGAATTAAATCTATGAAACTTGTTGTTGTCACCGCAGTCATTGTTTATTTTTGTATGTTATTTAACGTACTTGACTATTAGCGCCATCACtgc < 1:427126/100‑3 (MQ=255) gTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTcc < 1:247610/100‑1 (MQ=255) gTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATAACTcc > 1:1224563/1‑100 (MQ=255) tataTTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgt > 2:2019773/1‑100 (MQ=255) atTGAATCAAATCAATGAAAATAGGTGTTGTCTCATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTTACTGATAGCCACATCACTCCgtgtg < 2:89904/100‑1 (MQ=255) atTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtg < 1:258907/100‑1 (MQ=255) atTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtg > 2:1842160/1‑100 (MQ=255) atTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtg > 2:722852/1‑100 (MQ=255) ttGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtgt > 2:817520/1‑100 (MQ=255) tGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGtgtgtg < 2:2706059/100‑1 (MQ=255) tGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGtgtgtg < 2:2329747/100‑1 (MQ=255) tGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGtgtgtg < 2:1835505/100‑1 (MQ=255) gAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTgg < 2:686222/100‑1 (MQ=255) gAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTgg < 1:2407528/100‑1 (MQ=255) tcctaactgagatatatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaacattagcccaatagagaaaaaGATAACCACATCACTCCGTGTGTGGt > 1:1015823‑M1/75‑100 (MQ=255) aatcaaatcaATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt < 2:541065/100‑1 (MQ=255) caaatcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATTTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTAt > 1:688287/1‑100 (MQ=255) aaattaaTGGAAATAGATGTTGTCACATTAGTGATATTTTATTTTTGTACGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATc < 1:1422197/100‑1 (MQ=255) aaatcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATc < 2:423060/100‑1 (MQ=255) aaatcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATAAATGCGTGTGTGGTTAta > 1:2298593/1‑99 (MQ=255) atcaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCtt > 2:2567708/1‑100 (MQ=255) gagatatatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCtttt > 1:2511920‑M1/67‑100 (MQ=255) caaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCtttt > 1:1022743/1‑100 (MQ=255) caaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCtttt < 1:1708065/100‑1 (MQ=255) caaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCtttt > 1:2998794/1‑100 (MQ=255) caaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCtttt > 1:1674381/1‑100 (MQ=255) aTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCtttt < 1:1453949/98‑1 (MQ=255) aTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTa < 2:2314893/100‑1 (MQ=255) aTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTa > 2:413952/1‑100 (MQ=255) tatatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATc > 1:351467‑M1/63‑100 (MQ=255) gAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATc < 1:451234/100‑1 (MQ=255) gAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCAACATAACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATc > 1:622132/1‑100 (MQ=255) atatttgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCt > 1:1856531‑M1/62‑100 (MQ=255) aaaaTAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCt > 2:826614/1‑100 (MQ=255) aaaTAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTa < 1:26894/100‑1 (MQ=255) aTAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTAtt < 2:2324793/100‑1 (MQ=255) aTAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTAtt < 2:14460/100‑1 (MQ=255) tAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTg > 2:2102828/1‑100 (MQ=255) tAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTg < 2:318225/100‑1 (MQ=255) tgaatgaatacctataggaaacctcaatcggtcaaaattagcccaatagataaaaaGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTgg > 1:916155‑M1/57‑100 (MQ=255) aGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTg > 1:679840/1‑99 (MQ=255) gATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTggg < 2:2785478/100‑1 (MQ=255) tgttgtCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCt > 2:1693710/1‑100 (MQ=255) gttgtCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTa > 1:799028/1‑100 (MQ=255) ttgtCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGATTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCt < 1:2197407/98‑1 (MQ=255) tgtCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAAt > 1:2636014/1‑100 (MQ=255) tgtCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAAt > 1:3113220/1‑100 (MQ=255) tgtCACATAAGTGATATTTTATTTTTGTAGGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAAt > 2:870214/1‑100 (MQ=255) gtCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAAtt > 2:1273811/1‑100 (MQ=255) tCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAAttt < 1:1981724/100‑1 (MQ=255) acaTCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTCATGTAATTGACTGATAGACACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTg > 1:839958/1‑100 (MQ=255) acaTCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTg > 2:1571091/1‑100 (MQ=255) acaTCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTg < 2:3000473/100‑1 (MQ=255) acaTCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTg < 2:264016/100‑1 (MQ=255) aTCAGTTATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGAc < 1:379656/100‑1 (MQ=255) tCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGAcc < 1:3258095/100‑1 (MQ=255) aGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGa > 1:2452103/1‑100 (MQ=255) gTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCAGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGAt > 2:1655416/1‑100 (MQ=255) gATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTg < 2:979676/100‑1 (MQ=255) gATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGATACTCTTGTCCGAtt > 1:642974/1‑99 (MQ=255) atatTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGa < 2:2575943/100‑1 (MQ=255) atatTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGa < 2:263950/100‑1 (MQ=255) attttattttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAgg > 2:1907593/1‑100 (MQ=255) attttattttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAgg < 1:2747239/100‑1 (MQ=255) ttttattttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGTTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACAGATTGAGGt > 1:802959/1‑100 (MQ=255) ttattttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGttt < 2:2209099/100‑1 (MQ=255) attttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTcc < 2:2349852/100‑1 (MQ=255) attttTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTcc < 2:580704/100‑1 (MQ=255) tttttGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATATCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGTGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTcc < 1:2545784/99‑1 (MQ=255) tttttGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCt > 2:585808/1‑100 (MQ=255) ttttGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCta < 1:90589/100‑1 (MQ=255) ttttGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCt > 1:1901658/1‑99 (MQ=255) gTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTTGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGACGTTTCCTATAgg < 1:509882/100‑1 (MQ=255) gTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAgg < 1:173412/100‑1 (MQ=255) gTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAgg < 1:1330275/100‑1 (MQ=255) gTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAgg < 2:2452122/100‑1 (MQ=255) atTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGAGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTAGAGGTcttcat > 2:1851350/1‑100 (MQ=255) tAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTAttcattca < 2:101754/100‑1 (MQ=255) aTGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTAGCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGAATGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCaaa > 1:3052534/1‑100 (MQ=255) aaTTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAActat > 1:3258150/1‑99 (MQ=255) gACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATAtctc > 1:2365244/1‑100 (MQ=255) aCTGATAGCCACATCTCTCCGTGTGTGGGTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGTGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATAtctc < 1:2951833/99‑1 (MQ=255) cTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATGTTTTTATCTACTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTACCCATAGGGATTAATTCACATATATATCAg > 1:2167826/1‑100 (MQ=255) GATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGtt < 1:2433167‑M1/100‑1 (MQ=255) GATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGtt > 1:585805‑M1/1‑100 (MQ=255) | TCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTT > NC_000913/4541823‑4542021 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |