New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3619655 = | NA (NA) | 7 (0.050) | 6/168 | NT | 100% | coding (464/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | 3619677 = | 0 (0.000) | coding (486/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
AACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAgccgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3619753‑3619655 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATG > NC_000913/3619677‑3619780 AACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAG > 2:2610823/1‑100 AACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAG > 1:3102237/1‑100 AACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAG > 1:36340/1‑100 AACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAG > 2:476116/1‑100 AACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAG < 2:1570133/100‑1 AACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGAGCCTGCCAGAGTGAGGCCAG < 1:562042/100‑1 ACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGC < 1:396148/100‑1 ACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGC > 1:1574867/1‑100 ACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGC > 2:3398732/1‑100 CCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCC < 1:1531832/100‑1 CCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCC > 1:3733782/1‑100 CCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCC > 2:3532265/1‑100 CCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCC < 2:1916554/100‑1 CCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCC < 2:3215537/100‑1 CCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCC > 2:2792791/1‑100 CCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCC < 1:2377807/100‑1 CGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCG < 2:3641675/100‑1 CGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCC < 1:1203069/99‑1 CGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGCGCGGCCAGCCG > 1:1137630/1‑100 nAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGG > 2:3779038/2‑100 GAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGG < 2:491897/100‑1 GAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGG > 2:1825039/1‑100 GAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGG > 2:1777966/1‑100 AGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGG > 1:3177184/1‑99 TCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCT > 2:3108323/1‑100 CTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTG > 1:1573950/1‑100 TTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCT > 1:1856810/1‑98 TCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCT > 2:2195322/1‑100 TCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGC > 1:1180137/1‑99 CCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTC > 2:3431884/1‑100 GGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGG > 2:1718421/1‑100 gccGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 2:2875065/97‑1 GCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 2:2266426/100‑1 GCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 2:574008/1‑100 GCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 2:1633382/100‑1 GCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:200810/100‑1 GCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:1736011/100‑1 GCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTGGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:1938945/100‑1 CCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCTGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:2069010/100‑1 CCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG > 2:1793770/1‑100 CCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:1288693/100‑1 CCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG > 2:321914/1‑100 CCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:567153/99‑1 CGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGA < 2:2547663/100‑1 CGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGA > 1:383296/1‑100 CGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGA > 2:2970179/1‑100 CGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGA > 1:1849897/1‑100 CGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGA > 2:1301515/1‑100 CGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGA < 2:3533569/100‑1 CGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGAGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGA > 1:817783/1‑100 GGAAGATCTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGAT < 2:344273/100‑1 GGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGAT > 1:1672458/1‑100 GGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGA > 1:1039621/1‑99 GGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGGGCCGGAAGCAGAT > 1:2263695/1‑100 GGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTCAGCGGGTGCCGGAAGCGGAT < 1:2318593/100‑1 GAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGCATCGGATG > 1:3264947/1‑100 GAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATG < 2:3507312/100‑1 GAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATG < 1:3463700/100‑1 GAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATG < 2:2770106/100‑1 AACCGAGCAGCCACCACGGCCCCTGCGGACTGTTTGTCGCCAGATAACGATGCGGACTTAAGCGGAGTTCTTCCGGCAGCGCCTGCCAGAGTGCGGCCAgccgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3619753‑3619655 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATG > NC_000913/3619677‑3619780 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |