New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2133431 | NA (NA) | 13 (0.090) | 8/164 | NT | NA | intergenic (‑34/+59) | wcaA/wzc | putative glycosyl transferase/colanic acid production tyrosine‑protein kinase; autokinase; Ugd phosphorylase |
? | NC_000913 | = 2133461 | NA (NA) | noncoding (30/34 nt) | REP145 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP145 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
CCGAATCGCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCGTATTCGTAATAGCCAT > NC_000913/2133332‑2133530 | ccgaagcttcAGCTGTTGGGGGGTCCAGGCCGGCATATGGAATGAGAGCAGAGCATCATTTTTAATGGGTTGTTCTCCCGGATTATGAGCTGGTttgctt > 1:2104375/10‑100 (MQ=255) aaTCGCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgcc > 2:2524314‑M1/1‑97 (MQ=255) aTCGCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccg < 2:3772971‑M1/100‑5 (MQ=255) tCGCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccgg > 2:3728179‑M1/1‑95 (MQ=255) tCGCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccgg < 1:1980787‑M1/100‑6 (MQ=255) cGCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccgga > 1:2764455‑M1/1‑94 (MQ=255) cGCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccgga > 1:255096‑M1/1‑94 (MQ=255) gccaacaactggcggttccaGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccggat > 2:2708529‑M1/10‑93 (MQ=255) gCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccggat > 2:943457‑M1/1‑93 (MQ=255) gCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccggat > 2:319274‑M1/1‑93 (MQ=255) ccAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATg < 2:271767/100‑1 (MQ=255) cAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATgc > 1:2533829/1‑100 (MQ=255) tgttgGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATgcggcg < 2:552758/100‑1 (MQ=255) tgttgGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATgcggcg < 2:437333/100‑1 (MQ=255) gttgGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGt > 2:1144980/1‑100 (MQ=255) gttgGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTATTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATgcgg > 1:2373407/1‑97 (MQ=255) ttgGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTg < 1:1807495/100‑1 (MQ=255) tgGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGa > 1:1763282/1‑100 (MQ=255) ggCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGGTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccggataaggcgttca < 2:254941‑M1/100‑18 (MQ=255) gCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTCTGAGCTGGTTTGCTTGGCGGATGCGGCGTGAAc > 1:2095599/1‑100 (MQ=255) gCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAAc < 2:2111232/100‑1 (MQ=255) gTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATTAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGcc > 1:2501033/1‑100 (MQ=255) ttCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCt < 1:3595870/100‑1 (MQ=255) cAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCtt < 2:3972975/98‑1 (MQ=255) cAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAT < 2:1979041‑M2/100‑1 (MQ=255) ngtCGGCATATAGATGTAGAGCAGCTGATTGTTTTTCATAGGTTGTTTTCCCGGCTTATGATCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATC < 1:627707‑M2/98‑1 (MQ=255) ggTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATC < 2:3614824‑M2/99‑1 (MQ=255) cGGTATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGC > 1:490‑M2/1‑100 (MQ=255) cGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccggataaggcgttcacgccgcatccggc < 2:3906380‑M1/100‑31 (MQ=255) cGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGC > 2:3555342‑M2/1‑100 (MQ=255) cGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGC > 2:3868581‑M2/1‑100 (MQ=255) ggCATATAGATTGAGTTCAGCGGATTGTTGTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccggataaggcgttcacgccgcatccggca < 1:1125164‑M1/100‑32 (MQ=255) ggCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccggataaggcgttcacgccgcatccggca < 1:1125165‑M1/100‑32 (MQ=255) ggCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGcc < 2:2919091/100‑1 (MQ=255) ggCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGC < 1:3872540‑M2/99‑1 (MQ=255) ggCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGC < 2:2213397‑M2/99‑1 (MQ=255) ggctatagatTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaa > 2:526970‑M2/4‑98 (MQ=255) gcctataGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCt > 1:697937/4‑100 (MQ=255) cATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccggataaggcgttcacgccgcatccggcaag < 2:2133056‑M1/100‑34 (MQ=255) cATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaag > 2:2743006‑M2/1‑97 (MQ=255) atatAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTgccggataaggcgttcacgccgcatccggcaagc < 2:1978798‑M1/100‑35 (MQ=255) atatAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaagc > 1:2969697‑M2/1‑96 (MQ=255) tataGATTGAGATCAGCGGATTGGGTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCGTATGAGTTGGTTTGTTTTCCGGATGCGGCGTGAACGCTTTATTTGGCCt > 1:847025/1‑97 (MQ=37) ataGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTCCg > 1:4188336/1‑99 (MQ=255) taGATTGATATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTAc < 1:3807780/97‑1 (MQ=255) aGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACgggg > 2:1495073/1‑100 (MQ=255) aTTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCg > 2:2036061/1‑100 (MQ=255) aTTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCg > 1:217725/1‑100 (MQ=255) gaTCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCg < 1:1195706/100‑1 (MQ=255) tCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGCTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGaa < 1:4198/100‑1 (MQ=255) aGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATg > 2:1436424/1‑100 (MQ=255) gCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGc < 2:3010333/100‑1 (MQ=255) ggATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGCTGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGTCGGTGCGAATGCa > 1:559216/1‑99 (MQ=255) gATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAgg < 2:708647/100‑1 (MQ=255) ttGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGcg < 1:4063811/100‑1 (MQ=255) gTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGcgtc > 1:3920392/1‑100 (MQ=255) tttttCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTCCGGGGCGGTGCGAATGCAGGcgtcg > 1:1637294/1‑100 (MQ=255) ttttCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaagcaaaccagctcataagccgggagaac < 1:563205‑M2/100‑30 (MQ=255) ttCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTa < 2:2283117/100‑1 (MQ=255) aGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGGCGGATGCTGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCTAATGCATGCGTCGTTATTTCg < 1:1244553/100‑1 (MQ=38) aGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCg < 2:1120794/100‑1 (MQ=255) aGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCg < 2:1943865/100‑1 (MQ=255) aGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCg < 1:1536456/100‑1 (MQ=255) ggTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGc > 2:3387602/1‑100 (MQ=255) ggTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGc > 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ctcCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGAc < 1:3659898/100‑1 (MQ=255) ctcCCGGCTTATGAGCAGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATGTAGCATc > 1:3398186/1‑96 (MQ=255) cccGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCGCGCCTACGGGGCGGTGCGAACGCAGGCGGCGGTCTTTCGCCTCCGACt > 1:4002141/1‑99 (MQ=37) cccGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACtt > 2:1601796/1‑100 (MQ=255) ccGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTta < 1:319272/100‑1 (MQ=255) ccGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTta > 2:1186129/1‑100 (MQ=255) ctgCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTtat > 2:2900554/3‑100 (MQ=255) cGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTtat < 1:2719480/100‑1 (MQ=255) aTGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGTCTTGAACGCCTTATCCTGACGACGTGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTAtattcgt < 1:2692619/100‑1 (MQ=255) gAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTAtattcgtat > 1:876841/1‑100 (MQ=255) aGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTAtattcgtatt < 1:3556373/100‑1 (MQ=255) gCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTAtattcgtattc > 1:1878104/1‑100 (MQ=255) ggTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGGGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATAttcgtattcgta > 1:467530/1‑100 (MQ=255) ggTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTAtattcgtattcg > 1:1388829/1‑98 (MQ=255) ggTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATAttcgtattcgta > 2:2374360/1‑100 (MQ=255) ggTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGAGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATattcgtattcgt > 2:263817/1‑99 (MQ=255) tttGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCGTATTCGTAAt < 1:3081679/100‑1 (MQ=255) ttgcttgcCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCGTATTCGTAATa > 1:3350450/1‑100 (MQ=255) tgcttgcCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCaagcaaaccagctcataagccgggagaacaacctatgaaaaacaatccgctgatctcaatctata < 2:3434707‑M2/100‑66 (MQ=255) tacttgcCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCGTATTCGTAATAg < 1:9730/98‑1 (MQ=255) gcttgcCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCGTATTCGTAATAGc < 2:4236268/100‑1 (MQ=255) gcttgcCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGAAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCTTATTCGTAATAGc > 1:1703210/1‑100 (MQ=255) nttgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcaagcaaaccagctcataagccgggagaacaacctatgaaaaacaatccgctgatctcaatctatat > 1:80058‑M1/2‑3 (MQ=255) ttgcCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCaagcaaaccagctcataagccgggagaacaacctatgaaaaacaatccgctgatctcaatctatatgc < 2:764699‑M2/100‑69 (MQ=255) ttgcCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCGTATTCGTAATAGCCa < 2:180654/100‑1 (MQ=255) tgcCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCaagcaaaccagctcataagccgggagaacaacctatgaaaaacaatccgctgatctcaatctatatgcc < 1:2017338‑M2/100‑70 (MQ=255) tgcCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCGTATTCGTAATAGCCAt > 1:3268479/1‑100 (MQ=255) tgcCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCGTATTCGTAATAGCCAt > 1:1135899/1‑100 (MQ=255) | CCGAATCGCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCGTATTCGTAATAGCCAT > NC_000913/2133332‑2133530 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |