| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3621232 | NA (NA) | 26 (0.190) | 8/168 | NT | 100% | coding (2041/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3621274 | 0 (0.000) | coding (2083/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
GCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAG > NC_000913/3621209‑3621373 | gCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCAGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTAAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaa < 1:343610‑M2/100‑35 (MQ=255) ccacGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatc < 2:361862‑M2/100‑51 (MQ=255) ccgatcttgaccggcAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatca > 2:2476357‑M2/8‑49 (MQ=255) cGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagc < 1:74802‑M2/100‑54 (MQ=255) cGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagc < 2:638210‑M2/100‑54 (MQ=255) cGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagc < 1:3085465‑M2/100‑54 (MQ=255) cGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagc < 1:2126210‑M2/100‑54 (MQ=255) gACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGCGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagcc < 2:3924176‑M2/100‑55 (MQ=255) gACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtctcagcc < 2:3130074‑M2/100‑55 (MQ=255) gACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagcc < 2:3950392‑M2/100‑55 (MQ=255) gACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagcc < 2:1613457‑M2/100‑55 (MQ=255) aCCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccg < 2:1759831‑M2/100‑56 (MQ=255) aCCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccg < 1:86285‑M2/100‑56 (MQ=255) aCCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccg < 2:3416441‑M2/100‑56 (MQ=255) aCCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccg < 1:299126‑M2/100‑56 (MQ=255) aCCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGAGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccg < 2:3662060‑M2/100‑56 (MQ=255) ccTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccgg < 2:849703‑M2/100‑57 (MQ=255) ccTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccgg < 1:616081‑M2/100‑57 (MQ=255) ccTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgcagtgtgcggccgtcaaagccgggttcctgtatcagcc < 2:1427819‑M2/98‑55 (MQ=255) ccTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccgg < 1:3456436‑M2/100‑57 (MQ=255) ccTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGGCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagcc < 2:1509266‑M2/98‑55 (MQ=255) cTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtaccagccggt < 2:3973751‑M2/100‑58 (MQ=255) tGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcaagatcgg < 1:2476371‑M2/100‑59 (MQ=255) ngaCCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtc < 2:3788191‑M2/99‑59 (MQ=255) ccGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcgag > 2:3456415‑M2/1‑39 (MQ=255) cGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATAAGTTTGCCGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaag < 1:425372‑M2/100‑62 (MQ=255) aaaCTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGC > 2:81204‑M2/1‑100 (MQ=255) aaaCTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGC > 2:1673923‑M2/1‑100 (MQ=255) aaaCTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGC > 2:1025096‑M2/1‑100 (MQ=255) aaaCTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGC > 1:383405‑M2/1‑100 (MQ=255) aCTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGG < 1:2643347‑M2/100‑1 (MQ=255) aCTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGG > 2:328540‑M2/1‑100 (MQ=255) cTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGT < 1:1298699‑M2/100‑1 (MQ=255) cTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGT < 1:1067659‑M2/100‑1 (MQ=255) cTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGT < 1:4028942‑M2/100‑1 (MQ=255) cTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGT < 1:2652360‑M2/100‑1 (MQ=255) cTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGG > 1:1495097‑M2/1‑99 (MQ=255) ttATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTG > 2:3355641‑M2/1‑100 (MQ=255) ttATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTG > 1:1141139‑M2/1‑100 (MQ=255) ttATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTG < 1:2918886‑M2/100‑1 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt > 2:219510‑M2/1‑5 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt > 1:1400756‑M2/1‑5 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt > 2:3683506‑M2/1‑5 (MQ=255) gTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgtttt < 1:877232‑M2/100‑97 (MQ=255) gTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgtt > 2:3056101‑M2/1‑4 (MQ=255) gTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagcaggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgtttt > 2:3360498‑M2/1‑4 (MQ=255) gTCAggtcgtggtgataacgctgggtgcggtcgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgtttt > 2:1971117‑M2/1‑4 (MQ=255) tCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggctgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc > 1:683612‑M2/1‑3 (MQ=255) tCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc > 1:1185104‑M2/1‑3 (MQ=255) tCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc > 1:1613250‑M2/1‑3 (MQ=255) tCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc < 1:3046963‑M2/100‑98 (MQ=255) cACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGcggtgcgtgaggcggtctgcttcgtcat < 1:1471806‑M2/100‑29 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 1:625345‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 2:802859‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 1:1264862‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 2:4014218‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac < 1:301060‑M2/100‑100 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 2:3259383‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 2:1596527‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac < 1:1607277‑M2/100‑100 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 1:3111859‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacagaaggtggtgtggctgccgttttcac > 1:2507496‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgggtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 2:801822‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtaataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 2:3752465‑M2/1‑1 (MQ=255) | GCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAG > NC_000913/3621209‑3621373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |