| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 526041 | NA (NA) | 7 (0.050) | 4/170 | NT | 100% | coding (2781/4281 nt) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 526069 | 0 (0.000) | coding (2809/4281 nt) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGATAACCGCATCGCGGAGGATGCGCACTATGTCTACCGCCACGATGAATACGGCAGGCTGACGGAGAAGACGGACCGCATCCCGGCGGGTGTGATACGGA > NC_000913/525970‑526168 | ccAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGG > 2:1398197‑M2/1‑100 (MQ=255) tGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggctgtccagg < 1:1940074‑M2/100‑68 (MQ=255) aCCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtct < 2:3544118‑M2/100‑71 (MQ=255) cccGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctg < 1:3179246‑M2/100‑72 (MQ=255) cccGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctg < 2:3173350‑M2/100‑72 (MQ=255) cccGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggt < 1:1370892‑M2/97‑69 (MQ=255) ccGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctgg < 1:650758‑M2/100‑73 (MQ=255) ccGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctg < 2:139443‑M2/99‑72 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccag < 1:1137961‑M2/100‑97 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccag < 1:2293211‑M2/100‑97 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccag > 1:23314‑M2/1‑4 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccag > 2:1718666‑M2/1‑4 (MQ=255) cGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgcgggtgcgcacactctccagc < 2:4122073‑M2/100‑98 (MQ=255) cGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagc < 1:3149951‑M2/100‑98 (MQ=255) cGGgtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagc < 1:2462131‑M2/100‑98 (MQ=255) cGGgtgcagctccgggtacggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccagggctggtgcgagggtgcgcatactctccagc < 2:1541434‑M2/100‑98 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 2:444408‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 1:3879119‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 1:3493793‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc < 1:1831536‑M2/100‑99 (MQ=255) gggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgcggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 2:2325329‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagccctgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc > 2:3994515‑M2/1‑2 (MQ=255) ggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcct < 1:4031286‑M2/100‑100 (MQ=255) ggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgccgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcct < 2:2375871‑M2/100‑100 (MQ=255) ggtgcagctccgggtccggcagccggttgcccgacgggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacattctccagcct < 1:2806436‑M2/100‑100 (MQ=255) | CCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGATAACCGCATCGCGGAGGATGCGCACTATGTCTACCGCCACGATGAATACGGCAGGCTGACGGAGAAGACGGACCGCATCCCGGCGGGTGTGATACGGA > NC_000913/525970‑526168 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |