| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 570701 | 84 (0.570) | 16 (0.120) | 9/164 | NT | 17.5% | intergenic (+273/‑192) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; UPF0098 family secreted protein |
| ? | NC_000913 | = 570711 | 74 (0.540) | intergenic (+283/‑182) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; UPF0098 family secreted protein | |||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
CTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTG > NC_000913/570604‑570800 | tGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACt > 2:830117/1‑100 (MQ=255) ggTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACtt > 1:2879533/1‑100 (MQ=255) cGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCg > 1:2529414/1‑100 (MQ=255) gCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGt > 2:2770592/1‑100 (MQ=255) gCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGt > 1:4061680/1‑100 (MQ=255) aGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAg > 1:175725‑M2/1‑99 (MQ=255) tCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAggtgt > 1:373446‑M2/1‑95 (MQ=255) aaaTACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAggtgtta < 1:4081848‑M2/100‑8 (MQ=255) aaTACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTAc < 2:4081821/100‑1 (MQ=255) aTACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCtacgaaagtcggtgttatt < 1:2084671‑M1/100‑20 (MQ=255) aTACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACt > 1:3917486/1‑100 (MQ=255) aTACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACt < 1:587414/100‑1 (MQ=255) tACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCtacgaaagtcggtgttattt < 1:1734345‑M1/100‑21 (MQ=255) tACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACta > 2:2099976/1‑100 (MQ=255) tACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACta > 2:3320848/1‑100 (MQ=255) aCTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCtacgaaagtcggtgttatttt < 1:2163259‑M1/100‑22 (MQ=255) cTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCtacgaaagtcggtgttattttt < 2:1238188‑M1/100‑23 (MQ=255) cTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCtacgaaagtcggtgttattttt < 2:1238161‑M1/100‑23 (MQ=255) cTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaat > 1:2105824/1‑100 (MQ=255) cTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaat > 1:2939603/1‑100 (MQ=255) 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aaaTACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCtacgaaagtcggtgttattttttaac < 1:3948933‑M1/100‑27 (MQ=255) TACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAg > 2:2230321‑M1/1‑100 (MQ=255) TACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAg > 1:907141‑M1/1‑100 (MQ=255) aCGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCtacgaaagtcggtgttattttttaacctac < 2:1186867‑M1/100‑31 (MQ=255) ACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGc > 2:1566188‑M1/1‑100 (MQ=255) ACGTAACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGCTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGc > 2:2380435‑M1/1‑100 (MQ=255) GTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCag > 2:2660211‑M1/1‑100 (MQ=255) GTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCag < 1:1056576‑M1/100‑1 (MQ=255) GTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCag < 1:12720‑M1/100‑1 (MQ=255) GTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCag > 1:3622683‑M1/1‑100 (MQ=255) aaTTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGtttt > 1:1237045/1‑100 (MQ=255) aaTTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGtttt < 1:683387/100‑1 (MQ=255) attattATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGttttt > 1:3968820/1‑100 (MQ=255) ttattaTGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAAAAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTa < 2:1697609/100‑1 (MQ=255) tattatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGTTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAg < 2:2902415/100‑1 (MQ=255) attatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGa < 1:3728818/100‑1 (MQ=255) attatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGa < 1:66688/100‑1 (MQ=255) attatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGa < 1:1498455/100‑1 (MQ=255) tatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATa < 1:2332464/100‑1 (MQ=255) tGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGt < 2:543335/100‑1 (MQ=255) tGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGt < 2:815486/100‑1 (MQ=255) gAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTa > 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2:504743‑M2/98‑71 (MQ=255) aGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttg < 1:2198016/100‑1 (MQ=255) ggTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttgg < 2:1006091/100‑1 (MQ=255) gTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAggtgttattttttaacctaccattcaaaatacgtgacatacaccattttgctcataataatttgtcacgtattt < 1:915042‑M2/100‑75 (MQ=255) gTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttggg > 2:1499601/1‑100 (MQ=255) gTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttggg < 1:1852385/100‑1 (MQ=255) atctaaaaaTAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttggg < 1:1143552/96‑1 (MQ=255) ttAAAAAATAACACCgactttcgtaggtgttattttttaacctaccattcaaaatacgtgacatacatcattttgctcataataatttgtcacgtat > 2:2987580‑M1/1‑15 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |