| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1294420 = | NA (NA) | 9 (0.060) | 5/168 | NT | NA | intergenic (+276/+6) | tdk/insZ | thymidine kinase/deoxyuridine kinase/pseudogene, transposase homolog |
| ? | NC_000913 | 1294445 = | NA (NA) | noncoding (961/980 nt) | ISZ | repeat region | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
TAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATG > NC_000913/1294321‑1294519 | tAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAAt > 2:1547075/1‑100 (MQ=255) ggggtgctctggaagtggtgttcataacaaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGc < 1:4233586‑M1/3‑1 (MQ=255) ggggtgctctggaagtggtgttcataacaaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGc < 1:3996417‑M1/3‑1 (MQ=255) ggCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGc > 1:3098992/1‑100 (MQ=255) gCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGcc < 2:738088/100‑1 (MQ=255) gTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGTCCCCAGAAGGGCAATGCCGt < 1:2603518/100‑1 (MQ=255) gTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGt > 1:1597835/1‑100 (MQ=255) tataCATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTc > 1:1909379/1‑100 (MQ=255) tataCATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTc < 2:3771993/100‑1 (MQ=255) tacctcaaagCAAATAAGAAGAACGATCACGCTGCACGTTTATAGAACAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCTATGTTGTTc < 1:1848596/89‑1 (MQ=255) taCATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCAc < 2:1923749/100‑1 (MQ=255) gatgggagaaaaTACGATGAAGGATAATGCAGTAGGTTAATGGAAAAGGTGGTTTGGGAAAACAAAGAATACGGCCCAAGAAGGGCAATGCCGTTCACtt < 1:3896875/91‑1 (MQ=255) cATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACtt > 2:896822/1‑100 (MQ=255) cATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACtt > 1:1966794/1‑100 (MQ=255) cATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACtt > 1:2467428/1‑100 (MQ=255) aacgtcgCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGGCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTAGGTAAACAAAAAATACGGCCCCATAAGGGCAATGCCGTTCACTTa < 1:2048846/98‑1 (MQ=255) aTCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAACATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTa > 1:171246/1‑100 (MQ=255) aTCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTa < 2:1964248/100‑1 (MQ=255) cgtcgCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAag > 2:1154528/1‑100 (MQ=255) cgtcgCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAag < 1:1203756/100‑1 (MQ=255) gCAAATATGATGAAGGCTTATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTa < 1:2921661/94‑1 (MQ=255) cAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAgaggag > 1:1017265/1‑100 (MQ=255) cAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAgaggag > 1:1823502/1‑100 (MQ=255) atatGATGAAGGCACATGCTGACGGTTTTTGGAAAAGTTGCATAAAATAAAAAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGc < 1:2497490/98‑1 (MQ=255) tatGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGc < 2:503314/100‑1 (MQ=255) tatGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGc > 2:1640554/1‑100 (MQ=255) tatGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGc < 2:2512940/100‑1 (MQ=255) tgatgcAGGCTCATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGGGCGGCAc < 1:517824/100‑1 (MQ=255) tgatgaAGGCTAATGCCGCCGGCATATGCAAAAGTTGCTTTGGGTAAAACCAAAATACGGACCCAGAAGAGAAATGCCGTTCACTGAAGAGCACCGGCa > 1:2314170/1‑99 (MQ=255) taacaaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACt > 1:294698‑M1/74‑100 (MQ=255) acaaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTAt > 2:1046343‑M1/72‑100 (MQ=255) caaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATg > 2:4045395‑M1/71‑100 (MQ=255) caaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATg > 2:219590‑M1/71‑100 (MQ=255) aaaacgcccccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATg > 2:3615706‑M1/70‑99 (MQ=255) aaGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGt > 2:2681464/1‑100 (MQ=255) aaGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGt < 2:925449/100‑1 (MQ=255) cTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTca < 1:3057905/100‑1 (MQ=255) tAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTcac < 2:2359473/100‑1 (MQ=255) tAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTcac > 1:737231/1‑100 (MQ=255) aTGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAg < 2:3454310/100‑1 (MQ=255) aTGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAg < 1:219383/100‑1 (MQ=255) tGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAgg < 1:3808568/100‑1 (MQ=255) cccgaccatcaaggccgaggtcggttaagatatcaaaaacccgttatcctgtgaaacatagTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTcac > 1:3321689‑M1/62‑97 (MQ=255) cTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGAt > 2:3652749/1‑100 (MQ=255) cTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGAt > 2:2382959/1‑100 (MQ=255) cGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTAACTTAAGAGTAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACg < 1:154905/100‑1 (MQ=255) gTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACggg > 1:142176/1‑100 (MQ=255) tttATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGt > 1:1072391/1‑100 (MQ=255) cgatctaaGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGtttt < 1:1180247/94‑1 (MQ=255) tGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGttttt < 2:3999497/100‑1 (MQ=255) tGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGttttt > 2:4233608/1‑100 (MQ=255) tGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGttttt > 2:141116/1‑100 (MQ=255) tGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAAAGGAGAGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGttttt > 1:2879197/1‑100 (MQ=255) ggAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTg < 2:2097689/100‑1 (MQ=255) ggAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTg < 2:3598312/100‑1 (MQ=255) ggAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTg > 2:1034447/1‑100 (MQ=255) ggAAAAGTTGCCTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTg < 1:3913511/100‑1 (MQ=255) aaaaGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGat < 1:226025/100‑1 (MQ=255) aaGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTAGatcg > 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aaaaaaTACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCt > 2:955841/1‑100 (MQ=255) aaaaaaTACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCt > 2:60621/1‑100 (MQ=255) aaTACGGCCCCAGAAGGGCAATGCTGTTTATTTTAGTGGTGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTGGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGAt < 2:222690/100‑1 (MQ=255) aaTACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGAt < 2:482790/100‑1 (MQ=255) ccccAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCggn < 1:275509/100‑2 (MQ=255) ccccAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCg > 1:3512604/1‑98 (MQ=255) cccAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCgggg < 1:1353882/100‑1 (MQ=255) ccAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCggggg > 1:3147517/1‑100 (MQ=255) ccAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCggggg > 2:745422/1‑100 (MQ=255) gAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGt > 1:99525/1‑100 (MQ=255) ggCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTg > 1:3648810/1‑100 (MQ=255) ggCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTg < 2:3085344/100‑1 (MQ=255) gCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGt < 1:1791112/100‑1 (MQ=255) cAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGtt > 2:3270452/1‑100 (MQ=255) cAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGGTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTg > 2:2325935/1‑98 (MQ=255) aaTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTa < 2:292746/100‑1 (MQ=255) aaTGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTa < 1:3577798/100‑1 (MQ=255) TGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATg > 2:2117487‑M1/1‑100 (MQ=255) TGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTAGGTTTCACAGTATAAAGGTTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCATTGGCGTTTTGTTATg > 1:65402‑M1/1‑100 (MQ=255) | TAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCACAGGATAACGGGTTTTTGATATCTTAACCGACCTCGGCCTTGATGGTCGGGGGCGTTTTGTTATG > NC_000913/1294321‑1294519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |