| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2539608 = | NA (NA) | 13 (0.100) | 7/166 | NT | NA | noncoding (2/36 nt) | REP175 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP175 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 2539638 = | NA (NA) | noncoding (32/36 nt) | REP175 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP175 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
ACTGCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCA > NC_000913/2539509‑2539707 | ctctcgcacaaagcgcctgataggttgagtgaatgttaaacgcccggaggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagac < 2:1947733‑M1/1‑1 (MQ=255) cTGCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGcc < 1:2339106/100‑1 (MQ=255) tGCCGTTATCCGGTCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCt > 2:2554450/1‑100 (MQ=255) tGCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTAACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGcc < 1:669792/99‑1 (MQ=255) ctcgcacaaagcgcctgataggttgagtgaatgttaaacgcccggaggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggttggtaacctgtagaCCt < 2:3743963‑M1/3‑1 (MQ=255) ctcgcacaaagcccctcataggttgagtgaatgtttaacgcccggaggcgcctcccgcgatccgtgctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagaCCt > 1:1708054‑M1/98‑100 (MQ=255) tcgcacaaagcgcctgataggttgagtgaatgttaaacgcccggaggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagaCCTg < 2:2999613‑M1/4‑1 (MQ=255) tcgcacaaagcgcctgataggttgagtgaatgttaaacgcccggaggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagaCCTg > 1:503363‑M1/97‑100 (MQ=255) gCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGcc < 1:27342/98‑1 (MQ=255) gCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGcc < 2:660917/98‑1 (MQ=255) gcacaaagcgcctgataggttgagtgaatgttaaacgcccggaggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagaCCTGAt > 1:1201338‑M1/95‑100 (MQ=255) gTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATg < 2:1830910/100‑1 (MQ=255) cacaaagcgcctgataggttgagtgaatgttaaacgcccggaggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagacctcata < 1:407647‑M1/7‑5 (MQ=255) ttATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGc < 1:3057597/100‑1 (MQ=255) ttATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTCGCtgctgc > 2:3299624/1‑100 (MQ=255) tCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGAc < 2:3536563/100‑1 (MQ=255) ccGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGAca > 2:3760996/1‑99 (MQ=255) cGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACg > 2:2266014/1‑99 (MQ=255) cGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGc < 1:3037064/100‑1 (MQ=255) gCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCtt > 2:2991968/1‑100 (MQ=255) ccccATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTg > 1:3526941/1‑100 (MQ=255) ccccATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTg > 1:1335083/1‑100 (MQ=255) aTTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGcgcg < 2:2050927/100‑1 (MQ=255) aTTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGcgcg < 2:856461/100‑1 (MQ=255) tCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTc < 1:2576272/100‑1 (MQ=255) cGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCt < 1:3730639/100‑1 (MQ=255) cGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCt < 2:3134191/100‑1 (MQ=255) gCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCtt < 2:3428952/100‑1 (MQ=255) tGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTAt > 1:3769434/1‑100 (MQ=255) agtgaatgttaaacgccctgaggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagaCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCa > 2:2056719‑M1/73‑100 (MQ=255) agtgaatgttaaacgcccggaggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagaCCTGATAAGACGCTTGCGCGTCTTATCa > 2:272617‑M1/73‑100 (MQ=255) aaCTTCACGAGAGGCTCATTGCCTATTTGTTGTGCGAATGTACTGACGATCTCTATCGATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTACGCGTCTTATCAg < 1:57284/100‑1 (MQ=25) aCTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAgg < 2:3394186/100‑1 (MQ=255) aCTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAgg > 1:524258/1‑100 (MQ=255) aCTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAgg < 2:3480297/100‑1 (MQ=255) aCTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACAATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAgg > 1:2104136/1‑100 (MQ=255) cTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGt > 1:2706771/1‑100 (MQ=255) ttCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTc > 2:341119/1‑100 (MQ=255) aatgttaaacgcccggaggcgcttccctcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagaCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTc > 1:2470010‑M1/69‑100 (MQ=255) atgttaaacgcccggaggcgcttcccgcgatccgggctttttaatggcaaggtttgtaacctgtagaCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCt > 1:2434347‑M1/68‑100 (MQ=255) ccAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACa < 2:1971397/100‑1 (MQ=255) ccAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACa < 1:2325188/100‑1 (MQ=255) acAGAGGCGCATTGCGTATTGTTTGTTCTAATGTACACATGTTATCTATCCATACGTGGCATTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTCATCAGGTCGACa > 1:939666/2‑100 (MQ=25) agagGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAgg > 1:2756055/1‑100 (MQ=255) agGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGtt < 1:3308310/100‑1 (MQ=255) agGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGtt < 1:1489404/100‑1 (MQ=255) gCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTa < 2:3169357/99‑1 (MQ=255) gCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTAc < 1:2997468/100‑1 (MQ=255) gTATTGTCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACa < 1:682599/99‑1 (MQ=255) gTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGCTGCGCCGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACaa > 2:3501367/1‑100 (MQ=255) gTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACaa > 2:2397376/1‑100 (MQ=255) gCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCtt > 2:258735/1‑100 (MQ=255) gCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCtt > 2:3798560/1‑100 (MQ=255) ccTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACACGTTACAAACCtt > 1:3266826/1‑99 (MQ=255) cTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGc < 1:3563056/100‑1 (MQ=255) cTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGc > 2:2822087/1‑100 (MQ=255) ttgtttgtTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCAt < 2:1116485/100‑1 (MQ=255) gttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTaaaaa > 1:2855999/1‑100 (MQ=255) gttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTaaa < 1:3783077/98‑1 (MQ=255) gttCTAATGTACCCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGGCTGATGCGACGCTTGCGCGGCATATCGGGTCTACAGGATACAAACCGTGCCATTaaaaa > 1:1441454/1‑100 (MQ=255) ttCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAG > 2:504999‑M1/1‑100 (MQ=255) cTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCC > 2:442494‑M1/1‑100 (MQ=255) aaTGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCG > 1:2907981‑M1/1‑100 (MQ=255) aTGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGG < 1:647400‑M1/100‑1 (MQ=255) cTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATcgc > 1:3160955/1‑100 (MQ=255) cACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCgg > 2:1901435/1‑100 (MQ=255) cACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCgg > 2:1707209/1‑100 (MQ=255) aCGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCggg < 2:1003394/100‑1 (MQ=255) cGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCggg < 2:364235/99‑1 (MQ=255) aTCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAg < 1:1389081/100‑1 (MQ=255) tctATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAgcgc > 1:1103620/1‑100 (MQ=255) tATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCt < 2:2838745‑M2/100‑2 (MQ=255) aTCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCtc < 1:820626‑M2/100‑3 (MQ=255) ccATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCtccg < 1:1230558‑M2/100‑5 (MQ=255) ccATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCtcc > 1:3689481‑M2/1‑96 (MQ=255) cATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCtccgg < 2:1219296‑M2/100‑6 (MQ=255) cATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCACCtccgg < 2:1320364‑M2/100‑6 (MQ=255) tACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCtccgggc > 1:1784826‑M2/1‑93 (MQ=255) tACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCAACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAggcgcttcccgcgatccggg < 2:1750194‑M1/99‑21 (MQ=255) aCGTGGTGTTGCCTGATGCTACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCg < 1:1758132/100‑1 (MQ=255) aCGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCg > 1:103185/1‑100 (MQ=255) aCGTGGTGTTGCCGTATGCGACGCCTGCGCGACTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAggcgcttcccgcgatccgggct < 1:1692700‑M1/100‑23 (MQ=255) cGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAggcgcttcccgcgatccgggcn < 1:2243486‑M1/99‑23 (MQ=255) cGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGt > 2:1773006/1‑100 (MQ=255) gtggtgTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGtt < 2:3712203/100‑1 (MQ=255) gtggtgTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGtt < 2:2104144/100‑1 (MQ=255) gtggtgTTGCCTGATGCAACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGtt < 2:2207063/100‑1 (MQ=255) tggtgTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAggcgcttcccgcgatccgggctttt < 1:341117‑M1/100‑26 (MQ=255) tggtgTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGttt < 2:602553/100‑1 (MQ=255) ggtgTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTa > 2:2346774/1‑100 (MQ=255) ggtgTTGCCGGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAggcgcttcccgcgatccgggctttt < 1:1878270‑M1/99‑26 (MQ=255) gtgtTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAggcgcttcccgcgatccgggcttttta < 2:1592725‑M1/100‑28 (MQ=255) gtgtTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTaa < 2:2404963/100‑1 (MQ=255) gtgtTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTaa < 2:3362665/100‑1 (MQ=255) tgtTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACATTGCCATTAAAACGCCCGAATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAAc > 1:1454640/1‑100 (MQ=255) gtTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACa > 2:2532487/1‑100 (MQ=255) ttGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGAggcgcttcccgcgatccgggctttttaatg < 1:2861813‑M1/100‑31 (MQ=255) tGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACAtt > 1:1063721/1‑100 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTc < 1:125390/100‑1 (MQ=255) CCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCa < 2:2293349‑M1/100‑1 (MQ=255) | ACTGCCGTTATCCGGCCCCATTCGCTGCAACTTCACCAGAGGCGTATTGCCTATTGTTTGTTCTAATGTACTCACGATCTCTATCCATACGTGGTGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGTCTACAGGTTACAAACCTTGCCATTAAAAAGCCCGGATCGCGGGAAGCGCCTCCGGGCGTTTAACATTCA > NC_000913/2539509‑2539707 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |