| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3313290 | NA (NA) | 12 (0.090) | 6/164 | NT | NA | noncoding (39/77 nt) | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3313328 | NA (NA) | noncoding (77/77 nt) | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
TTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCG > NC_000913/3313229‑3313426 | tttCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGG > 2:3460415‑M2/1‑100 (MQ=255)tttCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGG > 2:610028‑M2/1‑100 (MQ=255) cAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAc > 2:2195397/1‑100 (MQ=255) ggTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGCTAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCCTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAccc > 2:3268585/1‑100 (MQ=255) ggTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAccc < 1:3836068/100‑1 (MQ=255) aaGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCTCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTaaaa < 1:3438674/100‑1 (MQ=255) ggCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGTGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAAcc < 1:1198383/100‑1 (MQ=255) ggCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAAcc < 2:877390/100‑1 (MQ=255) ggCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAAcc < 2:711056/100‑1 (MQ=255) tGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGTCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTa < 1:1015950/100‑1 (MQ=255) tGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTa > 2:3743918/1‑100 (MQ=255) tGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTa < 2:471722/100‑1 (MQ=255) ttCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAg < 1:2261858/100‑1 (MQ=255) ttCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATAAAAAAATAAAAACCTTAAg < 2:2962603/100‑1 (MQ=25) cACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCa > 2:3496642/1‑100 (MQ=255) cACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCa > 1:3680769/1‑100 (MQ=255) aCGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCaa > 2:3858966/1‑100 (MQ=255) tccgatcttGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAAt < 2:1165099/92‑1 (MQ=255) cGTTGACCTGATAAGACTCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAAt < 1:2135814/100‑1 (MQ=255) cGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAAt > 1:1619223/1‑100 (MQ=255) tGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCATATCAGGCAATCCATGTCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGt < 1:1169218/100‑1 (MQ=255) gACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTa < 2:3807836/100‑1 (MQ=255) cTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGt > 1:3738491/1‑100 (MQ=255) gATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTg < 2:74365/100‑1 (MQ=255) gATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTg < 1:3401500/100‑1 (MQ=255) gATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTg > 1:299597/1‑100 (MQ=255) aaGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAt > 2:2889681/1‑100 (MQ=255) aaGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAt > 1:2494731/1‑100 (MQ=255) gACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAtct > 1:3653699/1‑100 (MQ=255) cgcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgat > 1:575833/1‑100 (MQ=255) cgcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCga < 1:1397914/99‑1 (MQ=255) ccAGCCTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgatg < 2:3680730/99‑1 (MQ=255) aGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGAtt > 1:1661362/1‑100 (MQ=255) cGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTc > 2:1291660/1‑100 (MQ=255) gTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCg < 2:1615343/100‑1 (MQ=255) gTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCg < 2:389577/100‑1 (MQ=255) gTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCg > 1:417982/1‑100 (MQ=255) tCACATCATGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTATACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGAttt < 1:2075596/97‑1 (MQ=255) tCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGa < 2:2041675/100‑1 (MQ=255) tCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTAGCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGa < 2:2755004/100‑1 (MQ=255) acaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAAt < 1:3796284/100‑1 (MQ=255) tCAGCCAATCCATGCCGGATGCAACGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTCAAGCAATGGTTCGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACt > 2:686418/1‑100 (MQ=255) cAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACtt < 1:2817758/100‑1 (MQ=255) aGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTATACGCCTTATCTCGTATGGAATCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTc < 1:158475/100‑1 (MQ=255) ggCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCg > 2:1788199/1‑100 (MQ=255) ggCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCg > 2:725948/1‑100 (MQ=255) gCAATCCATGCCTGATGCAGCGTAAACGTCTTATCTCTCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCg < 1:1540214/99‑1 (MQ=255) cAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacct < 1:1710042‑M2/100‑59 (MQ=255) aaTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 1:1773944/100‑1 (MQ=255) aTCCATGCCGGATGCAGCGTAATCGCGTTATCCCTCATGGAACCCTAAATACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 1:603409/99‑1 (MQ=255) aTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatatgacgctggagcgtcttatcaggtcaacgtaaacagcccttccacctga < 1:837701‑M2/100‑61 (MQ=255) aTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATca < 1:1505503/100‑1 (MQ=255) aTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATca < 1:1642582/100‑1 (MQ=255) tCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGCTTTCGAATACTTCGATcac > 2:962039/1‑100 (MQ=255) ccATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaa < 1:2413212‑M2/100‑63 (MQ=255) ccATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATcaca < 1:633936/100‑1 (MQ=255) tGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCg > 1:3760841/1‑100 (MQ=255) cGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGCACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTTTATCACATCGCCa > 1:2102171/1‑100 (MQ=255) tGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGc < 1:2714349/100‑1 (MQ=255) aGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCg > 2:1946836/1‑98 (MQ=255) gCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGa > 2:3368915/1‑99 (MQ=255) gCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAc < 1:2067833/100‑1 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATGTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAc > 2:2059132/1‑98 (MQ=255) tAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAcgtc > 1:3176921/1‑100 (MQ=255) aaCGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAcgtcgt < 1:3702215/100‑1 (MQ=255) aCGTCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAcgtcgt < 1:1623897/99‑1 (MQ=255) aCGCCTTATCCCGCATGGAACACTAAAAACCTTAAGAAATGGTACGTTGGATCTCGATGATATCGAATACTTCGATCAAATCGGCAGGGCAGaagcagtt > 2:2287519/1‑93 (MQ=255) cgtcTTTTCCCGCATGGAATCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATTATTTCGAATACTTCGATCATTTCGCCAGTGCGGACGTCGTTg < 2:1342209/97‑1 (MQ=255) cGCCTTATCCCGCATGGAACCCTATAAACCTTAAGCATTGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTg < 1:1306499/100‑1 (MQ=255) cGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTg < 2:1524773/100‑1 (MQ=255) cGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTg > 1:3070948/1‑100 (MQ=255) cGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTg < 2:137954/100‑1 (MQ=255) ccTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGt < 1:1870845/99‑1 (MQ=255) ccTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATAGCCAGTGCGGCCGTCGTTGTa > 2:632571/1‑100 (MQ=255) cTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAg < 2:1799407/100‑1 (MQ=255) tATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTa > 2:3140457/1‑97 (MQ=255) tATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGtt < 1:1819032/100‑1 (MQ=255) tATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGtt < 2:24565/100‑1 (MQ=255) aTCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAATCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTc < 2:558356/100‑1 (MQ=255) aTCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGTATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTc < 2:2132168/100‑1 (MQ=255) tCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCt < 1:195535/100‑1 (MQ=255) cccGCATGGAATCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCtt < 2:1017105/100‑1 (MQ=255) cccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCt < 2:3070920/99‑1 (MQ=255) cccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATAACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCtt > 1:1097917/1‑100 (MQ=255) ccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTa < 1:943886/100‑1 (MQ=255) gCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagcccctttt > 1:2530907‑M2/1‑6 (MQ=255) cATGTattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaatatgggctgttagccccttttt > 2:3311538‑M2/1‑5 (MQ=255) cATGGAACCCTAATTACCTTAAACAATGGTACGTTGGATGTGGATGTTTCCGAATAGTTCGGTCACATCGCTAGTGCGGACGACGTTGTAgctg < 2:2794460/94‑4 (MQ=255) cATGGAACCCTAAAAGCCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGCTCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACg < 2:2402994/100‑1 (MQ=255) cATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACg < 2:2484377/100‑1 (MQ=255) aTGGattgcctgatgtgacactggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccccctgaaattaactttaaaaaggggctaacagcccctttttt < 2:3654366‑M2/100‑97 (MQ=255) aTGCAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGTATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGTCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTATCg < 2:2359652/99‑1 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctgttagcccctttttca > 1:2649568‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctgttagcccctttttaa > 1:358791‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctgttagcccctttttaa > 1:1182488‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 2:402877‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 1:33198‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGcc > 2:259666/1‑100 (MQ=255) ggattgcctgatgtgacgctggcgtgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 1:1675900‑M2/1‑2 (MQ=255) ggAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCg > 1:354777/1‑100 (MQ=255) | TTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCG > NC_000913/3313229‑3313426 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |