| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4555361 = | 141 (1.140) | 12 (0.110) | 8/158 | NT | 8.8% | intergenic (+12/+129) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 4555390 = | 125 (1.140) | intergenic (+41/+100) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
ACGTCTGCTGGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACC > NC_000913/4555262‑4555460 | taccaggaagaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaa < 1:2146790‑M1/1‑1 (MQ=255) gTCTGCTGGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAg > 2:3346718/1‑100 (MQ=255) ccaggaagaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAg < 2:1997766‑M1/3‑1 (MQ=255) tCTGCTGGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAgc < 2:446794/100‑1 (MQ=255) caggaagaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAgc > 1:2206164‑M1/97‑100 (MQ=255) gctgGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCa > 1:3268594/1‑100 (MQ=255) gctgGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCa > 1:2887524/1‑100 (MQ=255) gaagaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCa > 1:944918‑M1/94‑100 (MQ=255) ctgGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCaa > 2:3199770/1‑100 (MQ=255) tgGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAg > 2:237324/1‑100 (MQ=255) ggAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAgg > 1:3033763/1‑100 (MQ=255) ggAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAgg > 1:1202070/1‑100 (MQ=255) gAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAgga > 2:318529/1‑99 (MQ=255) aataatcGAAGGTTTACAATATTGATTGTGATGGCTATCTTTTTCATTAATGGCCGCGGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAg < 1:3125944/86‑1 (MQ=255) ttCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTaa < 1:1485582/100‑1 (MQ=255) tctcGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTaaa < 1:1411814/100‑1 (MQ=255) tctcGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTaaa > 2:1947337/1‑100 (MQ=255) ctcGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATCAGCGCAAGGGTAAAc > 1:2353689/1‑100 (MQ=255) ctcGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAAc > 2:2870040/1‑100 (MQ=255) ctcGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAAc > 2:2613948/1‑100 (MQ=255) aCGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTcc < 1:2716534/100‑1 (MQ=255) cGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGTCGCTGGATGAAGTTGACGCCTGGATTATTATAATAAGCGCGAGGGTATACGTTCCt > 1:3279968/1‑100 (MQ=255) cGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCt > 2:1187509/1‑100 (MQ=255) gACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCCTGTCCGCTGGATAAAGTCGACGTCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTgcg < 1:1844176/100‑1 (MQ=255) caggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTgcgc > 1:97674‑M1/74‑100 (MQ=255) aCGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTgcgc < 2:1805456/100‑1 (MQ=255) aggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCt > 2:1277647‑M1/73‑100 (MQ=255) gttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCttt > 1:1376365‑M1/71‑100 (MQ=255) gttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCttt > 1:691254‑M1/71‑100 (MQ=255) gttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCttt > 1:357952‑M1/71‑100 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt < 1:2810282/100‑1 (MQ=255) ttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTa > 2:778696/1‑100 (MQ=255) atttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAGTAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTaaa < 1:1819174/100‑1 (MQ=255) atttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTaaa > 1:3126944/1‑100 (MQ=255) tttGGTGGCTGTCGGTTTTGTTGAAGGTCACTGGGTAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAtt < 1:2817077/100‑1 (MQ=255) tttGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAtt < 1:2906292/100‑1 (MQ=255) tttGATGGCTATCTGTTTGATTCATAGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAtt < 1:1444040/100‑1 (MQ=255) atagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTa > 2:196589‑M1/62‑100 (MQ=255) tGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaa > 1:1909168/1‑100 (MQ=255) gATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaag < 1:1005468/100‑1 (MQ=255) aTGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 1:3373624/100‑1 (MQ=255) aTGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 1:2538672/100‑1 (MQ=255) taaacaataccctgcgatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaag > 2:3334148‑M1/57‑100 (MQ=255) ggCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaag > 1:2365421/1‑100 (MQ=255) ggCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaag > 2:1383926/1‑100 (MQ=255) ggCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaag < 1:668484/100‑1 (MQ=255) aaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaag > 2:16944‑M1/56‑99 (MQ=255) cTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGGGCAAGGGTAAAGGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga > 1:3188318/1‑96 (MQ=255) cTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCaa > 1:1761692/1‑100 (MQ=255) cTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCa > 1:1970514/1‑99 (MQ=255) tGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAAt > 2:683094/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg > 2:2332190/1‑100 (MQ=255) gTTTGATCCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg > 2:1782744/1‑100 (MQ=255) tGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATTAGCGCAAGGGTACACGTTCCTTACGCTTTCTTAAATTAAGAAGtaaccacga > 1:3156945/1‑90 (MQ=255) aTTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAt > 2:1100483/1‑100 (MQ=255) aTTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAt > 1:1266294/1‑100 (MQ=255) aTTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAt < 1:3348764/100‑1 (MQ=255) tGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACtt < 1:877245/100‑1 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg > 2:3097782/1‑100 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg > 2:1147334/1‑100 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg < 2:1828695/100‑1 (MQ=255) cGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg < 1:1677486/98‑1 (MQ=255) cGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTa < 2:1926736/100‑1 (MQ=255) aTAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGc > 2:236828/1‑100 (MQ=255) aTAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGc < 2:2171070/100‑1 (MQ=255) tAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCa < 1:3215147/100‑1 (MQ=255) aaaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAg < 1:2730422/100‑1 (MQ=255) aGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAggg < 2:337367/100‑1 (MQ=255) gttgACGCCTGCCTTATTATACTAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTCGTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGGCTTACTTTGTGAATTGCAgg < 1:395715/95‑1 (MQ=255) gTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGt > 1:587380/1‑100 (MQ=255) gTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGt > 2:2855511/1‑100 (MQ=255) gTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAACTCACAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAggg > 1:2390590/1‑99 (MQ=255) gACGCCTGACTTATTAT‑ATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTg > 1:824361/1‑100 (MQ=255) cGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGt > 2:1921461/1‑100 (MQ=255) ccTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGttt > 2:1481196/1‑100 (MQ=255) ccTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGttt < 2:2349811/100‑1 (MQ=255) tGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg < 2:2180342/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 2:1663677/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 2:3191852/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 2:2536376/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 2:1711051/100‑1 (MQ=255) ttattaTAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 1:2193216/97‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc < 2:2791660/100‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc > 1:1546501/1‑100 (MQ=255) attatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCt > 2:553942/1‑100 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 2:90831/100‑1 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 2:114534/100‑1 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg > 2:224892/1‑100 (MQ=255) tataATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTACATTAAGAAGTCGCCATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAAGGTATTGTTTAGCTa > 2:3259157/1‑95 (MQ=255) tataATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGt < 1:2445197/100‑1 (MQ=255) ataataAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGta > 1:2310687/1‑100 (MQ=255) ataataAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGta < 1:3353975/100‑1 (MQ=255) taataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGTGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATTAGTGTTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGt < 1:1574796/98‑1 (MQ=255) aataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata > 1:1049425/1‑100 (MQ=255) aataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata < 2:2032496/100‑1 (MQ=255) aataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtat > 1:2668405/1‑99 (MQ=255) taaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTAGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGAGTATTGTTTAGCAATCTGTATAAc > 1:2470454/1‑100 (MQ=255) AAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAAcc > 2:1017154‑M1/1‑100 (MQ=255) AAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAAcc > 1:771854‑M1/1‑100 (MQ=255) AAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAAcc > 1:2613928‑M1/1‑100 (MQ=255) | ACGTCTGCTGGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACC > NC_000913/4555262‑4555460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |