| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2232735 | NA (NA) | 9 (0.070) | 7/166 | NT | NA | intergenic (+7/‑143) | cdd/sanA | cytidine/deoxycytidine deaminase/DUF218 superfamily vancomycin high temperature exclusion protein |
| ? | NC_000913 | = 2232765 | NA (NA) | noncoding (30/34 nt) | REP155 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP155 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
GCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGA > NC_000913/2232666‑2232864 | gCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGC > 1:215372‑M2/1‑100 (MQ=255) ccACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCt < 1:1111923/100‑1 (MQ=255) aCCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTg < 2:2108342/100‑1 (MQ=255) aCCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTg < 2:2206390/100‑1 (MQ=255) tCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCa < 1:2479113/100‑1 (MQ=255) cGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGc < 2:2778080/100‑1 (MQ=255) gCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGcc < 2:2799258/100‑1 (MQ=255) cAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGccc > 1:1940224/1‑100 (MQ=255) cAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGccc < 2:2610456/100‑1 (MQ=255) cAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGccc < 1:1712869/100‑1 (MQ=255) cTGAAAGCTCTCGGCTGTCAGAGTGTCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTcc < 1:207731/100‑1 (MQ=255) cTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTcc > 2:2997610/1‑100 (MQ=255) gAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTg > 1:1090151/1‑100 (MQ=255) gAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCGTTTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTg < 2:3749469/100‑1 (MQ=255) ctctCGGGTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTc > 2:1991819/1‑100 (MQ=255) ctctCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTc < 1:2032064/100‑1 (MQ=255) ctctCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTc < 2:2015855/100‑1 (MQ=255) ctcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTc > 1:1667530/1‑98 (MQ=255) ctcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGa > 2:2469470/1‑100 (MQ=255) ctcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGa < 1:1339825/100‑1 (MQ=255) tcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGaa < 2:1977487/100‑1 (MQ=255) cGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGaaa < 2:1237094/100‑1 (MQ=255) ggCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCTGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAAt > 2:1011734/1‑100 (MQ=255) ggCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAAt < 1:3671201/100‑1 (MQ=255) ggCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAAt < 1:956823/100‑1 (MQ=255) tGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTcc < 2:2217057/100‑1 (MQ=255) gTCACAGTATCGACCGAGTGCTTATGGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTTTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAACTTccc > 1:715192/1‑100 (MQ=38) tCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCg > 2:1345537/1‑100 (MQ=255) cacaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCgg < 2:3611355/100‑1 (MQ=255) cacaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCgg > 1:2184278/1‑100 (MQ=255) cacaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCgg > 2:3271441/1‑100 (MQ=255) cacaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCgg < 2:2700181/100‑1 (MQ=255) acaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGc < 2:3406112/100‑1 (MQ=255) acaGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGCGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGc < 1:2396124/100‑1 (MQ=255) caGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCa < 2:1087048/100‑1 (MQ=255) caGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCa > 1:1332761/1‑100 (MQ=255) aTCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCaa < 1:614391/97‑1 (MQ=255) aTCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACa < 1:2894878/100‑1 (MQ=255) cGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGt > 2:3490410/1‑100 (MQ=255) cGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGt > 2:2414779/1‑100 (MQ=255) gACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGtt > 2:454991/1‑100 (MQ=255) gACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGtt > 2:393772/1‑100 (MQ=255) gACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGtt > 2:409037/1‑100 (MQ=255) ccGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTg < 1:3127453/100‑1 (MQ=255) ccGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTg < 1:3494282/100‑1 (MQ=255) cGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCGCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGc > 1:1510947/1‑100 (MQ=255) cGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGCATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGc < 1:638128/100‑1 (MQ=255) gAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGcc > 2:3801056/1‑100 (MQ=255) aGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCg > 1:20492/1‑100 (MQ=255) tgctgcTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACTGTTTGCCggg < 2:266040/100‑3 (MQ=255) gCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGGCGGGTGCGGCGTGAACGCCTTTTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCTACCACTTTTCCg > 1:1209459/1‑97 (MQ=255) cttcttGTTTAAGCCTGGTGACGGATTCGGCGTTAACGTCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCGCCTGGTGTCGAAATTCCCTGCAAACAGTTTGcc < 1:1660993/95‑1 (MQ=255) ttCTCGCTGAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGACCGCCTGTTCCGGCTTGCCAGCCCGCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACTGTTTGCCgggaat < 1:2544791/100‑6 (MQ=255) ctcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTg < 1:2784657/100‑1 (MQ=255) ctcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTGGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTg < 1:419955/100‑1 (MQ=255) tcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTgc < 1:2452772/100‑1 (MQ=255) tcGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTgc < 2:2969139/100‑1 (MQ=255) cgattAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCACTCTCCTGGTGTCGAAATTCACGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTacg > 1:3785686/4‑100 (MQ=38) gCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTgcgc > 2:716766/1‑100 (MQ=255) cTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgt < 2:174368‑M2/100‑59 (MQ=255) cTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCa < 2:1890510/100‑1 (MQ=255) tAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCaaa > 2:375353/1‑100 (MQ=255) aGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcg < 2:1559330‑M2/100‑63 (MQ=255) cTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcggag < 1:1894190‑M2/100‑66 (MQ=255) tGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactaggacgatacagtgacagccgagagctttcagcgttgcggag < 1:2665255‑M2/99‑66 (MQ=255) ggTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAACACCAGCg > 2:313297/1‑100 (MQ=255) ggTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCg < 2:1655825/100‑1 (MQ=255) gTGCCGGATGGGGCGTGAAAGCCTTGTCCGGCaccaggcttaagcgagaagcactaggtcgatactgtgacagccgagagctttccgcgttgcggtgggg < 1:1553353‑M2/100‑69 (MQ=255) tGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAACAAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCggg > 2:938066/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCTGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGATTGCCGTCTCTTGCGCAAAACAAGCgg > 1:3246495/1‑98 (MQ=39) gCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCgg < 1:852006/98‑1 (MQ=255) cGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTaa > 2:238124/1‑100 (MQ=255) ggATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTaaa < 1:1795265/100‑1 (MQ=255) aTGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGt < 2:3159292/100‑1 (MQ=255) gcggcgTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAg < 1:3346776/100‑1 (MQ=255) gTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGa < 1:306800/100‑1 (MQ=255) aaCGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATgg > 2:1294949/1‑100 (MQ=255) aaCGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATgg > 1:3711395/1‑100 (MQ=255) aaCGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATgg < 2:3232228/100‑1 (MQ=255) cGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGaa > 2:2087073/1‑100 (MQ=255) cTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAAtt > 2:2166943/1‑100 (MQ=255) 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tCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCATTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTcc < 1:2981412/100‑1 (MQ=255) ccGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcggaggtggcatcccactgaatcaacggcgcatcg < 2:738361‑M2/100‑96 (MQ=255) ccGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCt > 1:3443977/1‑100 (MQ=255) cGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcggaggtggcatcccactgaatcaacggcgcatcgg > 1:2742651‑M2/1‑4 (MQ=255) cGGCaccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcggaggtggcatcccactgaatcaacggcgcatcgg > 2:153422‑M2/1‑4 (MQ=255) cGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCtt < 1:2253649/100‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGGAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCtt > 1:2968380/1‑100 (MQ=255) ggCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTa > 2:2585460/1‑100 (MQ=255) ggCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTa > 2:569033/1‑100 (MQ=255) gCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAg > 2:3469656/1‑100 (MQ=255) gCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAg < 2:1940231/100‑1 (MQ=255) caccaggcttaagcgagaagcactcggtcgatactgtgacagccgagagctttcagcgttgcggaggtggcatcccactgaatcaacggcgcatcggctt > 2:1427301‑M2/1‑1 (MQ=255) | GCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGGTAAAGTAGCCTGATGGAAATTTTCCTTAGA > NC_000913/2232666‑2232864 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |