| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 4102697 = | NA (NA) | 10 (0.070) | 9/168 | NT | NA | noncoding (2/26 nt) | REP300 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP300 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 4102721 = | NA (NA) | noncoding (26/26 nt) | REP300 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP300 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
TAAAGTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGCTATTGAGTTCCTGCCTGGATACTTACCGCGAAAACAGCACGCCTGACATAAAATAAATATGGTCTAATGGGGAAATTTCTCGTGGAGAGGGAACA > NC_000913/4102622‑4102820 | aaaGTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGtt < 2:2037952/100‑1 (MQ=255) aaaGTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGtt < 2:2223281/100‑1 (MQ=255) aaaGTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGtt > 1:2148209/1‑100 (MQ=255) aaGTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGttt < 1:912113/100‑1 (MQ=255) aaGTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGttt > 1:1720843/1‑100 (MQ=255) aaGTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGttt > 1:2483802/1‑100 (MQ=255) aaGTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATGTTAGGGACGGTGAAATAACCCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGtt < 2:438097/99‑1 (MQ=255) aGTCAAAGCCAGAGCTGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTg < 1:4115251/100‑1 (MQ=255) tagaccatatttattttatgtcaggcgtgctgttttcgcggtaagtatccaggcaggaactcaatagcaaaCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGc > 1:4008166‑M1/72‑100 (MQ=255) tagaccatatttattttatgtcaggcgtgctgttttcgcggtaagtatccaggcaggaactcaatagcaaaCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGc > 1:4008147‑M1/72‑100 (MQ=255) gTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTg > 2:408259/1‑99 (MQ=255) gTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGc > 2:3151582/1‑100 (MQ=255) gTCAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGc < 2:2946144/100‑1 (MQ=255) cAAAGCCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGCTa > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |