| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2304653 | 27 (0.190) | 21 (0.160) | 11/164 | NT | 16.3% | noncoding (237/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 2304782 | 191 (1.490) | noncoding (366/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAC > NC_000913/2304554‑2304752 | cgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGAT < 1:3424397‑M1/100‑1 (MQ=255)cgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGAT < 1:2799657‑M1/100‑1 (MQ=255) gcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTCGGTCGGAT > 2:1138024‑M1/1‑99 (MQ=255) gcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGAT < 1:2469287‑M1/99‑1 (MQ=255) aTCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAg < 2:1797018/100‑1 (MQ=14) tCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGAT > 1:765912‑M1/1‑96 (MQ=255) ccGACATCCAAGGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGc < 1:2735602/100‑1 (MQ=12) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTCC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAgg > 1:1484153/1‑99 (MQ=18) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 2:2235218/1‑100 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 2:1286544/1‑100 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 1:690579/100‑1 (MQ=32) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGATGGCGCGGCTTATCAGGCCTAC‑CCCCCTGTGACGTGCTCAACCCCGTAGGTCGGATcatg > 1:540270‑M1/1‑95 (MQ=255) cGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg > 2:3346712/1‑100 (MQ=33) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCgg < 1:1764672/100‑1 (MQ=14) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg > 1:1385699/1‑100 (MQ=33) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:2483938/100‑1 (MQ=32) aCATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGt < 1:377388/100‑1 (MQ=14) aCATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgta < 2:2942231‑M1/100‑9 (MQ=255) aCATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGt < 1:3351833/100‑1 (MQ=32) cATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTGCACCCCGTAGGTCGGACgcggcg > 1:3677284‑M1/1‑91 (MQ=255) cATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 1:646932/100‑1 (MQ=33) aTCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGTATAAGGCGGTTa < 2:2493229/100‑1 (MQ=18) aTCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTa < 1:966727/100‑1 (MQ=32) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 1:730982/1‑98 (MQ=33) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc < 2:2911958/100‑1 (MQ=33) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 2:3094696/1‑100 (MQ=33) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCA‑GCATACGCCCCCTCTGGCGTGCCCCGCCCGGTAGGTCGGAtca > 1:1648156/1‑89 (MQ=2) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGAGGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTa < 1:2793115/99‑1 (MQ=17) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtttacg > 1:692568‑M1/1‑88 (MQ=255) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATACGGCGGTTCcg > 1:894631/1‑100 (MQ=16) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTAGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGttcgg > 1:2282048/1‑97 (MQ=16) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGGTTCGGCGGTTActc > 1:2547966/1‑98 (MQ=11) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGACCGGTAAGGCgga > 2:2812507/1‑94 (MQ=255) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCCGCACCCCCTAGGTCGGATGAGGCGGTTAcg > 1:3712268/1‑99 (MQ=11) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGAGGCGGCGCTGGCGCGGCGTATCGGGCGTCC‑GCCGTTGTGAAGAGCTCCACCCGGTAGGTGTGACAAggagaaaa > 1:2187402/1‑91 (MQ=2) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc > 1:1001146/1‑100 (MQ=32) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 2:293471/100‑1 (MQ=32) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc < 1:3394644/100‑1 (MQ=32) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 1:3303860‑M1/100‑21 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 2:2333992‑M1/100‑21 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 1:1959962‑M1/100‑21 (MQ=255) gAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccg < 1:2860375‑M1/100‑22 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaac < 2:894636‑M1/100‑24 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaa < 1:1013286‑M1/99‑23 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCCGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgan < 1:1854930‑M1/100‑24 (MQ=255) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacc < 2:1005518‑M1/100‑25 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaacct < 2:2001792‑M1/100‑26 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaacct < 2:1579532‑M1/100‑26 (MQ=255) tGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaacctacgg < 1:432517‑M1/100‑30 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaacctacggg < 2:2484896‑M1/100‑31 (MQ=255) gCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagc < 2:3677312‑M1/100‑38 (MQ=255) aTCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTGGGTTGGATgcggcgtaaccgccttttccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtagg < 1:37536‑M1/100‑56 (MQ=255) aTCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtagg < 1:37511‑M1/100‑56 (MQ=255) gCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACCTCTAACGCCCCAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTA < 1:3467824‑M2/100‑1 (MQ=255) gCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTA < 1:825046‑M2/100‑1 (MQ=255) gCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTA > 2:2542948‑M2/1‑100 (MQ=255) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT > 2:2321685‑M2/1‑100 (MQ=255) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT > 2:2222889‑M2/1‑100 (MQ=255) tgtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATC > 1:2996302‑M2/1‑100 (MQ=255) tgtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATC > 2:1522577‑M2/1‑100 (MQ=255) tgtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGAGAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGTCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATC > 1:3420690‑M2/1‑100 (MQ=255) gtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTCTCA < 1:2465963‑M2/100‑1 (MQ=255) gtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCA < 1:59031‑M2/100‑1 (MQ=255) gtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCA < 1:1277830‑M2/100‑1 (MQ=255) tgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAG > 1:2772271‑M2/1‑100 (MQ=255) gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGG < 2:2996321‑M2/100‑1 (MQ=255) gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGG < 2:603976‑M2/100‑1 (MQ=255) gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGG > 2:3111172‑M2/1‑100 (MQ=255) gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGG < 2:526320‑M2/100‑1 (MQ=255) gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGG > 2:2382580‑M2/1‑100 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGC < 1:1871147‑M2/100‑1 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGC > 2:3720021‑M2/1‑100 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGC > 2:3160348‑M2/1‑100 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGC < 1:3271404‑M2/100‑1 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGC > 2:3720068‑M2/1‑100 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGC > 2:228519‑M2/1‑100 (MQ=255) aGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGcc < 1:3172878‑M2/99‑3 (MQ=255) aGTGCTACACCCCGGAGGTCGGATAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGC > 1:1784844‑M2/1‑99 (MQ=255) 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1:1174670‑M1/100‑94 (MQ=255) gTCGGATgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggc > 2:2337811‑M1/1‑7 (MQ=255) gTCGGATgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggcggagcgctgcacagcggtgtacgcctgataagacccgccagcgtcgcatcaggcaa > 1:3606245‑M1/1‑7 (MQ=255) cGGATgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctt > 2:325416‑M1/1‑5 (MQ=255) ggATgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcg > 1:120745‑M1/1‑4 (MQ=255) gATgcggcgtgaccgccttatccaacctacggggtggagcacgtcgcagcggtggaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgg < 1:3334950‑M1/100‑98 (MQ=255) gATgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgg > 2:3660856‑M1/1‑3 (MQ=255) gATgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttg > 1:1496950‑M1/1‑3 (MQ=255) gATgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcctgg > 2:3324947‑M1/1‑3 (MQ=255) aTgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttggn < 2:1786407‑M1/100‑99 (MQ=255) aTgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttggg > 2:635972‑M1/1‑2 (MQ=255) tgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggc < 2:2540618‑M1/100‑100 (MQ=255) tgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggc > 2:1189534‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggc < 2:887298‑M1/100‑100 (MQ=255) tgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggc > 2:709362‑M1/1‑1 (MQ=255) | CGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑ACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAC > NC_000913/2304554‑2304752 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |