| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3621939 | NA (NA) | 10 (0.070) | 6/170 | NT | 100% | coding (2748/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3621967 | 0 (0.000) | coding (2776/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
GCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCA > NC_000913/3621868‑3622066 | gCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACAGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGG < 1:3943016‑M2/100‑1 (MQ=255) gCTGCACCCGGACAGCGCCCTCAGCATGTGGCCGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggtatccgggatgcggatatcc < 1:4070504‑M2/99‑65 (MQ=255) cTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccag < 1:3525871‑M2/100‑67 (MQ=255) tGCACCCGGACAGCACCCTAAGCATGTGGCCGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccaga < 1:996350‑M2/100‑68 (MQ=255) gCACCCGGACAGCACCCTCGGCATGTGGCCGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccggat < 1:143081‑M2/100‑69 (MQ=255) cACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggctatccagatt < 1:3840826‑M2/100‑70 (MQ=255) cACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagatt < 1:3972807‑M2/100‑70 (MQ=255) aCGCGGACAGCGCCCTCAGCATGTGGCCGGgtgcagcgccgagtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggtatacgggatgcggatatccagattc < 2:2250931‑M2/100‑71 (MQ=255) aCCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattc < 1:187448‑M2/100‑71 (MQ=255) cccGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcg < 2:3045576‑M2/100‑72 (MQ=255) cccGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcg < 2:3621841‑M2/100‑72 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtggacgccggtcag < 1:389806‑M2/100‑97 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag > 2:2576504‑M2/1‑4 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 2:1955891‑M2/100‑97 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 2:1955872‑M2/100‑97 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 1:3797291‑M2/100‑97 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag < 2:3073699‑M2/100‑97 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag > 1:409344‑M2/1‑4 (MQ=255) ccGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttaccctccgggtctgtggcatacggtatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcag > 2:497695‑M2/1‑4 (MQ=255) cGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc < 1:3644355‑M2/100‑98 (MQ=255) cGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagc > 1:2348022‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGgtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacaccggcaggc > 1:2992774‑M2/1‑3 (MQ=255) gggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:3949795‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 2:2240726‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:3379651‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:1795336‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:1612944‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcc > 1:1536450‑M2/1‑2 (MQ=255) ggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcct < 1:3489420‑M2/100‑100 (MQ=255) ggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcct < 2:2385569‑M2/100‑100 (MQ=255) ggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcct < 2:2632190‑M2/100‑100 (MQ=255) ggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcct < 2:2680632‑M2/100‑100 (MQ=255) | GCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCA > NC_000913/3621868‑3622066 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |