| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 570701 | 84 (0.570) | 16 (0.120) | 9/164 | NT | 17.5% | intergenic (+273/‑192) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; UPF0098 family secreted protein |
| ? | NC_000913 | = 570711 | 74 (0.540) | intergenic (+283/‑182) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; UPF0098 family secreted protein | |||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
AGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTT > NC_000913/570613‑570810 | aGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAg > 1:175725‑M2/1‑99 (MQ=255) ttCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAggtg > 1:897774‑M2/1‑96 (MQ=255) cAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAggtgtt < 2:2058244‑M2/100‑7 (MQ=255) cAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAggtgtt < 2:2363415‑M2/100‑7 (MQ=255) aaaTACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAggtgtta < 1:2092007‑M2/100‑8 (MQ=255) aaTACTGAAAATACGTGACAAGTTATTATGACCAAAATGGTGGATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGCCTTTCGTAggtgtta > 2:2517986‑M2/1‑92 (MQ=255) aTACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACt > 1:3917486/1‑100 (MQ=255) aTACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACt < 1:587414/100‑1 (MQ=255) aTACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAAGGGTGGATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACt < 1:4042467/100‑1 (MQ=255) tACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACta > 2:2099976/1‑100 (MQ=255) tACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACta < 2:2858707/100‑1 (MQ=255) tACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACta > 2:3320848/1‑100 (MQ=255) cTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCTACGAAAGTCggtgttattttt > 2:1191553‑M2/1‑88 (MQ=255) tGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaata < 1:1872102/100‑1 (MQ=255) tGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaata > 1:1289233/1‑100 (MQ=255) gAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaataa < 1:3061169/100‑1 (MQ=255) aaatacgtgacatacaccattttgctcataataatttgtcacgtattttGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaataata > 1:1411791‑M2/50‑100 (MQ=255) AATACGTGATAAAATAAAAAGAACAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaataata > 2:2005771‑M1/1‑99 (MQ=255) AATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaataataa > 2:1296345‑M1/1‑100 (MQ=255) aTACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGATGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCTACGAAAGTCggtgttattttttaa > 2:2987580‑M2/1‑82 (MQ=255) TACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAg > 2:2230321‑M1/1‑100 (MQ=255) TACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAg > 1:2226083‑M1/1‑100 (MQ=255) ACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGc > 2:1566188‑M1/1‑100 (MQ=255) ACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGc > 2:1090307‑M1/1‑100 (MQ=255) ACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGc > 2:678191‑M1/1‑100 (MQ=255) ACGTAACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGCTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGc > 2:2380435‑M1/1‑100 (MQ=255) GTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCag > 1:3622683‑M1/1‑100 (MQ=255) GTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCag < 1:1056576‑M1/100‑1 (MQ=255) GTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCag > 2:2660211‑M1/1‑100 (MQ=255) aCAAATTATCATGAGCAAAATGGTGTACATCACGTATTTTTTATGGTTGGTTAAAGAATAACACCGAATTTCGAAGGTGTTACTAATAATaaa > 2:2809310/1‑93 (MQ=255) AAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGttt > 1:3138633‑M1/1‑100 (MQ=255) aaTTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGtttt > 1:1237045/1‑100 (MQ=255) aaTTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGtttt < 1:683387/100‑1 (MQ=255) attattATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGttttt > 1:3968820/1‑100 (MQ=255) ttattaTGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAAAAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTa < 2:1697609/100‑1 (MQ=255) tattatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGTTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAg < 2:2902415/100‑1 (MQ=255) tattatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAg < 2:1527726/100‑1 (MQ=255) attatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGa < 1:3728818/100‑1 (MQ=255) attatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGa < 1:1498455/100‑1 (MQ=255) attatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGa < 1:66688/100‑1 (MQ=255) tatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATa < 1:2332464/100‑1 (MQ=255) atGATCAAAATAGTGTATGTCACGTATTTTGAATTGTAGGTTAAAAAATAACACCGATTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAg < 2:1224231/100‑1 (MQ=255) 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2:1476621/100‑1 (MQ=255) | AGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTT > NC_000913/570613‑570810 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |