| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4063563 | NA (NA) | 16 (0.120) | 7/164 | NT | NA | noncoding (45/75 nt) | REP296 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP296 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 4063593 | NA (NA) | noncoding (75/75 nt) | REP296 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP296 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
AGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGgccggat‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4063466‑4063563‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTC < NC_000913/4063593‑4063489 AGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGC < 2:2050630/100‑1AGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAAACGTAGGC > 1:3867261/1‑100AGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTAGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGC > 2:2977291/1‑100 GCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCC > 2:3192800/1‑100 GCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCC > 2:2421127/1‑100 GCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCC > 2:1911524/1‑100 CGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTTAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCG < 1:1183705/100‑1 CGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCG > 2:4420/1‑100 CGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATAGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCG > 2:399251/1‑100 GTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGATTAATTAATGGCCGGATGTGGTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCC > 2:944903/1‑98 TATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCG > 2:3378349/1‑98 ATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGAT > 1:1669328/1‑100 AGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATC < 2:3961864/100‑1 AGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATC < 1:1469875/100‑1 GATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGTCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCTGATGCGGCGTAAACGCCTTATCC < 2:4066464/100‑1 GATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCn < 2:1407412/100‑2 GATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCC < 2:2689637/100‑1 GATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCC < 1:1472388/100‑1 GATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCC < 2:1508154/100‑1 GATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCC < 1:996294/100‑1 ATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCG < 1:65495/100‑1 TGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCGACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGG < 1:2915737/100‑1 TGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGG < 2:1080919/100‑1 GCTGTCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGC < 2:4062920/100‑1 GCTGGCGGCTTAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCTTACGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGC < 2:2721140/100‑1 GCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGTCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCC < 2:1911249/97‑1 CTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCC < 2:573279/100‑1 AATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCG < 1:1132351/100‑1 GCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGC < 1:215825/100‑1 GCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGC > 2:215824/1‑100 GCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGAGTAAGCACATCCGACCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGC > 2:1427868/1‑100 GCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGC > 2:625424/1‑100 CCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCA < 1:4091056/100‑1 CGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCAT < 1:2191639/100‑1 CGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCAT < 1:3205568/100‑1 GGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATC < 1:2287311/100‑1 GGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATC < 1:3875010/100‑1 GATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCT > 2:3044024/1‑100 ATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTC < 2:3016781/100‑1 ATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTC < 2:1298129/100‑1 ATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTC > 1:1324336/1‑100 TGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCcc > 2:2417834/1‑97 AGCGTATTAGCCAACGTAAGAAAGAGATGCTGGCGGCTGAAGCTTAATTAATGGCCGGATGTGCTTAATCCGGCCAACGAAAACCGTATCAACCGTAGgccggat‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4063466‑4063563‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGATACGGTTTTCGTTGGCCGGATTAAGCACATCCGGCCATTAATTAAGCTTCAGCCGCCAGCATCTC < NC_000913/4063593‑4063489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |