| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4555361 = | 141 (1.140) | 12 (0.110) | 8/158 | NT | 8.8% | intergenic (+12/+129) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 4555390 = | 125 (1.140) | intergenic (+41/+100) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
ATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCTGGTAG > NC_000913/4555291‑4555489 | gttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCttt > 1:691254‑M1/71‑100 (MQ=255)gttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCttt > 1:357952‑M1/71‑100 (MQ=255)gttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCttt > 1:1376365‑M1/71‑100 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt < 1:3258804/100‑1 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt < 1:2810282/100‑1 (MQ=255) tttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCtt > 1:2356383/1‑100 (MQ=255) ttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTa > 2:1808691/1‑100 (MQ=255) tatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTaa > 1:204617/1‑100 (MQ=255) atttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTaaa > 1:3126944/1‑100 (MQ=255) atttTGATGGCTACCTGTTTGATTCCTGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTaaa < 1:2153737/100‑1 (MQ=255) tttGGTGGCTGTCGGTTTTGTTGAAGGTCACTGGGTAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAtt < 1:2817077/100‑1 (MQ=255) tttGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAtt < 1:2906292/100‑1 (MQ=255) tttGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAtt < 1:1886931/100‑1 (MQ=255) tttGATGGCTATCTGTTTGATTCATAGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAtt < 1:1444040/100‑1 (MQ=255) atagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTa > 2:196589‑M1/62‑100 (MQ=255) tGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaa > 1:1909168/1‑100 (MQ=255) gATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaag < 1:1005468/100‑1 (MQ=255) aTGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 1:2538672/100‑1 (MQ=255) aTGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 1:3373624/100‑1 (MQ=255) ctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaa > 1:276496‑M1/58‑100 (MQ=255) taaacaataccctgcgatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaag > 2:3334148‑M1/57‑100 (MQ=255) ggCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaag < 1:668484/100‑1 (MQ=255) ggCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaag > 2:1383926/1‑100 (MQ=255) gCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGt < 2:472212/100‑1 (MQ=255) aaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaag > 2:16944‑M1/56‑99 (MQ=255) cTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGGGCAAGGGTAAAGGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga > 1:3188318/1‑96 (MQ=255) gTTTGATCCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg > 2:1782744/1‑100 (MQ=255) gATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTa < 2:318842/100‑1 (MQ=255) aTTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAt > 2:1100483/1‑100 (MQ=255) aTTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAt > 1:1266294/1‑100 (MQ=255) aTTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAt < 1:3348764/100‑1 (MQ=255) tGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGCAGTCGCAATGAGTATTACtt > 2:227014/1‑100 (MQ=255) tGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACtt < 1:877245/100‑1 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg > 2:3097782/1‑100 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg < 2:1828695/100‑1 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg > 2:2875707/1‑100 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg > 2:1147334/1‑100 (MQ=255) ccGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGt > 2:1255555/1‑100 (MQ=255) cGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg < 1:1677486/98‑1 (MQ=255) cGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTa < 2:1926736/100‑1 (MQ=255) cGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTa > 2:2526449/1‑100 (MQ=255) ggATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAtt > 1:177904/1‑100 (MQ=255) aTAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGc > 2:236828/1‑100 (MQ=255) aTAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGc < 2:2171070/100‑1 (MQ=255) tAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCa > 2:562307/1‑100 (MQ=255) tAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCa < 1:3215147/100‑1 (MQ=255) aaaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAg > 1:376056/1‑100 (MQ=255) gttgACGCCTGCCTTATTATACTAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTCGTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGGCTTACTTTGTGAATTGCAgg < 1:395715/95‑1 (MQ=255) gTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAACTCACAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAggg > 1:2390590/1‑99 (MQ=255) tCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTa > 2:855060/1‑100 (MQ=255) gACGCCTGACTTATTAT‑ATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTg > 1:824361/1‑100 (MQ=255) cGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGt > 1:109376/1‑100 (MQ=255) acttcttaatttaagaaagcgcaaggaacgtttacccttgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGttt > 2:41129‑M2/46‑100 (MQ=255) tGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg < 2:2180342/100‑1 (MQ=255) tGACCTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg < 1:1825057/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 2:1867319/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 2:1711051/100‑1 (MQ=255) aCTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTCTTTAGc < 1:3275031/99‑1 (MQ=255) tattatattaAGCGCAAACGTAAACGTTCGTTGGGCTTTCTTAAATTAAGAAGTAGCAATGAGTATAACTTTGTAACTTGCAGTGTATTGTTCAGCTa < 1:2448710/98‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc > 1:1546501/1‑100 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc < 2:2791660/100‑1 (MQ=255) attatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCt > 1:1399326/1‑100 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 2:114534/100‑1 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 2:768419/100‑1 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 2:3192266/100‑1 (MQ=255) tataATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTACATTAAGAAGTCGCCATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAAGGTATTGTTTAGCTa > 2:3259157/1‑95 (MQ=255) ataataAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGta > 1:2310687/1‑100 (MQ=255) ataataAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGta < 1:3037673/100‑1 (MQ=255) taataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGTGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATTAGTGTTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGt < 1:1574796/98‑1 (MQ=255) taataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtat > 1:3147970/1‑100 (MQ=255) agaaagcgcaaggaacgtttacccttgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata > 2:2843962‑M2/33‑100 (MQ=255) aataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata < 2:2032496/100‑1 (MQ=255) ataaGCGCAAGGATAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATaa > 2:2224038/1‑100 (MQ=255) aaagcgcaaggaacgtttacccttgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACATTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAAc > 2:3121566‑M2/31‑100 (MQ=255) AAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAAcc > 1:2613928‑M1/1‑100 (MQ=255) AAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAAcc > 2:1017154‑M1/1‑100 (MQ=255) GCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTg < 1:539910‑M1/100‑1 (MQ=255) GCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGaa > 1:2343952‑M1/1‑100 (MQ=255) GCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGaa < 2:38545‑M1/100‑1 (MQ=255) GCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGaa > 2:2642393‑M1/1‑100 (MQ=255) agGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATg > 2:1507089‑M1/3‑100 (MQ=255) AAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATg > 1:1728886‑M1/1‑100 (MQ=255) ggTAAACATTCCTTGCGCTTTCTTCAATTAAGAAGTCGCAATGAGTACTACTTTGTAAATTGCGGGGCATTGTTTAGCTATGTGTTTAACCTGAAAGtt > 1:755287/1‑99 (MQ=255) GGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTa > 2:2348475‑M1/1‑100 (MQ=255) gTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAg < 2:1658498/100‑1 (MQ=255) aaaCGTTCCTTGCGCTTTTTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTa < 1:1190734/100‑1 (MQ=255) aaCGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTAc < 2:2356400/100‑1 (MQ=255) aaCGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTAc > 2:1411646/1‑100 (MQ=255) aaCGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTAc > 1:995715/1‑100 (MQ=255) aCGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACt > 2:1187854/1‑100 (MQ=255) cGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTc > 1:194063/1‑100 (MQ=255) cttgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAttct > 2:3361754‑M2/10‑100 (MQ=255) cttgcgcttTCTTAAATCAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAttct > 1:654564‑M2/10‑100 (MQ=255) tgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAttcttc > 1:2197632‑M2/8‑100 (MQ=255) tgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAttcttc > 1:945028‑M2/8‑100 (MQ=255) cgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCt > 1:3358098‑M2/6‑100 (MQ=255) gcttTCTTAAATGAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCt < 1:2688785‑M2/95‑1 (MQ=255) cttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCTgg < 2:1997766‑M2/97‑1 (MQ=255) tTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCTGGTa < 1:2146790‑M2/99‑1 (MQ=255) tCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCTGGTAg > 1:2437908/1‑100 (MQ=255) | ATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCTGGTAG > NC_000913/4555291‑4555489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |