| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4636330 | 135 (0.860) | 10 (0.070) | 9/164 | NT | 6.6% | coding (324/690 nt) | creB | response regulator in two‑component regulatory system with CreC |
| ? | NC_000913 | = 4636367 | 157 (1.090) | coding (361/690 nt) | creB | response regulator in two‑component regulatory system with CreC | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAA > NC_000913/4636231‑4636429 | ttACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCAcccc < 1:3901511/100‑1 (MQ=255) tACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCcg > 1:3261697/1‑100 (MQ=255) aCCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCcgc < 1:1140484/100‑1 (MQ=255) ccTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCcgcg > 2:1439685/1‑100 (MQ=255) tGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGaa > 1:3331935/1‑100 (MQ=255) gTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGCTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAg < 1:2415191/100‑1 (MQ=255) aCTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAAGTGGTGCTGACGACGACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAgtg < 2:313380/100‑1 (MQ=255) cTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAgtg < 2:3545577/99‑1 (MQ=255) tGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCT‑AACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTgc > 1:3112753/1‑100 (MQ=255) ttCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTgcg < 2:2168367/100‑1 (MQ=255) ttCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTgcg < 1:2707776/100‑1 (MQ=255) tCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTgcgc > 1:1670922/1‑100 (MQ=255) cTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCa > 1:2616597/1‑100 (MQ=255) cTGACGGCACGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCGGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCAACCCGCGTAGTGTGCGCCa > 1:2459496/1‑100 (MQ=255) gACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAgg < 2:2927696/100‑1 (MQ=255) aCGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAggg < 2:2070212/100‑1 (MQ=255) aCGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAggg < 2:3198697/100‑1 (MQ=255) cGGCCCGATGTGAAGAGTGCGGTCGCCTGCTTGGGCTGGAATTTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCCAAgtg < 1:3324447/89‑1 (MQ=255) cGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGt > 2:1600424/1‑100 (MQ=255) cGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGt > 2:1276609/1‑100 (MQ=255) ggCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTg < 1:2920727/100‑1 (MQ=255) gCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTgc < 2:2597918/100‑1 (MQ=255) ccGAAGTGAAGAGGGCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTg > 1:1354608/1‑97 (MQ=255) aaGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCAcc < 2:2863488/100‑1 (MQ=255) aGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCcgcgaagtgtgcgcaccctggcgcacac < 2:2343136‑M1/100‑29 (MQ=255) gTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCtt < 2:1804912/100‑1 (MQ=255) tGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTa > 2:2107540/1‑100 (MQ=255) gAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTAc > 1:3807632/1‑100 (MQ=255) gAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTAc > 1:538360/1‑100 (MQ=255) aaGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACt < 1:3038004/100‑1 (MQ=255) agagGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTg < 1:3548501/100‑1 (MQ=255) agagGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTg < 2:624432/100‑1 (MQ=255) agagGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTg > 1:454326/1‑100 (MQ=255) tCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCg < 1:767615‑M2/100‑2 (MQ=255) gATCGCCTGCTTGGGCTGGAAAGTGGTGCTGACGACTACGGGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCggg > 1:2078040‑M2/1‑97 (MQ=255) cGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTTAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtga > 1:2049086‑M2/1‑94 (MQ=255) cGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtga < 2:1928885‑M1/100‑44 (MQ=255) gcatGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTgaa > 1:3502457/4‑100 (MQ=255) gCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaa < 1:2964245‑M2/100‑8 (MQ=255) gCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaa < 2:2391536‑M2/100‑8 (MQ=255) cTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGCGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCCTCGGGTgaaga < 1:2316623/100‑1 (MQ=255) tGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaac < 1:332175‑M1/100‑48 (MQ=255) gCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGaagaag < 1:3674712/100‑1 (MQ=255) gCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGaagaag < 2:3966014/100‑1 (MQ=255) tGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaacggtt < 1:2621396‑M1/100‑52 (MQ=255) gggCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCATTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTtct < 1:1846212/100‑1 (MQ=255) gCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGGGAAGAAGTTCTCg > 1:416020/1‑100 (MQ=255) cTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGa > 2:4243165/1‑100 (MQ=255) ggAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACg < 1:805405/100‑1 (MQ=255) ggAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTCTTCACCCgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaacggtttagcca < 1:3193201‑M1/100‑58 (MQ=255) aaTTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCg < 2:403635/100‑1 (MQ=255) ttGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCACGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGtc < 1:1970636/100‑1 (MQ=255) tGGTGCTGACGACTACGTTGCTAAACCGTTTTCACTCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGtct < 2:894403/100‑1 (MQ=255) gTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTcc > 2:1710209/1‑100 (MQ=255) gTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGAGTAGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGtctc > 1:2624995/1‑99 (MQ=255) gCTGACGGCGATGTGGCGAAACCGTTTGCACCTCCCGAAGTGTGCGCTAGTGCCCGCGGCTCACCGCCTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTcc < 1:4073189/98‑1 (MQ=255) cTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTcc > 1:1782958/1‑97 (MQ=255) cTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGt > 2:3425057/1‑100 (MQ=255) tGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGACTCCCg > 1:22529/1‑98 (MQ=255) cgacTACGTGGCTAACCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATc < 1:993743/100‑1 (MQ=255) cgacTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGGAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcac < 1:3392731‑M2/100‑36 (MQ=255) cgacTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGTGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATc < 1:887655/100‑1 (MQ=255) cgacTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATc < 2:1061169/100‑1 (MQ=255) gacTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATcc > 2:71264/1‑100 (MQ=255) ncTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCg > 2:2017868/2‑100 (MQ=255) tACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGt > 2:4134862/1‑99 (MQ=255) aCGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTAt > 2:3560779/1‑100 (MQ=255) aCGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTAt > 1:678363/1‑100 (MQ=255) tGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTgg < 2:1952157/100‑1 (MQ=255) ggCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCATACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGa > 1:2452913/1‑100 (MQ=255) cTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACa > 1:1295031/1‑100 (MQ=255) cTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACa > 1:2159518/1‑100 (MQ=255) tAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcc < 2:522197‑M2/100‑48 (MQ=255) aaaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAtt > 1:901117/1‑100 (MQ=255) aaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAttt > 2:3271580/1‑100 (MQ=255) aaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAttt > 2:2225061/1‑100 (MQ=255) aCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAtttt > 2:3587573/1‑100 (MQ=255) ngtTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccgatttccagcccaagc < 2:4341336‑M2/99‑53 (MQ=255) cGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagc < 2:2809536‑M2/100‑53 (MQ=255) cGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttga > 1:2799816/1‑100 (MQ=255) tCACCCgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcg > 2:2828930‑M1/1‑6 (MQ=255) tCACCCgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggc < 1:2237780‑M1/99‑94 (MQ=255) tCACCCgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcgcggtgaaaacggtttagccacgtagacgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcg > 1:3319625‑M1/1‑6 (MQ=255) cACCCgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcga > 1:37569‑M1/1‑5 (MQ=255) cACCCgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcga > 1:4040500‑M1/1‑5 (MQ=255) cACCCgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcga > 1:4041319‑M1/1‑5 (MQ=255) cACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttgaattgaa > 2:2686720/1‑100 (MQ=255) cACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttgaattgaa < 1:39198/100‑1 (MQ=255) aCCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTtgaattgaat < 1:155364/100‑1 (MQ=255) aCCCCGCGAAGTGTGCGACAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTtgaattgaat < 1:1644151/100‑1 (MQ=255) aCCCCGCGAAGTGTGAGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTtgaattgaat < 2:4337097/100‑1 (MQ=255) cccgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcgatc > 1:973729‑M1/1‑3 (MQ=255) ccccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaaaacggtttagccccgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcgatc < 1:29211‑M2/100‑61 (MQ=255) ccccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTtgaattgaat < 1:836814/99‑1 (MQ=255) ccgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgctgggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcgatcg < 1:2393930‑M1/100‑99 (MQ=255) ccgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcgatcg < 2:678462‑M1/100‑99 (MQ=255) ccgacgcagtaaggtgcgcaccctggcgcacacttcgcggggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcgatcg > 2:857655‑M1/1‑2 (MQ=255) cccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATtgaatga > 1:1052161/1‑100 (MQ=255) cccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATtgaatga > 1:430220/1‑100 (MQ=255) cccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGAGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATtgaatga > 2:3738096/1‑100 (MQ=255) | GTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAA > NC_000913/4636231‑4636429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |