| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1203950 | 79 (0.570) | 20 (0.160) | 9/160 | NT | 20.5% | coding (129/339 nt) | ymfM | e14 prophage; uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 1203962 | 84 (0.670) | coding (141/339 nt) | ymfM | e14 prophage; uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCA > NC_000913/1203851‑1204049 | caacgaatgactctgacgggcactccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGc < 2:2026738‑M1/9‑1 (MQ=255)caacgaatgactctgacgggcactccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaagactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGc < 1:202148‑M1/9‑1 (MQ=255)caacaaatgactctgacgggcactccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGc > 2:3715134‑M1/92‑100 (MQ=255) cgcAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCtt > 2:7826/1‑100 (MQ=255) cAACTGATTGCGCTTCCTGTTCCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTg < 1:2227739/100‑1 (MQ=255) aaCTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTg < 1:515057/99‑1 (MQ=255) cTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCag < 2:3194009/100‑1 (MQ=255) gATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCagag > 1:3616856/1‑100 (MQ=255) gcgcTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCAACAGCTTTGCAGAGTGGg < 1:2713306‑M2/100‑2 (MQ=255) cgcTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgc > 1:3361961‑M2/1‑98 (MQ=255) gcTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCacactctgcaaagct > 1:1518899‑M1/1‑85 (MQ=255) gcTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgct > 2:1376633‑M2/1‑97 (MQ=255) gcTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgct < 2:711454‑M2/100‑4 (MQ=255) gcTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgc < 1:2368017‑M2/99‑3 (MQ=255) cTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctg < 1:3137071‑M2/100‑5 (MQ=255) ttCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctgt > 2:808093‑M2/1‑95 (MQ=255) tCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtg > 2:752488‑M2/1‑94 (MQ=255) cactccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTggg > 1:2612387‑M1/72‑100 (MQ=255) cTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACATGGAAATTGTAACCCACAGCccactctgcaaagctgtggg < 2:1946653‑M1/100‑21 (MQ=255) cTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCccactctgcaaagctgtggg < 2:1418076‑M1/100‑21 (MQ=255) cTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtggg > 2:2059595‑M2/1‑92 (MQ=255) cTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtggg > 2:2075547‑M2/1‑92 (MQ=255) cTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtggg < 2:3112652‑M2/100‑9 (MQ=255) cTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGAGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtgg < 1:661746‑M2/99‑8 (MQ=255) tttacCTGGTTGAAAAGTGAATGTGGAAGATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCccactctgcaaagctgtggg < 1:908987‑M1/97‑21 (MQ=255) tGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCccactctgcaaagctgtgggt < 1:592253‑M1/100‑22 (MQ=255) actccgtagtgatctttgaaccagcggttaatttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTggg > 1:634818‑M1/71‑99 (MQ=255) actccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGt > 1:3769240‑M1/71‑100 (MQ=255) ctccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTg > 1:3425111‑M1/70‑100 (MQ=255) aCCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCTGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGAt < 1:3329929/100‑1 (MQ=255) aCCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCccactctgcaaagctgtgggttac < 1:2008154‑M1/100‑25 (MQ=255) aCCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGAt < 2:1352906/100‑1 (MQ=255) cgtagtgatctttgaaccagcgtttaacttgtcgtaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGAt > 1:1303494‑M1/67‑99 (MQ=255) tattgatctttgaaccagcggttaacttttcgcaaagtactgtctccttctgtcggttgaaatcACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGAt > 2:2530926‑M1/65‑97 (MQ=255) gggTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGTTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCccactctgcaaagctgtgggttacaa < 1:3261553‑M1/99‑27 (MQ=255) gggTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTc < 2:3726802/100‑1 (MQ=255) ggTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCa < 1:17450/100‑1 (MQ=255) ggTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGACTGTGGGTGATTTCa < 1:2550795/100‑1 (MQ=255) agtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCa > 2:19154‑M1/64‑100 (MQ=255) gTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAAGTGTAACCCACAGCccactctgcaaagctgtgggttacaattt < 1:1562104‑M1/100‑30 (MQ=255) tGGAAAGGGGAAGCTGGAATTTTGCTAGGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAATCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGAttt < 2:304390/96‑1 (MQ=255) tGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGTGCTGTGTGTGATTTCAAc > 1:3704013/1‑100 (MQ=255) ggAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAAcc > 2:2832723/1‑100 (MQ=255) ggAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAAcc < 1:311211/100‑1 (MQ=255) ggAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAAcc < 1:3381538/100‑1 (MQ=255) gAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAAcc < 1:400022/99‑1 (MQ=255) aaaaGCGCAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCgg > 2:746130/1‑100 (MQ=255) aaaaGCGAAGGTGGAATATTGCAATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCg < 2:3308901/99‑1 (MQ=255) aaaGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGc < 1:2497160/100‑1 (MQ=255) gCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGa > 1:447461/1‑100 (MQ=255) cGAAGTTTGAATATTGCTATGCAATGAATATACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCGACAGATTTGAAGAGTGGACTGTGGATGATTTGAACCGGCAGaa > 2:1529811/1‑100 (MQ=255) cGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGaa > 1:2059133/1‑100 (MQ=255) gTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGgaga > 1:355460/1‑100 (MQ=255) gTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGgaga > 2:2658551/1‑100 (MQ=255) gTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGgag < 2:235805/99‑1 (MQ=255) ggAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACa > 1:1183181/1‑100 (MQ=255) tATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAATCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCg < 1:1448826/100‑1 (MQ=255) tATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCg > 2:3684832/1‑100 (MQ=255) aTGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGa > 2:396209/1‑100 (MQ=255) aTGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGa > 1:3246610/1‑100 (MQ=255) gCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGTGCTGTGGGTGATGTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACa < 2:1516445/100‑1 (MQ=255) aGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAg > 2:2754609/1‑100 (MQ=255) aaTGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTaa < 1:849556/100‑1 (MQ=255) aaTGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTaa > 1:831588/1‑100 (MQ=255) tACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGc > 2:1288713/1‑100 (MQ=255) aCCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCt > 2:930074/1‑100 (MQ=255) aCAGGGAAATTGTAACCAACAGCTTGGTAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCaa < 2:1965236/99‑1 (MQ=255) cAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGTTTTGGCTGTGGGTTATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAg < 1:2327077/100‑1 (MQ=255) cAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAg > 2:1769027/1‑100 (MQ=255) ggAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATc < 1:3159408/100‑1 (MQ=255) ggAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATc < 2:3535969/100‑1 (MQ=255) ggAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATc < 1:754105/100‑1 (MQ=255) ggAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATc > 2:1045526/1‑100 (MQ=255) gAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTTATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCa < 1:1086820/100‑1 (MQ=255) gAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCa > 2:3453307/1‑100 (MQ=255) gAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCa < 2:2301389/100‑1 (MQ=255) aaaTTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtgggttacaatttccctgtcacctggtacattcactgcatagcaatattccaccttcgcttttccac < 2:2468593‑M2/100‑72 (MQ=255) aaaTTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtgggttacaatttccctgtcacctggtacattcactgcatagcaatattccaccttcgcttttccac < 1:2744344‑M2/100‑72 (MQ=255) aTTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtgggttacaatttccctgtcacctggtacattcactgcatagcaatattccaccttcgcttttccaccc < 2:1058955‑M2/100‑74 (MQ=255) 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aCCCACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtgggttacaatttccctgtcacctggtacattcactgcatagcaatattccaccttcgcttttcaacccggtaca < 1:2879379‑M2/100‑80 (MQ=255) cccACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtgggttacaatttccctgtcacctggtacattcactgcatagcaatcttccacattcacttttcaaccaggtaaa < 1:908987‑M2/99‑80 (MQ=255) cccACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtgggttacaatttccctgtcacctggtacattcactgcatagcaatattccaccttcgcttttccacccggtacag < 2:2930783‑M2/100‑81 (MQ=255) cccACAGCTTTGCAGAGTGGgctgtgggttacaatttccctgtcacctggcacattcactgcatagcaatattccaccttcgcttttccacccggtacag < 2:482981‑M2/100‑81 (MQ=255) CACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGcc > 1:2854301‑M1/1‑100 (MQ=255) CACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGcc < 2:670650‑M1/100‑1 (MQ=255) CACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGcc > 1:722590‑M1/1‑100 (MQ=255) acaGCccactctgcaaagctgtgggttacaatttccctgtcacctggtacattcactgcatagcaatattccaccttcgcttttccacccggtacaggaa < 1:200332‑M1/100‑96 (MQ=255) ACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGccc > 1:1455304‑M1/1‑100 (MQ=255) gCccactctgcaaagctgtgggttacaatttccctgtcacctggtacattcactgcatagcaatattccaccttcgcttttccacccggtacaggaagcg > 2:3722467‑M1/1‑2 (MQ=255) gCccactctgcaaagctgtgggttacaatttccctgtcacctggtacattcactgcatagcaatattccaccttcgcttttccacccggtacaggaagcg > 2:3025745‑M1/1‑2 (MQ=255) GCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTc < 2:2890102‑M1/100‑1 (MQ=255) cccactctgcaaagctgtgggttacaatttccctgtcacctggtacattcactgcatagcaatattccaccttcgcttttccacccggtacaggaagcgc < 1:3025772‑M1/100‑100 (MQ=255) CTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCa > 1:1015261‑M1/1‑100 (MQ=255) | CTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCA > NC_000913/1203851‑1204049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |