| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4624213 = | 138 (0.900) | 5 (0.030) | 4/168 | NT | 3.9% | coding (577/645 nt) | ytjB | SMP_2 family putative membrane‑anchored periplasmic protein |
| ? | NC_000913 | 4624245 = | 119 (0.820) | coding (545/645 nt) | ytjB | SMP_2 family putative membrane‑anchored periplasmic protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
CACTCTTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCGTAT > NC_000913/4624146‑4624344 | cACTCTTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCg < 1:3398466/100‑1 (MQ=255) tctTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGc < 2:1087627/100‑1 (MQ=255) ccactaacattttgcgcctgatgttgctgctctcactgtcaatcggtgttgtgctgacccgcacGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTg > 1:1077942‑M1/65‑99 (MQ=255) ccactaacattttacgcctgatgttgctgctctcactggcaatcggtgtagtgctgacccgcacGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGc > 1:1377094‑M1/65‑100 (MQ=255) ctTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCg < 2:1831061/100‑1 (MQ=255) cactaacattttacgcctgatgttgctgcactcactggcaagcggtgtagtgctgacccgcacGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCg > 1:3946215‑M1/64‑100 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCTGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg < 2:1485174/100‑1 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg < 1:2130342/100‑1 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg < 2:306650/100‑1 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTGCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGAGTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg < 1:907267/100‑1 (MQ=255) tctctcGCGTTCTTCCTCTTCCGTCACCGGTTTGCCGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGCGTGCGTTTACCCTGTAGCAgcgcgc < 1:3843633/93‑1 (MQ=255) tctcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCa < 1:485832/99‑1 (MQ=255) tctcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCCGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGCTCAg > 1:2522240/1‑100 (MQ=255) tcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCa < 2:868783/100‑1 (MQ=255) tcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCa < 1:768574/100‑1 (MQ=255) cGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGAGTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAg < 1:3711096/97‑1 (MQ=255) gCTTTCTTCCTCTTCCGGCAACGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGc < 2:2324386/97‑1 (MQ=255) cTTTCTTACTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTa > 2:2240598/1‑100 (MQ=255) tttCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTac > 1:400686/1‑100 (MQ=255) ttcttcCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTaca < 2:557220/100‑1 (MQ=255) cttcctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACAcc > 2:1666704/1‑100 (MQ=255) cttcctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACAcc < 2:2070644/100‑1 (MQ=255) ttcctcttccGGCACCTGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCg < 1:2501570/100‑1 (MQ=255) ctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGAtt < 2:359605/100‑1 (MQ=255) ctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGAtt > 2:162455/1‑100 (MQ=255) tcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTg > 1:569102/1‑100 (MQ=255) tcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTg > 2:4022896/1‑100 (MQ=255) tcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTg < 1:3492319/100‑1 (MQ=255) ttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGcc < 2:762080/100‑1 (MQ=255) tccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCa < 1:112161/100‑1 (MQ=255) ccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAg < 2:3643092/100‑1 (MQ=255) ccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAg > 2:3818386/1‑100 (MQ=255) cGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGt < 2:2751956/100‑1 (MQ=255) cGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGt > 2:2664883/1‑100 (MQ=255) cACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTgag < 1:3821737/100‑1 (MQ=255) aCCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTgaga < 2:2687047/100‑1 (MQ=255) ccGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGagag < 1:75384/100‑1 (MQ=255) cGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagc < 2:859921/100‑1 (MQ=255) cGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagc < 1:2128312/100‑1 (MQ=255) ggTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagca > 2:733304/1‑100 (MQ=255) ggTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagca < 2:100508/100‑1 (MQ=255) tttGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagcagc < 1:2968006/100‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACTCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAgcagca < 1:926159/100‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCaa > 1:3153056/1‑100 (MQ=255) gCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAAc > 2:1373380/1‑100 (MQ=255) ggCTGTGAACAGGAACGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGGGCGGGGCAGCACTACACCGATTGCCAGTGCGGGCAGCAACCTc > 1:2092554/1‑100 (MQ=255) ggCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCGAGTGAGAGCAGCAACAt > 1:1096795/1‑99 (MQ=255) ggCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGCTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATc > 1:1671259/1‑100 (MQ=255) gCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCa < 1:2005703/100‑1 (MQ=255) cGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAg < 2:250569/100‑1 (MQ=255) ggTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAgg < 2:1942180/100‑1 (MQ=255) ttAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCg < 1:2741713/100‑1 (MQ=255) tAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCg > 2:2573107/1‑99 (MQ=255) aaCAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTa < 2:1626378/100‑1 (MQ=255) aCAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACCCCGATTGCCGGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTa > 1:2386522/1‑99 (MQ=255) aCAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTaa > 1:2021227/1‑100 (MQ=255) cAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTaaa > 2:121304/1‑100 (MQ=255) cAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTaaa < 2:2460350/100‑1 (MQ=255) aGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTaaaa > 2:3944112/1‑100 (MQ=255) ggAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAAt < 2:3248044/100‑1 (MQ=255) aaGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGt > 2:2969711/1‑100 (MQ=255) aaGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGt > 2:3262590/1‑100 (MQ=255) aGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGtt > 2:1323981/1‑100 (MQ=255) gCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgt < 1:3257692/100‑1 (MQ=255) cgcacgctgctacagggtaaacgcacccgctggcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGTAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtg > 1:2033557‑M2/38‑100 (MQ=255) gcacgctgctacagggtaaacgcacccgctggcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtgg > 1:1377094‑M2/37‑100 (MQ=255) gATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtgg > 1:1319053/1‑100 (MQ=255) aTTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtggt > 2:3474497/1‑100 (MQ=255) GCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGgtgt < 1:4246136‑M1/99‑1 (MQ=255) CTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTa > 2:2075372‑M1/1‑100 (MQ=255) GCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATc > 1:1101659‑M1/1‑100 (MQ=255) GCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATc < 1:559128‑M1/100‑1 (MQ=255) cAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCa < 2:1726697/100‑1 (MQ=255) aGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCAc > 1:1603550/1‑100 (MQ=255) gCGGGTGCGTTTACCTTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCAcc < 2:2248583/100‑1 (MQ=255) gggTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTg > 1:3665078/1‑100 (MQ=255) ggTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGt > 2:962189/1‑100 (MQ=255) ggTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGt > 2:3533846/1‑100 (MQ=255) gTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGtt < 1:696209/100‑1 (MQ=255) gCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTgg < 1:2680954/100‑1 (MQ=255) gTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAGAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGc > 1:3048922/1‑100 (MQ=255) gTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGc < 2:3673797/100‑1 (MQ=255) gTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCACCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGc > 1:438673/1‑100 (MQ=255) tttACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTACAAAGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCt > 1:2056175/1‑100 (MQ=255) tttACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCt > 2:292657/1‑100 (MQ=255) ttACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCtt > 2:1564716/1‑100 (MQ=255) tACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTc > 2:2421300/1‑100 (MQ=255) tACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTc < 2:3355573/100‑1 (MQ=255) tACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTc > 2:4010735/1‑100 (MQ=255) cccTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCgg < 1:2653033/100‑1 (MQ=255) cccTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCgg > 2:4174399/1‑100 (MQ=255) ccTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGt < 1:4095839/100‑1 (MQ=255) ccTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGt > 1:1168748/1‑100 (MQ=255) cTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCCCTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAACGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCgg > 1:3679181/1‑98 (MQ=255) tAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCg < 2:1161120/100‑1 (MQ=255) gcagtGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAg > 2:461234‑M2/6‑100 (MQ=255) gcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAg > 2:179091‑M2/6‑100 (MQ=255) cagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGc > 1:3937999‑M2/5‑100 (MQ=255) cagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGc < 2:3119333‑M2/96‑1 (MQ=255) gcGGGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCGt < 1:1004737‑M2/98‑1 (MQ=255) | CACTCTTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCGTAT > NC_000913/4624146‑4624344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |